More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0712 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0712  riboflavin synthase subunit alpha  100 
 
 		 204 aa  414  9.999999999999999e-116  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1231  riboflavin synthase subunit alpha  65.85 
 
 		 203 aa  280  8.000000000000001e-75  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000560393  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0555  riboflavin synthase subunit alpha  64.56 
 
 		 204 aa  280  9e-75  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.560873  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0512  riboflavin synthase subunit alpha  65.37 
 
 		 203 aa  276  1e-73  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00148394  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1353  riboflavin synthase subunit alpha  64.39 
 
 		 203 aa  270  9e-72  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1908  riboflavin synthase subunit alpha  62.75 
 
 		 201 aa  266  2e-70  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000158987  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1099  riboflavin synthase subunit alpha  59.8 
 
 		 202 aa  262  3e-69  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.680954  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1445  riboflavin synthase subunit alpha  56.46 
 
 		 207 aa  250  8.000000000000001e-66  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.575179  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1825  riboflavin synthase, alpha subunit  52.76 
 
 		 202 aa  231  7.000000000000001e-60  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1930  riboflavin synthase subunit alpha  50.73 
 
 		 203 aa  223  1e-57  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11410  riboflavin synthase subunit alpha  39.29 
 
 		 219 aa  137  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.593747  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0515  riboflavin synthase subunit alpha  38.78 
 
 		 221 aa  136  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1046  riboflavin synthase subunit alpha  38.78 
 
 		 219 aa  136  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0550  riboflavin synthase subunit alpha  38.78 
 
 		 221 aa  136  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0561  riboflavin synthase subunit alpha  38.78 
 
 		 221 aa  136  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0167  riboflavin synthase subunit alpha  37.56 
 
 		 223 aa  136  2e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0691  riboflavin synthase, alpha subunit  38.27 
 
 		 220 aa  135  5e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4461  riboflavin synthase subunit alpha  38.27 
 
 		 220 aa  134  7.000000000000001e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.770295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0568  riboflavin synthase subunit alpha  38.27 
 
 		 221 aa  134  8e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01419  riboflavin synthase subunit alpha  37.95 
 
 		 220 aa  133  1.9999999999999998e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000127826  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1254  riboflavin synthase subunit alpha  38.04 
 
 		 209 aa  130  1.0000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1522  riboflavin synthase, alpha subunit  37.95 
 
 		 217 aa  129  2.0000000000000002e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3856  riboflavin synthase subunit alpha  39.29 
 
 		 220 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5018  riboflavin synthase subunit alpha  36.22 
 
 		 220 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2182  riboflavin synthase subunit alpha  37.32 
 
 		 215 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000398274  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0298  riboflavin synthase, alpha subunit  35.32 
 
 		 218 aa  127  9.000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0474  riboflavin synthase, alpha subunit  35.32 
 
 		 218 aa  127  9.000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000469056 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004264  riboflavin synthase alpha chain  40.49 
 
 		 217 aa  127  1.0000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000121594  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3468  riboflavin synthase subunit alpha  37.08 
 
 		 218 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1097  riboflavin synthase subunit alpha  37.08 
 
 		 218 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0107827  normal  0.803042 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1163  riboflavin synthase subunit alpha  37.08 
 
 		 218 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.166605  normal  0.121939 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1860  riboflavin synthase subunit alpha  41.1 
 
 		 217 aa  126  2.0000000000000002e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0164931  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0731  riboflavin synthase subunit alpha  37.71 
 
 		 232 aa  126  3e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2777  riboflavin synthase subunit alpha  37.08 
 
 		 218 aa  125  3e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0829317  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01167  riboflavin synthase subunit alpha  41.1 
 
 		 217 aa  126  3e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1097  riboflavin synthase subunit alpha  37.08 
 
 		 218 aa  125  3e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0146706  normal  0.608902 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0923  riboflavin synthase subunit alpha  35.57 
 
 		 218 aa  125  5e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3158  riboflavin synthase subunit alpha  34.88 
 
 		 218 aa  124  7e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00280959  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0847  riboflavin synthase subunit alpha  38.89 
 
 		 206 aa  124  8.000000000000001e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000849301  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0009  riboflavin synthase subunit alpha  34.36 
 
 		 208 aa  124  9e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1212  riboflavin synthase subunit alpha  37.08 
 
 		 218 aa  124  9e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.254692 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3159  riboflavin synthase subunit alpha  37.08 
 
 		 218 aa  124  9e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00317838  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1441  riboflavin synthase subunit alpha  33.98 
 
 		 220 aa  124  1e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0916  riboflavin synthase subunit alpha  37.74 
 
 		 217 aa  124  1e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00048096  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1383  riboflavin synthase subunit alpha  34.85 
 
 		 220 aa  124  1e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00417649  hitchhiker  0.000000386622 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2597  riboflavin synthase subunit alpha  35.9 
 
 		 193 aa  123  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.195355  normal  0.238083 
 
 
-
 
NC_002978  WD0130  riboflavin synthase subunit alpha  38.51 
 
 		 198 aa  122  3e-27  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0226834  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2809  riboflavin synthase subunit alpha  38.42 
 
 		 214 aa  122  3e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.352562  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3302  riboflavin synthase subunit alpha  36.52 
 
 		 218 aa  122  3e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.121431  decreased coverage  0.000098078 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2024  riboflavin synthase subunit alpha  36.08 
 
 		 218 aa  122  3e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0604  riboflavin synthase subunit alpha  34.72 
 
 		 222 aa  122  3e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.128519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1534  riboflavin synthase subunit alpha  36.76 
 
 		 201 aa  122  4e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00190054  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06730  riboflavin synthase subunit alpha  40.76 
 
 		 219 aa  122  5e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2469  riboflavin synthase subunit alpha  36.27 
 
 		 223 aa  121  7e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.032999 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1868  riboflavin synthase, alpha subunit  34.69 
 
 		 216 aa  120  9.999999999999999e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0165858  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1036  riboflavin synthase subunit alpha  34.01 
 
 		 219 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00015592  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1981  riboflavin synthase subunit alpha  34.62 
 
 		 216 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1145  riboflavin synthase subunit alpha  34.46 
 
 		 217 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000276723  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1073  riboflavin synthase subunit alpha  37.13 
 
 		 215 aa  120  1.9999999999999998e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2354  riboflavin synthase, alpha subunit  33.67 
 
 		 215 aa  120  1.9999999999999998e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0725923  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1750  riboflavin synthase, alpha subunit  36.36 
 
 		 213 aa  119  3e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.206972  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1868  riboflavin synthase subunit alpha  34.8 
 
 		 220 aa  119  3e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1312  riboflavin synthase subunit alpha  31.16 
 
 		 221 aa  119  3e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.903669  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1188  riboflavin synthase subunit alpha  33.67 
 
 		 221 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0484679  normal  0.881373 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1163  riboflavin synthase subunit alpha  33.84 
 
 		 221 aa  118  4.9999999999999996e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000497127  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2005  riboflavin synthase subunit alpha  35.29 
 
 		 218 aa  119  4.9999999999999996e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0140108  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2299  riboflavin synthase subunit alpha  36.32 
 
 		 221 aa  118  6e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.433385  hitchhiker  0.00000264198 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3023  riboflavin synthase subunit alpha  37.76 
 
 		 214 aa  118  6e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.20126  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1274  riboflavin synthase subunit alpha  36.2 
 
 		 220 aa  118  7e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000236102  hitchhiker  0.00000000155009 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2667  riboflavin synthase subunit alpha  36.59 
 
 		 214 aa  118  7e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2140  riboflavin synthase subunit alpha  35.78 
 
 		 223 aa  117  9e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00256216 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18150  riboflavin synthase, alpha subunit  32.37 
 
 		 200 aa  117  9.999999999999999e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1884  riboflavin synthase, alpha subunit  35.57 
 
 		 227 aa  117  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.219798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0177  riboflavin synthase subunit alpha  37.5 
 
 		 210 aa  117  9.999999999999999e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.767417  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1824  riboflavin synthase subunit alpha  34.87 
 
 		 196 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.326708  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2884  riboflavin synthase subunit alpha  34.15 
 
 		 214 aa  117  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.95813  normal  0.119632 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1017  riboflavin synthase subunit alpha  34.52 
 
 		 217 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.743536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3457  riboflavin synthase subunit alpha  37.11 
 
 		 220 aa  116  1.9999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766476 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2120  riboflavin synthase subunit alpha  38.22 
 
 		 204 aa  116  1.9999999999999998e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2916  riboflavin synthase subunit alpha  36.02 
 
 		 219 aa  116  3e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0248627 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0775  riboflavin synthase subunit alpha  37.8 
 
 		 209 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.509273  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0547  riboflavin synthase subunit alpha  35.68 
 
 		 217 aa  115  3.9999999999999997e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0768  riboflavin synthase subunit alpha  34.31 
 
 		 202 aa  115  5e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0531  riboflavin synthase subunit alpha  35.68 
 
 		 217 aa  115  5e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.990747  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0853  riboflavin synthase subunit alpha  38.14 
 
 		 200 aa  115  6e-25  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1227  riboflavin synthase subunit alpha  36.36 
 
 		 214 aa  114  7.999999999999999e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00725897 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04399  riboflavin synthase subunit alpha  38.27 
 
 		 200 aa  114  7.999999999999999e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0021  riboflavin synthase, alpha subunit  34.52 
 
 		 207 aa  114  7.999999999999999e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1859  riboflavin synthase, alpha subunit  32.66 
 
 		 204 aa  114  8.999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.261551  normal  0.387572 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2444  riboflavin synthase subunit alpha  33.33 
 
 		 205 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1773  riboflavin synthase subunit alpha  38.54 
 
 		 217 aa  114  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0488322  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0761  riboflavin synthase subunit alpha  33.82 
 
 		 202 aa  114  1.0000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04961  riboflavin synthase subunit alpha  38.54 
 
 		 217 aa  114  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.184408 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1758  riboflavin synthase subunit alpha  34.9 
 
 		 218 aa  114  1.0000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3417  riboflavin synthase subunit alpha  35.03 
 
 		 196 aa  114  1.0000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.544383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2990  riboflavin synthase subunit alpha  36.68 
 
 		 205 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.039425 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04391  riboflavin synthase subunit alpha  33.68 
 
 		 221 aa  114  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1560  riboflavin synthase, alpha subunit  32 
 
 		 220 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3707  riboflavin synthase, alpha subunit  32.5 
 
 		 196 aa  113  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11441  riboflavin synthase subunit alpha  34.17 
 
 		 201 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.370285 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>