199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3656 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3656  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  100 
 
 		 637 aa  1322    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.317383  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4220  hypothetical protein  48.66 
 
 		 628 aa  586  1e-166  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6475  hypothetical protein  45.32 
 
 		 628 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.574703  normal  0.963014 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0295  hypothetical protein  45.08 
 
 		 629 aa  567  1e-160  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0199144 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1801  hypothetical protein  43.6 
 
 		 625 aa  543  1e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3888  hypothetical protein  43.06 
 
 		 631 aa  513  1e-144  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.450074  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60080  hypothetical protein  40.56 
 
 		 643 aa  489  1e-137  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000581559  hitchhiker  0.0000000248833 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5468  pathogenesis-related protein  32.11 
 
 		 639 aa  293  7e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2719  pathogenesis-related protein  32.41 
 
 		 639 aa  287  4e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1438  pathogenesis-related protein  30.92 
 
 		 650 aa  287  5e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0692667  normal  0.776822 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2418  putative ATP-dependent DNA helicase  32.53 
 
 		 622 aa  284  3.0000000000000004e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.197345  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4971  DNA helicase II  29.94 
 
 		 585 aa  230  6e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00146307 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2792  DNA helicase II  29.94 
 
 		 585 aa  230  6e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.336571 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4906  pathogenesis-related protein  28.3 
 
 		 649 aa  200  6e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.827624  normal  0.119775 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0207  hypothetical protein  26.35 
 
 		 578 aa  167  8e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003290  DNA helicase  27.52 
 
 		 634 aa  165  3e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2850  hypothetical protein  25.57 
 
 		 579 aa  157  6e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3806  DNA helicase II  23.35 
 
 		 588 aa  147  9e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.939631  normal  0.105898 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0002  UvrD/REP helicase  34.36 
 
 		 627 aa  125  2e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00501949  unclonable  0.0000000152261 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0596  hypothetical protein  24.68 
 
 		 707 aa  125  3e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0682  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  32.06 
 
 		 634 aa  102  2e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0085  UvrD/REP helicase  24.5 
 
 		 1016 aa  72  0.00000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.60174  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0964  UvrD/REP helicase  25.61 
 
 		 735 aa  70.1  0.0000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0373  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.28 
 
 		 785 aa  66.2  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2348  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.53 
 
 		 730 aa  63.5  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0164573  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3456  UvrD/REP helicase  24.57 
 
 		 671 aa  62.4  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3520  UvrD/REP helicase  24.57 
 
 		 671 aa  62.4  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3374  ATP-dependent DNA helicase Rep  24.22 
 
 		 671 aa  61.2  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.654782  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0437  UvrD/REP helicase  25.09 
 
 		 682 aa  58.5  0.0000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02290  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.11 
 
 		 715 aa  58.9  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000712312  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2560  putative ATP-dependent DNA helicase, Rep  24.18 
 
 		 520 aa  58.9  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.742452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7808  UvrD/REP helicase  21.33 
 
 		 1134 aa  58.5  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0468  DNA-dependent helicase II  23.41 
 
 		 721 aa  57.4  0.0000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000657213  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0080  DNA-dependent helicase II  22.33 
 
 		 724 aa  56.2  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1514  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.98 
 
 		 755 aa  56.2  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0419  DNA-dependent helicase II  23.08 
 
 		 721 aa  55.8  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.590239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2876  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.46 
 
 		 741 aa  55.1  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2024  ATP-dependent DNA helicase Rep  23.32 
 
 		 814 aa  54.7  0.000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.260389  normal  0.212402 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2812  UvrD/REP helicase  24.39 
 
 		 719 aa  54.7  0.000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1043  hypothetical protein  44.26 
 
 		 109 aa  54.3  0.000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0453  UvrD/REP helicase  20.83 
 
 		 681 aa  54.3  0.000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.611277  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1021  UvrD/REP helicase  23.05 
 
 		 783 aa  53.9  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.751613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0064  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  22.65 
 
 		 689 aa  53.9  0.000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0537  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.18 
 
 		 711 aa  53.9  0.000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1443  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.73 
 
 		 729 aa  53.5  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.520259  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0982  UvrD/REP helicase  23.61 
 
 		 731 aa  53.5  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.158215  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2961  ATP-dependent DNA helicase  21.18 
 
 		 678 aa  53.5  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.26035  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1196  ATP-dependent DNA helicase PcrA  21.61 
 
 		 738 aa  52.8  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1219  UvrD/REP helicase  23.21 
 
 		 706 aa  52.4  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.868419  normal  0.377243 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0212  UvrD/REP helicase  24.5 
 
 		 677 aa  53.1  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0699  UvrD/Rep family helicase  23.62 
 
 		 689 aa  53.1  0.00002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_979  UvrD/REP helicase  21.61 
 
 		 738 aa  52.4  0.00003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1516  superfamily I DNA/RNA helicase  22.85 
 
 		 757 aa  52  0.00003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.476962 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0621  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25 
 
 		 659 aa  52.4  0.00003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.12705  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4969  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.03 
 
 		 753 aa  52  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1786  UvrD/REP helicase  23.67 
 
 		 753 aa  52  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.150063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1007  UvrD/REP helicase  21.61 
 
 		 738 aa  52.4  0.00003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1645  UvrD/REP helicase  21.64 
 
 		 606 aa  52.4  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.417198  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1445  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.57 
 
 		 757 aa  52  0.00003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.715662  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0943  UvrD/REP helicase  27.02 
 
 		 684 aa  52  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3411  ATP-dependent DNA helicase PcrA, putative  20.82 
 
 		 739 aa  51.6  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1873  UvrD/REP helicase  24.6 
 
 		 591 aa  52  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.100548  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0675  UvrD/REP helicase  25.72 
 
 		 599 aa  51.6  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.771705 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1337  UvrD/REP helicase  22.58 
 
 		 678 aa  51.6  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3201  ATP-dependent DNA helicase Rep  22.81 
 
 		 682 aa  51.2  0.00005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0351  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25 
 
 		 753 aa  51.2  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0994  superfamily I DNA/RNA helicase  24.25 
 
 		 770 aa  51.6  0.00005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03230  DNA-dependent helicase II  22.3 
 
 		 728 aa  51.2  0.00006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0462  ATP-dependent DNA helicase Rep  23.85 
 
 		 672 aa  51.2  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0096  UvrD/REP helicase  22.7 
 
 		 735 aa  51.2  0.00006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.60003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0348  DNA helicase  22.95 
 
 		 698 aa  50.8  0.00007  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00900686  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4241  UvrD/REP helicase  23.39 
 
 		 907 aa  50.8  0.00008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000158675 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3397  DNA-dependent helicase II  21.78 
 
 		 727 aa  50.8  0.00008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2542  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.07 
 
 		 751 aa  50.4  0.00009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0071  UvrD/REP helicase  24.24 
 
 		 768 aa  50.4  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1682  UvrD/REP helicase  24.16 
 
 		 743 aa  50.4  0.00009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1515  UvrD/REP helicase  26.78 
 
 		 575 aa  50.4  0.00009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0347716  hitchhiker  2.10005e-16 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1293  ATP-dependent DNA helicase Rep  22.42 
 
 		 765 aa  50.4  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0825  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.01 
 
 		 694 aa  50.1  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0421  helicase/exonuclease  23.55 
 
 		 870 aa  50.1  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0398  UvrD/REP helicase  23.08 
 
 		 768 aa  50.1  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1171  UvrD/REP helicase  23.31 
 
 		 1132 aa  50.1  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3385  DNA-dependent helicase II  22.11 
 
 		 726 aa  50.1  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0377  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.65 
 
 		 751 aa  49.7  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0334  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.61 
 
 		 747 aa  49.7  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1146  ATP-dependent DNA helicase UvrD  23.79 
 
 		 688 aa  49.3  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.36032  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0275  ATP-dependent DNA helicase  23.61 
 
 		 753 aa  49.7  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0278  ATP-dependent DNA helicase  23.61 
 
 		 751 aa  49.7  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1307  ATP-dependent DNA helicase, UvrD/REP family  23.79 
 
 		 688 aa  49.3  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000490806 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2947  UvrD/REP helicase  22.58 
 
 		 678 aa  48.9  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1239  ATP-dependent DNA helicase UvrD  23.79 
 
 		 657 aa  49.7  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0484  DNA-dependent helicase II  21.88 
 
 		 722 aa  49.7  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0336  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.61 
 
 		 751 aa  49.7  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1384  ATP-dependent DNA helicase, UvrD/REP family  23.79 
 
 		 688 aa  49.3  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00158737  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2246  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.57 
 
 		 751 aa  49.7  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.453558  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0849  UvrD/REP helicase  23.36 
 
 		 845 aa  49.3  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.462782  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2355  hypothetical protein  29.55 
 
 		 458 aa  49.7  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00483  ATP-dependent DNA helicase  24.76 
 
 		 671 aa  48.9  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0868  putative ATP-dependent DNA helicase  25.18 
 
 		 676 aa  48.9  0.0003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0285  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.96 
 
 		 741 aa  48.9  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>