More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0555 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0555  riboflavin synthase subunit alpha  100 
 
 
204 aa  412  1e-114  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.560873  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1231  riboflavin synthase subunit alpha  70.59 
 
 
203 aa  303  2.0000000000000002e-81  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000560393  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0512  riboflavin synthase subunit alpha  69.61 
 
 
203 aa  298  3e-80  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00148394  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1353  riboflavin synthase subunit alpha  69.61 
 
 
203 aa  297  8e-80  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1908  riboflavin synthase subunit alpha  70.59 
 
 
201 aa  296  1e-79  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000158987  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0712  riboflavin synthase subunit alpha  64.56 
 
 
204 aa  280  9e-75  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1099  riboflavin synthase subunit alpha  64.71 
 
 
202 aa  277  7e-74  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.680954  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1445  riboflavin synthase subunit alpha  60.87 
 
 
207 aa  263  2e-69  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.575179  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1825  riboflavin synthase, alpha subunit  51.96 
 
 
202 aa  239  2e-62  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1930  riboflavin synthase subunit alpha  51.47 
 
 
203 aa  216  2e-55  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1750  riboflavin synthase, alpha subunit  36.23 
 
 
213 aa  134  6.0000000000000005e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.206972  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2005  riboflavin synthase subunit alpha  36.04 
 
 
218 aa  131  7.999999999999999e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0140108  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01167  riboflavin synthase subunit alpha  38.51 
 
 
217 aa  129  2.0000000000000002e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1522  riboflavin synthase, alpha subunit  35.57 
 
 
217 aa  128  4.0000000000000003e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01419  riboflavin synthase subunit alpha  35.9 
 
 
220 aa  129  4.0000000000000003e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000127826  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1046  riboflavin synthase subunit alpha  42.5 
 
 
219 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11410  riboflavin synthase subunit alpha  37.76 
 
 
219 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.593747  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0847  riboflavin synthase subunit alpha  37.17 
 
 
206 aa  127  8.000000000000001e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000849301  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1860  riboflavin synthase subunit alpha  39.51 
 
 
217 aa  126  2.0000000000000002e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0164931  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0167  riboflavin synthase subunit alpha  33.66 
 
 
223 aa  127  2.0000000000000002e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0515  riboflavin synthase subunit alpha  40.51 
 
 
221 aa  126  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0550  riboflavin synthase subunit alpha  40.51 
 
 
221 aa  126  3e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5018  riboflavin synthase subunit alpha  42.68 
 
 
220 aa  126  3e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0561  riboflavin synthase subunit alpha  40.51 
 
 
221 aa  126  3e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0568  riboflavin synthase subunit alpha  40.51 
 
 
221 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0923  riboflavin synthase subunit alpha  35.03 
 
 
218 aa  125  5e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1441  riboflavin synthase subunit alpha  34.54 
 
 
220 aa  125  5e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4461  riboflavin synthase subunit alpha  40.76 
 
 
220 aa  125  6e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.770295  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3856  riboflavin synthase subunit alpha  41.14 
 
 
220 aa  125  6e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0177  riboflavin synthase subunit alpha  37.82 
 
 
210 aa  123  2e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.767417  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004264  riboflavin synthase alpha chain  37.89 
 
 
217 aa  122  3e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000121594  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0691  riboflavin synthase, alpha subunit  41.77 
 
 
220 aa  122  4e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2809  riboflavin synthase subunit alpha  36.04 
 
 
214 aa  122  4e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.352562  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1073  riboflavin synthase subunit alpha  34.34 
 
 
215 aa  122  4e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0009  riboflavin synthase subunit alpha  34.36 
 
 
208 aa  121  6e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2078  riboflavin synthase, alpha subunit  35.58 
 
 
216 aa  121  6e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00424988  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3478  riboflavin synthase, alpha subunit  31.96 
 
 
200 aa  121  7e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0244211  normal  0.131699 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3463  hypothetical protein  33.33 
 
 
199 aa  121  7e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0130  riboflavin synthase subunit alpha  34.97 
 
 
198 aa  121  8e-27  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0226834  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06730  riboflavin synthase subunit alpha  40.51 
 
 
219 aa  121  8e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1227  riboflavin synthase subunit alpha  34 
 
 
214 aa  121  8e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00725897 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0731  riboflavin synthase subunit alpha  33.33 
 
 
232 aa  120  9.999999999999999e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2182  riboflavin synthase subunit alpha  34.98 
 
 
215 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000398274  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1446  riboflavin synthase subunit alpha  33.17 
 
 
216 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1875  riboflavin synthase subunit alpha  36.45 
 
 
221 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.816365 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1036  riboflavin synthase subunit alpha  34.15 
 
 
219 aa  119  3e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00015592  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1078  riboflavin synthase subunit alpha  34.48 
 
 
205 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3468  riboflavin synthase subunit alpha  35.8 
 
 
218 aa  118  4.9999999999999996e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0775  riboflavin synthase subunit alpha  40.24 
 
 
209 aa  118  4.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.509273  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3023  riboflavin synthase subunit alpha  34.5 
 
 
214 aa  118  4.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.20126  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1097  riboflavin synthase subunit alpha  35.8 
 
 
218 aa  118  4.9999999999999996e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0146706  normal  0.608902 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1312  riboflavin synthase subunit alpha  31.96 
 
 
221 aa  118  6e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.903669  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1097  riboflavin synthase subunit alpha  35.8 
 
 
218 aa  118  6e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0107827  normal  0.803042 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1163  riboflavin synthase subunit alpha  35.8 
 
 
218 aa  118  6e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.166605  normal  0.121939 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1421  riboflavin synthase subunit alpha  32.12 
 
 
220 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00972231  normal  0.185271 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0853  riboflavin synthase subunit alpha  35.57 
 
 
200 aa  117  9.999999999999999e-26  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1145  riboflavin synthase subunit alpha  35.8 
 
 
217 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000276723  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1773  riboflavin synthase subunit alpha  33.33 
 
 
217 aa  116  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0488322  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1274  riboflavin synthase subunit alpha  33.84 
 
 
220 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000236102  hitchhiker  0.00000000155009 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2597  riboflavin synthase subunit alpha  33.33 
 
 
193 aa  115  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.195355  normal  0.238083 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2469  riboflavin synthase subunit alpha  33.67 
 
 
223 aa  115  3e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.032999 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2299  riboflavin synthase subunit alpha  33.84 
 
 
221 aa  116  3e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.433385  hitchhiker  0.00000264198 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2809  riboflavin synthase subunit alpha  32.35 
 
 
214 aa  116  3e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2435  riboflavin synthase subunit alpha  32.64 
 
 
224 aa  115  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00995075  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3417  riboflavin synthase subunit alpha  35.57 
 
 
196 aa  115  3.9999999999999997e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.544383  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1625  riboflavin synthase subunit alpha  33.65 
 
 
216 aa  115  5e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00676611  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1009  riboflavin synthase, alpha subunit  36.69 
 
 
208 aa  115  5e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1981  riboflavin synthase subunit alpha  34.95 
 
 
216 aa  115  5e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18150  riboflavin synthase, alpha subunit  34.67 
 
 
200 aa  115  6e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1188  riboflavin synthase subunit alpha  37.34 
 
 
221 aa  115  6e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0484679  normal  0.881373 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04961  riboflavin synthase subunit alpha  32.84 
 
 
217 aa  114  7.999999999999999e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.184408 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1016  riboflavin synthase subunit alpha  34.31 
 
 
214 aa  114  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3159  riboflavin synthase subunit alpha  34.66 
 
 
218 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00317838  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0624  riboflavin synthase subunit alpha  35.35 
 
 
215 aa  114  1.0000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00110444  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2667  riboflavin synthase subunit alpha  35.78 
 
 
214 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1212  riboflavin synthase subunit alpha  34.66 
 
 
218 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.254692 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0061  riboflavin synthase subunit alpha  31.66 
 
 
218 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.201459  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1221  riboflavin synthase subunit alpha  30.3 
 
 
226 aa  114  1.0000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.464139  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3158  riboflavin synthase subunit alpha  34.66 
 
 
218 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00280959  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0298  riboflavin synthase, alpha subunit  34.65 
 
 
218 aa  113  2.0000000000000002e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0474  riboflavin synthase, alpha subunit  34.65 
 
 
218 aa  113  2.0000000000000002e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000469056 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2777  riboflavin synthase subunit alpha  34.66 
 
 
218 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0829317  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0604  riboflavin synthase subunit alpha  34.87 
 
 
222 aa  113  2.0000000000000002e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.128519  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1399  riboflavin synthase subunit alpha  35.76 
 
 
221 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.706898  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1163  riboflavin synthase subunit alpha  36.71 
 
 
221 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000497127  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3302  riboflavin synthase subunit alpha  35.23 
 
 
218 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.121431  decreased coverage  0.000098078 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2946  riboflavin synthase subunit alpha  38.55 
 
 
205 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.175022  normal  0.644585 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1383  riboflavin synthase subunit alpha  36.94 
 
 
220 aa  112  3e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00417649  hitchhiker  0.000000386622 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2092  riboflavin synthase subunit alpha  34.16 
 
 
187 aa  112  3e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0540242  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2024  riboflavin synthase subunit alpha  36.08 
 
 
218 aa  112  4.0000000000000004e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0441  riboflavin synthase subunit alpha  32.83 
 
 
217 aa  112  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0861062  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04661  riboflavin synthase subunit alpha  33.33 
 
 
217 aa  112  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1595  riboflavin synthase subunit alpha  30.65 
 
 
213 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000438085  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2858  riboflavin synthase subunit alpha  33.33 
 
 
207 aa  112  5e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.650896  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2252  riboflavin synthase subunit alpha  36.04 
 
 
200 aa  111  6e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.743387 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1560  riboflavin synthase, alpha subunit  33.51 
 
 
220 aa  111  6e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1017  riboflavin synthase subunit alpha  32.11 
 
 
217 aa  111  9e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.743536  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2140  riboflavin synthase subunit alpha  33.17 
 
 
223 aa  110  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00256216 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04971  riboflavin synthase subunit alpha  31.82 
 
 
217 aa  110  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.372947  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0581  riboflavin synthase subunit alpha  35.98 
 
 
208 aa  110  1.0000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.323672  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>