More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A1801 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6475  hypothetical protein  64.16 
 
 		 628 aa  823    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.574703  normal  0.963014 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1801  hypothetical protein  100 
 
 		 625 aa  1269    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3888  hypothetical protein  52.88 
 
 		 631 aa  640    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.450074  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0295  hypothetical protein  49.6 
 
 		 629 aa  605  9.999999999999999e-173  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0199144 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3656  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  43.6 
 
 		 637 aa  543  1e-153  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.317383  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4220  hypothetical protein  45.28 
 
 		 628 aa  541  9.999999999999999e-153  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60080  hypothetical protein  43.12 
 
 		 643 aa  520  1e-146  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000581559  hitchhiker  0.0000000248833 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5468  pathogenesis-related protein  33.8 
 
 		 639 aa  322  1.9999999999999998e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2719  pathogenesis-related protein  34.74 
 
 		 639 aa  291  2e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1438  pathogenesis-related protein  32.17 
 
 		 650 aa  285  3.0000000000000004e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0692667  normal  0.776822 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2418  putative ATP-dependent DNA helicase  30.4 
 
 		 622 aa  278  2e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.197345  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2792  DNA helicase II  33.76 
 
 		 585 aa  257  6e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.336571 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4971  DNA helicase II  33.76 
 
 		 585 aa  257  6e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00146307 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4906  pathogenesis-related protein  28.97 
 
 		 649 aa  207  3e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.827624  normal  0.119775 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0207  hypothetical protein  32.01 
 
 		 578 aa  200  5e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2850  hypothetical protein  28.53 
 
 		 579 aa  182  2e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3806  DNA helicase II  27.8 
 
 		 588 aa  166  2.0000000000000002e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.939631  normal  0.105898 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0682  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  25.08 
 
 		 634 aa  137  8e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0002  UvrD/REP helicase  28.45 
 
 		 627 aa  131  4.0000000000000003e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00501949  unclonable  0.0000000152261 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003290  DNA helicase  31.01 
 
 		 634 aa  123  9e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0596  hypothetical protein  23.74 
 
 		 707 aa  104  4e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1219  UvrD/REP helicase  31.06 
 
 		 706 aa  78.6  0.0000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.868419  normal  0.377243 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1937  UvrD/REP helicase  28.11 
 
 		 726 aa  77.4  0.0000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3411  ATP-dependent DNA helicase PcrA, putative  29.08 
 
 		 739 aa  68.6  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl566  repair endonuclease ATP-dependent DNA helicase  27.11 
 
 		 723 aa  68.6  0.0000000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000546872  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0085  UvrD/REP helicase  22.65 
 
 		 1016 aa  67.8  0.0000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.60174  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1021  UvrD/REP helicase  26.62 
 
 		 783 aa  67.4  0.0000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.751613  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02290  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.73 
 
 		 715 aa  67.4  0.0000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000712312  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09040  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.58 
 
 		 932 aa  67  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2812  UvrD/REP helicase  26.77 
 
 		 719 aa  66.2  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1786  UvrD/REP helicase  27.18 
 
 		 753 aa  65.1  0.000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.150063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3520  UvrD/REP helicase  29.33 
 
 		 671 aa  64.7  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3456  UvrD/REP helicase  29.33 
 
 		 671 aa  64.7  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4207  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.87 
 
 		 794 aa  64.3  0.000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00114882 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28 
 
 		 762 aa  63.9  0.000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.352093 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.49 
 
 		 742 aa  63.5  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0413312  decreased coverage  0.000000100763 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3374  ATP-dependent DNA helicase Rep  28.98 
 
 		 671 aa  63.5  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.654782  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6513  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.01 
 
 		 781 aa  62.8  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0982  UvrD/REP helicase  29.18 
 
 		 731 aa  63.2  0.00000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.158215  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16340  DNA/RNA helicase, superfamily I  26.65 
 
 		 772 aa  61.6  0.00000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0144318 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2246  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.02 
 
 		 751 aa  62  0.00000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.453558  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0071  UvrD/REP helicase  27.39 
 
 		 768 aa  61.6  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1633  UvrD/REP helicase  25.94 
 
 		 681 aa  60.8  0.00000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3817  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.39 
 
 		 795 aa  60.8  0.00000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.558809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0050  ATP-dependent DNA helicase Rep  29.86 
 
 		 658 aa  60.5  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0153579  normal  0.502615 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0625  UvrD/REP helicase  26 
 
 		 1019 aa  60.1  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.243128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0184  ATP-dependent DNA helicase Rep  24.38 
 
 		 672 aa  60.1  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0241  UvrD/REP helicase  25.45 
 
 		 706 aa  60.1  0.0000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2542  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.71 
 
 		 751 aa  60.1  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10967  ATP-dependent DNA helicase II uvrD1  27.65 
 
 		 771 aa  60.1  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.227085 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04890  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.08 
 
 		 817 aa  59.7  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2813  UvrD/REP helicase  24.39 
 
 		 754 aa  60.1  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3327  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.07 
 
 		 802 aa  59.7  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1212  ATP-dependent DNA helicase UvrD  27.48 
 
 		 892 aa  59.3  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.771972  normal  0.554 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0373  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.84 
 
 		 785 aa  58.9  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0971  UvrD/REP helicase  25.62 
 
 		 668 aa  59.7  0.0000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0211694  normal  0.301959 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2254  UvrD/REP helicase  25.16 
 
 		 685 aa  59.3  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.816502  normal  0.58095 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0462  ATP-dependent DNA helicase Rep  24.04 
 
 		 672 aa  59.3  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1352  UvrD/REP helicase  26.94 
 
 		 807 aa  58.5  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0381  UvrD/REP helicase  24.79 
 
 		 688 aa  58.9  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0971471 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0964  UvrD/REP helicase  20.34 
 
 		 735 aa  58.5  0.0000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0760  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.56 
 
 		 737 aa  58.5  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3744  UvrD/REP helicase  27.23 
 
 		 1124 aa  58.2  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.183659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1416  putative ATP-dependent DNA helicase PcrA  20.95 
 
 		 664 aa  58.5  0.0000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1226  ATP-dependent DNA helicase PcrA, putative  20.95 
 
 		 664 aa  58.2  0.0000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.305357  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5987  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28 
 
 		 851 aa  58.2  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0573497  normal  0.0186357 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0038  UvrD/REP helicase  26.61 
 
 		 757 aa  57.8  0.0000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0437  UvrD/REP helicase  25.44 
 
 		 682 aa  58.2  0.0000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1508  UvrD/REP helicase  26.67 
 
 		 1060 aa  57.8  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1437  UvrD/REP helicase  24.32 
 
 		 769 aa  57.8  0.0000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.618729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2580  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25 
 
 		 754 aa  57.4  0.0000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1171  UvrD/REP helicase  25.53 
 
 		 1132 aa  57.4  0.0000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0825  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.31 
 
 		 694 aa  57.4  0.0000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2537  UvrD/REP helicase  27.86 
 
 		 672 aa  57.4  0.0000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.423083  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03230  DNA-dependent helicase II  24.92 
 
 		 728 aa  57  0.0000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0849  UvrD/REP helicase  25.61 
 
 		 845 aa  57.4  0.0000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.462782  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1516  UvrD/REP helicase  26.86 
 
 		 688 aa  57  0.0000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.200062  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1325  UvrD/REP helicase  24.85 
 
 		 678 aa  56.6  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00634324  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3807  UvrD/REP helicase  28.28 
 
 		 708 aa  56.6  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00612818 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1488  UvrD/REP helicase  24.48 
 
 		 659 aa  57  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0285  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.3 
 
 		 741 aa  56.6  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0092  helicase, UvrD/Rep family  24.65 
 
 		 666 aa  57  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0719  ATP-dependent DNA helicase Rep  23.03 
 
 		 670 aa  56.6  0.000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001978  ATP-dependent DNA helicase Rep  25.09 
 
 		 671 aa  56.6  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0682973  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0995  hypothetical protein  25.24 
 
 		 669 aa  56.2  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.123233  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0903  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.22 
 
 		 662 aa  56.2  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000149159  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0699  UvrD/Rep family helicase  24.57 
 
 		 689 aa  56.2  0.000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0453  DNA helicase II  25.41 
 
 		 735 aa  55.8  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.723252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2348  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.21 
 
 		 730 aa  55.8  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0164573  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0796  UvrD/REP helicase  24.68 
 
 		 706 aa  55.8  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.573798  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0398  UvrD/REP helicase  27.21 
 
 		 768 aa  56.2  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2007  UvrD/REP helicase  24.91 
 
 		 714 aa  55.8  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0358603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0047  ATP-dependent DNA helicase Rep  25.15 
 
 		 849 aa  56.2  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.760315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0368  superfamily I DNA/RNA helicase  27.53 
 
 		 696 aa  56.2  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1422  UvrD/REP helicase  27.83 
 
 		 1089 aa  56.2  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4295  UvrD/REP helicase  28.86 
 
 		 799 aa  55.8  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0402  UvrD/REP helicase  26.22 
 
 		 712 aa  55.5  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3947  DNA-dependent helicase II  25.17 
 
 		 730 aa  55.5  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3542  UvrD/REP helicase  27.64 
 
 		 672 aa  55.5  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.634729 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2355  UvrD/REP helicase  25.39 
 
 		 724 aa  55.5  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000607129  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>