105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I2719 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007651  BTH_I2719  pathogenesis-related protein  100 
 
 		 639 aa  1310    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1438  pathogenesis-related protein  45.88 
 
 		 650 aa  532  1e-150  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0692667  normal  0.776822 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5468  pathogenesis-related protein  46.99 
 
 		 639 aa  535  1e-150  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2418  putative ATP-dependent DNA helicase  40.5 
 
 		 622 aa  470  1.0000000000000001e-131  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.197345  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3888  hypothetical protein  35.33 
 
 		 631 aa  317  6e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.450074  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1801  hypothetical protein  34.74 
 
 		 625 aa  306  7e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3656  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  32.41 
 
 		 637 aa  298  2e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.317383  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4906  pathogenesis-related protein  33.78 
 
 		 649 aa  297  3e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.827624  normal  0.119775 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6475  hypothetical protein  32.19 
 
 		 628 aa  288  2e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.574703  normal  0.963014 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4220  hypothetical protein  32.41 
 
 		 628 aa  286  5.999999999999999e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0295  hypothetical protein  31.49 
 
 		 629 aa  278  2e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0199144 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60080  hypothetical protein  31.78 
 
 		 643 aa  268  2e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000581559  hitchhiker  0.0000000248833 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4971  DNA helicase II  29.98 
 
 		 585 aa  202  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00146307 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2792  DNA helicase II  29.98 
 
 		 585 aa  202  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.336571 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0207  hypothetical protein  26.56 
 
 		 578 aa  148  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2850  hypothetical protein  27.05 
 
 		 579 aa  139  2e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3806  DNA helicase II  27.56 
 
 		 588 aa  138  3.0000000000000003e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.939631  normal  0.105898 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0682  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  25.38 
 
 		 634 aa  131  4.0000000000000003e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0002  UvrD/REP helicase  22.37 
 
 		 627 aa  125  2e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00501949  unclonable  0.0000000152261 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003290  DNA helicase  26.34 
 
 		 634 aa  96.7  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0596  hypothetical protein  22.85 
 
 		 707 aa  75.9  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0348  DNA helicase  21.44 
 
 		 698 aa  67  0.0000000009  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00900686  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0754  ATP-dependent DNA helicase Rep  28.79 
 
 		 587 aa  63.9  0.000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.643559  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1397  UvrD/REP helicase  20.76 
 
 		 625 aa  58.9  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.477297  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2919  UvrD/REP helicase  26.05 
 
 		 621 aa  54.7  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0050  ATP-dependent DNA helicase Rep  23.13 
 
 		 658 aa  53.5  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0153579  normal  0.502615 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2573  hypothetical protein  26.78 
 
 		 260 aa  52.8  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000474072  normal  0.0702383 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5487  putative ATP-dependent DNA helicase Rep  25.32 
 
 		 591 aa  52.8  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3743  UvrD/REP helicase  27.56 
 
 		 702 aa  52.8  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0471553  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1037  DNA-dependent helicase II  24.16 
 
 		 726 aa  52.4  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3374  ATP-dependent DNA helicase Rep  24.54 
 
 		 671 aa  51.6  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.654782  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2224  UvrD/REP helicase  27.44 
 
 		 659 aa  51.2  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3744  UvrD/REP helicase  25.1 
 
 		 1124 aa  50.4  0.00009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.183659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0719  ATP-dependent DNA helicase Rep  24.28 
 
 		 670 aa  50.4  0.0001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4241  UvrD/REP helicase  42.5 
 
 		 907 aa  50.1  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000158675 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2965  UvrD/REP helicase  23.87 
 
 		 682 aa  50.4  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.460273  normal  0.889017 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71870  DNA-dependent helicase II  25.55 
 
 		 728 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.186903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0813  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.57 
 
 		 830 aa  49.3  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00156939  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0721  UvrD/REP helicase  23.89 
 
 		 656 aa  49.7  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2115  UvrD/REP helicase  22.71 
 
 		 616 aa  49.7  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00449221  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5260  DNA-dependent helicase II  25.31 
 
 		 728 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.658271 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2233  ATP-dependent DNA helicase  23.66 
 
 		 658 aa  48.9  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2143  ATP-dependent DNA helicase Rep  24.01 
 
 		 658 aa  48.5  0.0003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0241  UvrD/REP helicase  20.42 
 
 		 706 aa  48.9  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1219  UvrD/REP helicase  24.52 
 
 		 706 aa  48.9  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.868419  normal  0.377243 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0964  UvrD/REP helicase  21.25 
 
 		 735 aa  48.9  0.0003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3473  ATP-dependent DNA helicase Rep  23.93 
 
 		 669 aa  48.5  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.406551 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0990  UvrD/REP helicase  23.36 
 
 		 674 aa  47.8  0.0006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.771752  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0930  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.97 
 
 		 837 aa  47.8  0.0006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5352  DNA-dependent helicase II  25.16 
 
 		 728 aa  47.8  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.138491 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0795  UvrD/REP helicase  21.28 
 
 		 639 aa  46.6  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.790736  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0683  UvrD/REP helicase  23.9 
 
 		 669 aa  47.4  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0849  UvrD/REP helicase  21.99 
 
 		 845 aa  46.6  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.462782  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09040  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.08 
 
 		 932 aa  47  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001978  ATP-dependent DNA helicase Rep  22.3 
 
 		 671 aa  46.6  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0682973  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2002  UvrD/REP helicase  22.34 
 
 		 668 aa  46.2  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0486961  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5644  DNA-dependent helicase II  23.67 
 
 		 727 aa  46.2  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0598838 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2961  ATP-dependent DNA helicase  23.96 
 
 		 678 aa  46.6  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.26035  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0061  UvrD/REP helicase  37.18 
 
 		 946 aa  46.2  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.147591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6233  DNA-dependent helicase II  25.24 
 
 		 728 aa  46.6  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80471  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00483  ATP-dependent DNA helicase  23.13 
 
 		 671 aa  45.8  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1841  UvrD/REP helicase  37.18 
 
 		 946 aa  46.2  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.716843  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5401  DNA-dependent helicase II  25.16 
 
 		 728 aa  46.2  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0541595 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3456  UvrD/REP helicase  26.04 
 
 		 671 aa  45.8  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0625  UvrD/REP helicase  24.03 
 
 		 1019 aa  46.2  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.243128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3520  UvrD/REP helicase  26.04 
 
 		 671 aa  45.8  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5065  DNA-dependent helicase II  25.35 
 
 		 727 aa  45.4  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2537  UvrD/REP helicase  21.29 
 
 		 672 aa  45.4  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.423083  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3376  UvrD/REP helicase  26.06 
 
 		 659 aa  45.8  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5987  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.17 
 
 		 851 aa  45.4  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0573497  normal  0.0186357 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0286  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.62 
 
 		 747 aa  45.4  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5130  DNA-dependent helicase II  25.47 
 
 		 729 aa  45.4  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.228367 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03620  ATP-dependent DNA helicase Rep  22.34 
 
 		 640 aa  45.4  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0373  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25 
 
 		 785 aa  45.8  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0675  UvrD/REP helicase  38.55 
 
 		 599 aa  45.1  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.771705 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4969  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.73 
 
 		 753 aa  45.1  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1337  ATP-dependent DNA helicase UvrD  26.48 
 
 		 783 aa  44.7  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4600  UvrD/REP helicase  23.05 
 
 		 758 aa  44.7  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000134986  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0351  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.73 
 
 		 753 aa  45.1  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8359  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  23.87 
 
 		 689 aa  44.7  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.364158  normal  0.650565 
 
 
-
 
NC_002950  PG1038  ATP-dependent DNA helicase UvrD/PcrA/Rep family  22.92 
 
 		 765 aa  44.3  0.006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000499777 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0275  ATP-dependent DNA helicase  25.73 
 
 		 753 aa  44.3  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0278  ATP-dependent DNA helicase  25.73 
 
 		 751 aa  44.3  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0825  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.19 
 
 		 694 aa  44.7  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0104  UvrD/REP helicase  25.53 
 
 		 797 aa  44.3  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0377  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.73 
 
 		 751 aa  44.3  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0336  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.73 
 
 		 751 aa  44.3  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0115  UvrD/REP helicase  25.53 
 
 		 797 aa  44.3  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47860  ATP-dependent DNA helicase Rep protein  22.11 
 
 		 669 aa  44.7  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0334  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.73 
 
 		 747 aa  44.3  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2014  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.42 
 
 		 729 aa  44.3  0.007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2052  UvrD/REP helicase  23.89 
 
 		 726 aa  44.3  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.322566  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0092  ATP-dependent DNA helicase rep  23.49 
 
 		 671 aa  44.3  0.007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.157816  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00520  DNA-dependent helicase II  26.57 
 
 		 726 aa  44.3  0.007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.851543  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0453  UvrD/REP helicase  24.29 
 
 		 681 aa  44.3  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.611277  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0971  UvrD/REP helicase  20.46 
 
 		 668 aa  44.3  0.008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0211694  normal  0.301959 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0647  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.98 
 
 		 838 aa  43.9  0.009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0160292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2246  ATP-dependent DNA helicase PcrA  22.49 
 
 		 751 aa  43.9  0.009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.453558  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0968  UvrD/REP helicase  20.28 
 
 		 706 aa  43.9  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1824  UvrD/REP helicase  21.13 
 
 		 679 aa  43.9  0.009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000550793  unclonable  0.00000000134855 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>