More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0040 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0040  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 686 aa  1384    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0379  glycosyl transferase family protein  43.95 
 
 		 635 aa  541  9.999999999999999e-153  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0041  glycosyl transferase family protein  41.42 
 
 		 643 aa  483  1e-135  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000612567  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0041  glycosyl transferase family protein  41.28 
 
 		 643 aa  481  1e-134  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0770668  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0806  glycosyl transferase family protein  36.52 
 
 		 680 aa  306  7e-82  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0203  1A family penicillin-binding protein  33.33 
 
 		 658 aa  261  2e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0362  1A family penicillin-binding protein  30.88 
 
 		 741 aa  259  1e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.244077 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0227  penicillin-binding protein 1A  30.9 
 
 		 732 aa  258  2e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.369543  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7653  putative penicillin-binding protein pbpC/mrcB-like protein  31.7 
 
 		 734 aa  258  3e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.278881 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0305  penicillin-binding protein  32.39 
 
 		 833 aa  254  4.0000000000000004e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1056  penicillin-binding protein, 1A family  31.99 
 
 		 751 aa  254  6e-66  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0124  penicillin-binding protein 1A  30.64 
 
 		 720 aa  253  9.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.994879  normal  0.789667 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3175  1A family penicillin-binding protein  30.92 
 
 		 728 aa  249  2e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6778  1A family penicillin-binding protein  31.7 
 
 		 714 aa  248  2e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0132  penicillin-binding protein 1A  31.7 
 
 		 734 aa  248  3e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675311  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0453  penicillin-binding protein 1A  31.99 
 
 		 757 aa  248  3e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.287636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3388  1A family penicillin-binding protein  31.9 
 
 		 750 aa  248  4e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7522  penicillin-binding protein, 1A family  31.52 
 
 		 714 aa  247  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.276054  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0041  penicillin-binding protein 1A  29.55 
 
 		 735 aa  244  3e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4417  penicillin-binding protein, 1A family  33.66 
 
 		 779 aa  244  3.9999999999999997e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.896917  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4097  penicillin-binding protein, 1A family  33.27 
 
 		 776 aa  244  5e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0580  penicillin-binding protein, 1A family  29.58 
 
 		 739 aa  243  1e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1109  peptidoglycan glycosyltransferase  31.56 
 
 		 795 aa  238  4e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000046818  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5243  penicillin-binding protein, 1A family  30.94 
 
 		 727 aa  234  5e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.766198  normal  0.919451 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1653  1A family penicillin-binding protein  30.26 
 
 		 768 aa  233  6e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.64242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1168  penicillin-binding protein 1b  30.68 
 
 		 826 aa  233  9e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0048  succinate dehydrogenase, iron-sulfur protein subunit  29.04 
 
 		 642 aa  232  1e-59  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3703  penicillin-binding protein, 1A family  31.98 
 
 		 712 aa  233  1e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.053736 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4301  penicillin-binding protein  31.58 
 
 		 769 aa  231  2e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.33062  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4776  1A family penicillin-binding protein  30.77 
 
 		 727 aa  231  3e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.119918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1297  penicillin-binding protein 1B  31.22 
 
 		 780 aa  231  3e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0858  penicillin-binding protein, 1A family  32.14 
 
 		 618 aa  231  5e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00486988  hitchhiker  0.00041503 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0506  penicillin-binding protein, 1A family  30.78 
 
 		 796 aa  230  5e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.396512  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3110  penicillin-binding protein 1b  31.05 
 
 		 826 aa  230  6e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0897  1A family penicillin-binding protein  29.55 
 
 		 691 aa  230  7e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.376717 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1000  penicillin-binding protein 1b  31.33 
 
 		 824 aa  229  9e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5318  penicillin-binding protein, 1A family  30.94 
 
 		 728 aa  229  1e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3334  penicillin-binding protein 1b  31.33 
 
 		 826 aa  229  1e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1036  penicillin-binding protein 1b  30.39 
 
 		 833 aa  229  1e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.970019  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1671  penicillin-binding protein 1A  28.38 
 
 		 693 aa  229  1e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000000343648  normal  0.536303 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3393  penicillin-binding protein 1A  30.25 
 
 		 651 aa  229  1e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3046  1A family penicillin-binding protein  31.31 
 
 		 720 aa  229  1e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.370823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1453  penicillin-binding protein 1A  29.91 
 
 		 699 aa  229  1e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.8478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3463  penicillin-binding protein 1b  31.33 
 
 		 826 aa  229  1e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.995661  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1696  penicillin-binding protein, 1A family  31.38 
 
 		 761 aa  229  2e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.235679  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0596  penicillin-binding protein 1B  33.01 
 
 		 730 aa  228  2e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0597  penicillin-binding protein, 1A family  30.5 
 
 		 665 aa  228  2e-58  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0080  1A family penicillin-binding protein  31.22 
 
 		 704 aa  229  2e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0135  1A family penicillin-binding protein  30.12 
 
 		 646 aa  228  3e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000146416  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3986  1A family penicillin-binding protein  30.72 
 
 		 723 aa  228  3e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1710  penicillin-binding protein 1A  31.83 
 
 		 905 aa  228  4e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000352248  normal  0.214747 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1701  1A family penicillin-binding protein  29.66 
 
 		 626 aa  228  4e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.41226  normal  0.0892672 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0825  Mutator MutT  31.25 
 
 		 777 aa  227  5.0000000000000005e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00304949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2520  penicillin-binding protein 1A  30.93 
 
 		 750 aa  227  6e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3981  penicillin-binding protein 1b  31.49 
 
 		 836 aa  226  8e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.289458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1128  penicillin-binding protein, 1A family  34.43 
 
 		 648 aa  226  1e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2011  penicillin-binding protein, 1A family  31.43 
 
 		 676 aa  226  1e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0131  1A family penicillin-binding protein  30.89 
 
 		 770 aa  226  1e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2815  penicillin-binding protein 1b  30.91 
 
 		 827 aa  224  3e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.692041  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0650  penicillin-binding protein 1B  31.85 
 
 		 830 aa  224  3e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0689  penicillin-binding protein 1b  33.04 
 
 		 841 aa  224  3e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.50279 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1561  1A family penicillin-binding protein  30.07 
 
 		 662 aa  224  4.9999999999999996e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00865388  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0395  penicillin-binding protein, 1A family  30.02 
 
 		 709 aa  224  4.9999999999999996e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.14301  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2447  penicillin-binding protein 1A  30.83 
 
 		 837 aa  223  6e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0929548  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4205  1A family penicillin-binding protein  30.96 
 
 		 654 aa  223  7e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.317935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0825  penicillin-binding protein 1B  31.37 
 
 		 754 aa  223  8e-57  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.524532  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1722  1A family penicillin-binding protein  30.78 
 
 		 836 aa  223  9.999999999999999e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.278842  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0656  penicillin-binding protein 1B  32.33 
 
 		 779 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0683  penicillin-binding protein 1A (PBP-1a) (PBP1a)  31.05 
 
 		 642 aa  222  1.9999999999999999e-56  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0785  penicillin-binding protein 1A  31.53 
 
 		 712 aa  222  1.9999999999999999e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.649225 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2430  1A family penicillin-binding protein  28.74 
 
 		 667 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000145418  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3502  penicillin-binding protein, 1A family  29.61 
 
 		 701 aa  221  3e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.114695  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2108  penicillin-binding protein 1A  31.8 
 
 		 835 aa  221  3e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.60098  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2677  1A family penicillin-binding protein  29.3 
 
 		 724 aa  221  3.9999999999999997e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.288371  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0114  1A family penicillin-binding protein  30.69 
 
 		 730 aa  221  3.9999999999999997e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.572692  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0823  1A family penicillin-binding protein  30.69 
 
 		 705 aa  221  5e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0767  penicillin-binding protein, 1A family  31.57 
 
 		 763 aa  220  7e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.210188  normal  0.891602 
 
 
-
 
NC_004310  BR0117  1A family penicillin-binding protein  30.49 
 
 		 763 aa  219  8.999999999999998e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2345  penicillin-binding protein 1A  31.3 
 
 		 820 aa  219  8.999999999999998e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.538811  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2364  penicillin-binding protein 1A  31.3 
 
 		 834 aa  220  8.999999999999998e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2370  penicillin-binding protein 1A  30.13 
 
 		 837 aa  219  1e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0572853  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2868  1A family penicillin-binding protein  32.33 
 
 		 669 aa  219  1e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0010427  normal  0.721279 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0008  1A family penicillin-binding protein  30.57 
 
 		 775 aa  219  1e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000321042 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2185  penicillin-binding protein 1A  31.47 
 
 		 846 aa  218  2e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.704699  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2122  penicillin-binding protein 1A  31.3 
 
 		 834 aa  219  2e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6858  penicillin-binding protein, 1A family  31.7 
 
 		 626 aa  218  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2153  1A family penicillin-binding protein  29.92 
 
 		 839 aa  219  2e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0583  1A family penicillin-binding protein  29.68 
 
 		 724 aa  218  2e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2820  penicillin-binding protein, 1A family  30.77 
 
 		 727 aa  218  2.9999999999999998e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.727063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0206  penicillin-binding protein 1b  32.56 
 
 		 840 aa  218  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0207  penicillin-binding protein 1b  32.56 
 
 		 840 aa  218  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0225  penicillin-binding protein 1b  32.56 
 
 		 840 aa  218  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0218  penicillin-binding protein 1b  32.56 
 
 		 840 aa  218  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3571  penicillin-binding protein, 1A family  29.55 
 
 		 744 aa  218  4e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1627  1A family penicillin-binding protein  30.66 
 
 		 718 aa  217  5e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.216077 
 
 
-
 
NC_004310  BR0583  1A family penicillin-binding protein  29.38 
 
 		 718 aa  217  5.9999999999999996e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.161794  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2066  1A family penicillin-binding protein  32.01 
 
 		 640 aa  217  5.9999999999999996e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03443  hypothetical protein  31.16 
 
 		 796 aa  217  7e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0222  penicillin-binding protein 1b  32.56 
 
 		 840 aa  216  8e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2548  1A family penicillin-binding protein  29.6 
 
 		 788 aa  216  8e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.340929  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>