More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_0002 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009637  MmarC7_0002  UvrD/REP helicase  100 
 
 		 627 aa  1256    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00501949  unclonable  0.0000000152261 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003290  DNA helicase  49.52 
 
 		 634 aa  566  1e-160  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0682  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  40.79 
 
 		 634 aa  419  1e-116  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2850  hypothetical protein  27.64 
 
 		 579 aa  191  4e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4971  DNA helicase II  31.35 
 
 		 585 aa  167  8e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00146307 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2792  DNA helicase II  31.35 
 
 		 585 aa  167  8e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.336571 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4220  hypothetical protein  26.49 
 
 		 628 aa  163  7e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5468  pathogenesis-related protein  25.41 
 
 		 639 aa  156  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6475  hypothetical protein  27.27 
 
 		 628 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.574703  normal  0.963014 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1801  hypothetical protein  28.45 
 
 		 625 aa  131  4.0000000000000003e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1438  pathogenesis-related protein  28.24 
 
 		 650 aa  128  3e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0692667  normal  0.776822 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60080  hypothetical protein  28.99 
 
 		 643 aa  127  5e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000581559  hitchhiker  0.0000000248833 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3656  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  34.36 
 
 		 637 aa  125  2e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.317383  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2418  putative ATP-dependent DNA helicase  30.41 
 
 		 622 aa  123  8e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.197345  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0295  hypothetical protein  30.65 
 
 		 629 aa  121  3e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0199144 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2719  pathogenesis-related protein  21.63 
 
 		 639 aa  120  7e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0207  hypothetical protein  29.75 
 
 		 578 aa  118  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3806  DNA helicase II  25.99 
 
 		 588 aa  116  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.939631  normal  0.105898 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3888  hypothetical protein  29.18 
 
 		 631 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.450074  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0596  hypothetical protein  29.82 
 
 		 707 aa  88.2  4e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4906  pathogenesis-related protein  24.64 
 
 		 649 aa  82.8  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.827624  normal  0.119775 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1633  UvrD/REP helicase  27.04 
 
 		 681 aa  71.2  0.00000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1873  UvrD/REP helicase  28.99 
 
 		 591 aa  70.5  0.00000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.100548  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1443  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.53 
 
 		 729 aa  70.1  0.0000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.520259  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0285  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.19 
 
 		 741 aa  70.5  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1219  UvrD/REP helicase  23.51 
 
 		 706 aa  69.3  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.868419  normal  0.377243 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1554  ATP-dependent DNA helicase II  28.28 
 
 		 749 aa  69.7  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2246  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.12 
 
 		 751 aa  68.6  0.0000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.453558  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0291  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.94 
 
 		 751 aa  68.2  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0278  ATP-dependent DNA helicase  26.21 
 
 		 751 aa  68.2  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0351  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.94 
 
 		 753 aa  68.2  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1146  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.04 
 
 		 725 aa  68.6  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0305  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.21 
 
 		 747 aa  68.2  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4969  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.94 
 
 		 753 aa  68.2  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0334  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.21 
 
 		 747 aa  68.2  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0275  ATP-dependent DNA helicase  25.94 
 
 		 753 aa  68.2  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0336  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.94 
 
 		 751 aa  68.2  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0377  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.21 
 
 		 751 aa  68.2  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3362  UvrD family helicase  25 
 
 		 630 aa  67.8  0.0000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.753608  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1488  UvrD/REP helicase  26.71 
 
 		 659 aa  67.4  0.0000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1937  UvrD/REP helicase  24.7 
 
 		 726 aa  67.4  0.0000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0286  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.21 
 
 		 747 aa  67.4  0.0000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2542  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.72 
 
 		 751 aa  67  0.0000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1092  UvrD/REP helicase  22.16 
 
 		 707 aa  66.6  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0037216  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0699  UvrD/Rep family helicase  25.09 
 
 		 689 aa  65.9  0.000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0270  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.74 
 
 		 732 aa  65.1  0.000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2070  UvrD/REP helicase  25.69 
 
 		 789 aa  64.7  0.000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.535098  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0064  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  28.27 
 
 		 689 aa  64.3  0.000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16340  DNA/RNA helicase, superfamily I  24.65 
 
 		 772 aa  64.3  0.000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0144318 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3642  DNA-dependent helicase II  23.25 
 
 		 726 aa  64.3  0.000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2812  UvrD/REP helicase  21.56 
 
 		 719 aa  64.3  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2007  UvrD/REP helicase  22.86 
 
 		 714 aa  63.2  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0358603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2560  putative ATP-dependent DNA helicase, Rep  22.98 
 
 		 520 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.742452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2348  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.8 
 
 		 730 aa  63.5  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0164573  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1204  UvrD/REP helicase  24.75 
 
 		 744 aa  63.5  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.948208  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1994  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.34 
 
 		 730 aa  63.2  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1397  UvrD/REP helicase  26.83 
 
 		 625 aa  62.4  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.477297  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0868  UvrD/REP helicase  24.82 
 
 		 741 aa  62.4  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1960  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.34 
 
 		 730 aa  63.2  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1352  UvrD/REP helicase  26.13 
 
 		 807 aa  62.8  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0381  UvrD/REP helicase  23.8 
 
 		 688 aa  62.4  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0971471 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1930  UvrD/REP helicase  22.54 
 
 		 1082 aa  62  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00120508  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0222  DNA-dependent helicase II  26.41 
 
 		 734 aa  61.6  0.00000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.211627  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0249  UvrD/REP helicase  25.44 
 
 		 663 aa  61.6  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000268408  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0127  DNA helicase II  24.2 
 
 		 646 aa  61.2  0.00000005  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.889231  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4162  DNA-dependent helicase II  25.96 
 
 		 720 aa  61.2  0.00000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0353617  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4586  ATP-dependent DNA helicase UvrD  24.91 
 
 		 787 aa  61.2  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.721141 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1363  UvrD/REP helicase  24.91 
 
 		 787 aa  61.2  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.485952 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0960  UvrD/REP helicase  24.91 
 
 		 846 aa  60.8  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1322  UvrD/REP helicase  24.91 
 
 		 840 aa  60.8  0.00000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1442  UvrD/REP helicase  24.91 
 
 		 787 aa  60.5  0.00000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0964  UvrD/REP helicase  25.08 
 
 		 735 aa  60.5  0.00000008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0043  DNA-dependent helicase II  24.91 
 
 		 723 aa  60.5  0.00000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.779926  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1420  UvrD/REP helicase  24.91 
 
 		 787 aa  60.5  0.00000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0732039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2876  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.74 
 
 		 741 aa  60.1  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2797  UvrD/REP helicase  25.08 
 
 		 783 aa  60.5  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.265943  normal  0.311866 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0497  DNA-dependent helicase II  23.61 
 
 		 726 aa  60.1  0.0000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.615928  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1222  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.55 
 
 		 758 aa  59.7  0.0000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0971  UvrD/REP helicase  24.29 
 
 		 668 aa  60.1  0.0000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0211694  normal  0.301959 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0035  DNA-dependent helicase II  24.91 
 
 		 723 aa  60.5  0.0000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.193678  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0903  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25 
 
 		 662 aa  58.9  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000149159  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0080  DNA-dependent helicase II  26.33 
 
 		 724 aa  59.7  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0184  ATP-dependent DNA helicase Rep  24.5 
 
 		 672 aa  59.3  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0825  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.1 
 
 		 694 aa  59.3  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2424  UvrD/REP helicase  25.38 
 
 		 725 aa  59.3  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2537  UvrD/REP helicase  22.95 
 
 		 672 aa  59.3  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.423083  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0462  ATP-dependent DNA helicase Rep  24.91 
 
 		 672 aa  59.3  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10008  putative helicase  25.95 
 
 		 773 aa  58.9  0.0000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1536  UvrD/REP helicase  23.99 
 
 		 809 aa  58.9  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0142  UvrD/REP helicase  23.02 
 
 		 751 aa  58.5  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.750575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0128  DNA-dependent helicase II  23.72 
 
 		 741 aa  58.9  0.0000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000143952  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1337  UvrD/REP helicase  23.68 
 
 		 678 aa  58.9  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0426  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.97 
 
 		 748 aa  58.9  0.0000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1196  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.04 
 
 		 738 aa  58.2  0.0000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0621  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.69 
 
 		 659 aa  58.2  0.0000004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.12705  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0453  UvrD/REP helicase  21.05 
 
 		 681 aa  58.5  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.611277  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1337  ATP-dependent DNA helicase UvrD  24.77 
 
 		 783 aa  58.5  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1445  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.43 
 
 		 757 aa  58.5  0.0000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.715662  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_979  UvrD/REP helicase  26.1 
 
 		 738 aa  58.2  0.0000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1056  ATP-dependent DNA helicase  25.09 
 
 		 687 aa  57.8  0.0000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>