More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_1444 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_1444  penicillin-binding protein 1A (PBP-1a) (PBP1a)  100 
 
 		 495 aa  988    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00309644  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0021  FHA modulated glycosyl transferase/transpeptidase  28.96 
 
 		 762 aa  153  8e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.61335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0897  1A family penicillin-binding protein  29.01 
 
 		 691 aa  152  1e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.376717 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0506  penicillin-binding protein, 1A family  28.5 
 
 		 796 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.396512  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2868  1A family penicillin-binding protein  27.16 
 
 		 669 aa  146  1e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0010427  normal  0.721279 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1892  penicillin-binding protein 1A  28 
 
 		 655 aa  144  5e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.477214  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1919  FHA modulated glycosyl transferase/transpeptidase  28.11 
 
 		 751 aa  143  7e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1945  FHA modulated glycosyl transferase/transpeptidase  28.11 
 
 		 751 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0305  penicillin-binding protein  28.72 
 
 		 833 aa  142  1.9999999999999998e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0583  1A family penicillin-binding protein  27.51 
 
 		 718 aa  141  3e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.161794  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0583  1A family penicillin-binding protein  27.51 
 
 		 724 aa  141  3e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0983  penicillin-binding protein 1A (PBP-1a) (PBP1a) (penicillin-bindingprotein A)  31.09 
 
 		 638 aa  141  3e-32  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2677  1A family penicillin-binding protein  28.11 
 
 		 724 aa  141  3e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.288371  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0131  1A family penicillin-binding protein  25.81 
 
 		 770 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7653  putative penicillin-binding protein pbpC/mrcB-like protein  27.27 
 
 		 734 aa  140  4.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.278881 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2000  penicillin-binding protein 1A  26.62 
 
 		 740 aa  140  4.999999999999999e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0008  1A family penicillin-binding protein  28.54 
 
 		 775 aa  138  2e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000321042 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0596  penicillin-binding protein 1B  29.04 
 
 		 730 aa  137  3.0000000000000003e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0767  penicillin-binding protein, 1A family  28.86 
 
 		 763 aa  137  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.210188  normal  0.891602 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3462  penicillin-binding protein, 1A family  26.39 
 
 		 681 aa  137  6.0000000000000005e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1300  penicillin-binding protein, 1A family  29.03 
 
 		 648 aa  136  7.000000000000001e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.396458  hitchhiker  0.0031785 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1046  1A family penicillin-binding protein  28.75 
 
 		 810 aa  136  8e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3046  1A family penicillin-binding protein  26.52 
 
 		 720 aa  136  9e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.370823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0040  glycosyl transferase family protein  30.81 
 
 		 686 aa  135  9.999999999999999e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0883  1A family penicillin-binding protein  24.54 
 
 		 714 aa  136  9.999999999999999e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2885  penicillin-binding protein, 1A family  29.84 
 
 		 705 aa  135  1.9999999999999998e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.060613  normal  0.0841224 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0362  1A family penicillin-binding protein  25.3 
 
 		 741 aa  135  1.9999999999999998e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.244077 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1310  penicillin-binding protein 1A  27.36 
 
 		 704 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.028236  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0048  succinate dehydrogenase, iron-sulfur protein subunit  29.4 
 
 		 642 aa  134  5e-30  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3611  1A family penicillin-binding protein  27.75 
 
 		 814 aa  133  6e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.246117  hitchhiker  0.00429634 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0878  1A family penicillin-binding protein  27 
 
 		 626 aa  134  6e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.209414  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6858  penicillin-binding protein, 1A family  28.46 
 
 		 626 aa  133  6.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0444  penicillin-binding protein, 1A family  40.39 
 
 		 848 aa  133  6.999999999999999e-30  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0671851  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1032  penicillin-binding protein 1A (PBP-1a) (PBP1a)  29.48 
 
 		 645 aa  133  6.999999999999999e-30  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00344643  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5504  penicillin-binding protein  28.33 
 
 		 683 aa  133  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1672  penicillin-binding protein, putative  25.45 
 
 		 759 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5071  penicillin-binding protein  28.33 
 
 		 683 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2100  1A family penicillin-binding protein  26.45 
 
 		 661 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5497  penicillin-binding protein  28.1 
 
 		 683 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0739  penicillin-binding protein, 1A family  28.33 
 
 		 668 aa  132  1.0000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5467  penicillin-binding protein  28.1 
 
 		 683 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5223  penicillin-binding protein  28.1 
 
 		 683 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5623  penicillin-binding protein  28.1 
 
 		 683 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0124  penicillin-binding protein 1A  26.38 
 
 		 720 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.994879  normal  0.789667 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3260  penicillin-binding protein 1C  24.38 
 
 		 696 aa  132  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.247594  normal  0.375198 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5553  penicillin-binding protein  28.44 
 
 		 683 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5055  penicillin-binding protein  28.1 
 
 		 683 aa  131  3e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0785  penicillin-binding protein 1A  27.27 
 
 		 712 aa  131  3e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.649225 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0683  penicillin-binding protein 1A (PBP-1a) (PBP1a)  29.57 
 
 		 642 aa  131  3e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4417  penicillin-binding protein, 1A family  27.59 
 
 		 779 aa  131  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.896917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0806  glycosyl transferase family protein  29.4 
 
 		 680 aa  130  4.0000000000000003e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5453  penicillin-binding protein  27.86 
 
 		 683 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5168  1A family penicillin-binding protein  28.2 
 
 		 683 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1078  1A family penicillin-binding protein  25.51 
 
 		 727 aa  129  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.319269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4058  glycosyl transferase family protein  27.61 
 
 		 678 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4097  penicillin-binding protein, 1A family  27.34 
 
 		 776 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2676  1A family penicillin-binding protein  38.15 
 
 		 795 aa  129  1.0000000000000001e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.21019 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1342  penicillin-binding protein, 1A family  28.12 
 
 		 824 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1701  1A family penicillin-binding protein  26 
 
 		 626 aa  128  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.41226  normal  0.0892672 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1371  penicillin-binding protein, 1A family  28.12 
 
 		 824 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6778  1A family penicillin-binding protein  25.64 
 
 		 714 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0579  penicillin-binding domain protein  37.89 
 
 		 258 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000296239  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1453  penicillin-binding protein 1A  26.34 
 
 		 699 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.8478  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4759  penicillin-binding domain protein  37.89 
 
 		 258 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000000868977  unclonable  4.4469700000000004e-26 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1696  penicillin-binding protein, 1A family  28.03 
 
 		 761 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.235679  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0117  1A family penicillin-binding protein  26.67 
 
 		 763 aa  128  3e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0114  1A family penicillin-binding protein  26.58 
 
 		 730 aa  127  3e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.572692  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0131  penicillin-binding protein 1B  25.45 
 
 		 777 aa  127  3e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3329  penicillin-binding protein 1A  26.85 
 
 		 712 aa  128  3e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0227  penicillin-binding protein 1A  27.27 
 
 		 732 aa  128  3e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.369543  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0580  penicillin-binding protein, 1A family  26.33 
 
 		 739 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7522  penicillin-binding protein, 1A family  26.15 
 
 		 714 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.276054  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3888  1A family penicillin-binding protein  27.98 
 
 		 683 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.318045  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2073  penicillin-binding protein, 1A family  25.3 
 
 		 758 aa  127  5e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1953  penicillin-binding protein 1A  25.37 
 
 		 750 aa  127  6e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.330059 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2326  FHA modulated glycosyl transferase/transpeptidase  27.62 
 
 		 757 aa  127  6e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3506  penicillin-binding protein 1A  25.37 
 
 		 769 aa  127  7e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.430284 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3056  putative penicillin-binding protein  25.37 
 
 		 759 aa  126  9e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0203  1A family penicillin-binding protein  25.84 
 
 		 658 aa  125  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0615  penicillin-binding protein 1A  27.19 
 
 		 643 aa  125  1e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0950  penicillin-binding protein 1A  27.1 
 
 		 776 aa  125  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0536  penicillin-binding protein 1A  27.19 
 
 		 643 aa  125  1e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0597  penicillin-binding domain-containing protein  36.84 
 
 		 258 aa  125  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000108833  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1150  penicillin-binding protein 1A  27.38 
 
 		 759 aa  125  2e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0293  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.72 
 
 		 834 aa  125  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1427  penicillin-binding protein 1A  27.94 
 
 		 643 aa  125  2e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0921  penicillin-binding protein  28.61 
 
 		 649 aa  125  2e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1407  penicillin-binding protein 1B  40.43 
 
 		 748 aa  124  3e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0297434  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3529  FHA modulated glycosyl transferase/transpeptidase  27.41 
 
 		 751 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.554162  normal  0.675674 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0677  penicillin-binding protein, 1A family  25.94 
 
 		 815 aa  124  3e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.187464 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0466  glycosyl transferase family protein  38.71 
 
 		 273 aa  124  3e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000321197  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0041  penicillin-binding protein 1A  26.62 
 
 		 735 aa  124  3e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1297  penicillin-binding protein 1B  27.01 
 
 		 780 aa  124  4e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0858  penicillin-binding protein, 1A family  27.83 
 
 		 618 aa  124  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00486988  hitchhiker  0.00041503 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0825  penicillin-binding protein 1B  29.21 
 
 		 754 aa  124  4e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.524532  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2824  penicillin-binding protein 1C  26.45 
 
 		 680 aa  124  5e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002568  multimodular transpeptidase-transglycosylase  26.73 
 
 		 790 aa  124  5e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1627  1A family penicillin-binding protein  26.63 
 
 		 718 aa  124  5e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.216077 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0080  1A family penicillin-binding protein  25.68 
 
 		 704 aa  124  5e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2389  penicillin-binding protein, 1A family  44.05 
 
 		 727 aa  124  5e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.390791  normal  0.221681 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>