More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1099 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_1099  riboflavin synthase subunit alpha  100 
 
 		 202 aa  415  9.999999999999999e-116  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.680954  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0512  riboflavin synthase subunit alpha  71.92 
 
 		 203 aa  305  4.0000000000000004e-82  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00148394  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1231  riboflavin synthase subunit alpha  71.92 
 
 		 203 aa  304  5.0000000000000004e-82  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000560393  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1353  riboflavin synthase subunit alpha  71.43 
 
 		 203 aa  301  5.000000000000001e-81  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1908  riboflavin synthase subunit alpha  67.33 
 
 		 201 aa  289  2e-77  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000158987  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0555  riboflavin synthase subunit alpha  64.71 
 
 		 204 aa  277  7e-74  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.560873  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0712  riboflavin synthase subunit alpha  59.8 
 
 		 204 aa  262  3e-69  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1445  riboflavin synthase subunit alpha  55.07 
 
 		 207 aa  243  1.9999999999999999e-63  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.575179  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1825  riboflavin synthase, alpha subunit  53.47 
 
 		 202 aa  242  1.9999999999999999e-63  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1930  riboflavin synthase subunit alpha  50.25 
 
 		 203 aa  215  2.9999999999999998e-55  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0561  riboflavin synthase subunit alpha  39.62 
 
 		 221 aa  150  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0515  riboflavin synthase subunit alpha  39.62 
 
 		 221 aa  150  1e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0550  riboflavin synthase subunit alpha  39.62 
 
 		 221 aa  150  1e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0568  riboflavin synthase subunit alpha  39.62 
 
 		 221 aa  150  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1441  riboflavin synthase subunit alpha  37.32 
 
 		 220 aa  150  2e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11410  riboflavin synthase subunit alpha  39.69 
 
 		 219 aa  145  3e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.593747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4461  riboflavin synthase subunit alpha  39.69 
 
 		 220 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.770295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5018  riboflavin synthase subunit alpha  40.72 
 
 		 220 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1046  riboflavin synthase subunit alpha  39.18 
 
 		 219 aa  145  5e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3856  riboflavin synthase subunit alpha  40.21 
 
 		 220 aa  145  5e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0691  riboflavin synthase, alpha subunit  41.03 
 
 		 220 aa  144  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01419  riboflavin synthase subunit alpha  40.72 
 
 		 220 aa  144  1e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000127826  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1860  riboflavin synthase subunit alpha  41.92 
 
 		 217 aa  142  5e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0164931  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01167  riboflavin synthase subunit alpha  41.32 
 
 		 217 aa  140  9.999999999999999e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1145  riboflavin synthase subunit alpha  37 
 
 		 217 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000276723  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2005  riboflavin synthase subunit alpha  39.38 
 
 		 218 aa  139  3e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0140108  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1254  riboflavin synthase subunit alpha  38.95 
 
 		 209 aa  139  3.9999999999999997e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0923  riboflavin synthase subunit alpha  41.1 
 
 		 218 aa  139  3.9999999999999997e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004264  riboflavin synthase alpha chain  41.1 
 
 		 217 aa  138  3.9999999999999997e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000121594  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0009  riboflavin synthase subunit alpha  36.71 
 
 		 208 aa  138  6e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06730  riboflavin synthase subunit alpha  40.51 
 
 		 219 aa  138  6e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1522  riboflavin synthase, alpha subunit  36.08 
 
 		 217 aa  137  1e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0167  riboflavin synthase subunit alpha  37.56 
 
 		 223 aa  137  1e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2299  riboflavin synthase subunit alpha  38.46 
 
 		 221 aa  136  2e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.433385  hitchhiker  0.00000264198 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3158  riboflavin synthase subunit alpha  38.78 
 
 		 218 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00280959  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2777  riboflavin synthase subunit alpha  38.78 
 
 		 218 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0829317  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1212  riboflavin synthase subunit alpha  38.78 
 
 		 218 aa  135  4e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.254692 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3159  riboflavin synthase subunit alpha  38.78 
 
 		 218 aa  135  4e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00317838  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1163  riboflavin synthase subunit alpha  37.19 
 
 		 221 aa  134  6.0000000000000005e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000497127  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1868  riboflavin synthase, alpha subunit  39.18 
 
 		 216 aa  134  9e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0165858  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04961  riboflavin synthase subunit alpha  39.49 
 
 		 217 aa  134  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.184408 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3468  riboflavin synthase subunit alpha  37.76 
 
 		 218 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1097  riboflavin synthase subunit alpha  37.76 
 
 		 218 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0107827  normal  0.803042 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1163  riboflavin synthase subunit alpha  37.76 
 
 		 218 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.166605  normal  0.121939 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1036  riboflavin synthase subunit alpha  38.97 
 
 		 219 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00015592  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1097  riboflavin synthase subunit alpha  37.76 
 
 		 218 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0146706  normal  0.608902 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0731  riboflavin synthase subunit alpha  37.68 
 
 		 232 aa  132  1.9999999999999998e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3302  riboflavin synthase subunit alpha  38.27 
 
 		 218 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.121431  decreased coverage  0.000098078 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1274  riboflavin synthase subunit alpha  36.82 
 
 		 220 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000236102  hitchhiker  0.00000000155009 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1383  riboflavin synthase subunit alpha  37.19 
 
 		 220 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00417649  hitchhiker  0.000000386622 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0916  riboflavin synthase subunit alpha  40 
 
 		 217 aa  132  3e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00048096  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0177  riboflavin synthase subunit alpha  38.57 
 
 		 210 aa  132  3.9999999999999996e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.767417  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1188  riboflavin synthase subunit alpha  37.5 
 
 		 221 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0484679  normal  0.881373 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1773  riboflavin synthase subunit alpha  38.97 
 
 		 217 aa  131  6.999999999999999e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0488322  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0298  riboflavin synthase, alpha subunit  37.5 
 
 		 218 aa  130  9e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0474  riboflavin synthase, alpha subunit  37.5 
 
 		 218 aa  130  9e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000469056 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1824  riboflavin synthase subunit alpha  37.31 
 
 		 196 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.326708  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0847  riboflavin synthase subunit alpha  38.46 
 
 		 206 aa  129  2.0000000000000002e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000849301  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1017  riboflavin synthase subunit alpha  36.63 
 
 		 217 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.743536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2024  riboflavin synthase subunit alpha  38.14 
 
 		 218 aa  129  3e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0604  riboflavin synthase subunit alpha  36.79 
 
 		 222 aa  129  4.0000000000000003e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.128519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1312  riboflavin synthase subunit alpha  33.33 
 
 		 221 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.903669  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1657  riboflavin synthase subunit alpha  37.5 
 
 		 219 aa  128  5.0000000000000004e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.389961  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1884  riboflavin synthase, alpha subunit  41.77 
 
 		 227 aa  128  6e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.219798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1750  riboflavin synthase, alpha subunit  35.75 
 
 		 213 aa  128  7.000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.206972  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1981  riboflavin synthase subunit alpha  35.44 
 
 		 216 aa  127  8.000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1560  riboflavin synthase, alpha subunit  37.37 
 
 		 220 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1399  riboflavin synthase subunit alpha  35.68 
 
 		 221 aa  126  3e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.706898  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0624  riboflavin synthase subunit alpha  33.17 
 
 		 215 aa  125  4.0000000000000003e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00110444  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4221  riboflavin synthase subunit alpha  37.17 
 
 		 214 aa  125  5e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0853  riboflavin synthase subunit alpha  36.55 
 
 		 200 aa  124  7e-28  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1073  riboflavin synthase subunit alpha  36.22 
 
 		 215 aa  124  7e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0105  riboflavin synthase subunit alpha  33.65 
 
 		 218 aa  124  9e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2238  riboflavin synthase subunit alpha  36.36 
 
 		 215 aa  124  1e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2182  riboflavin synthase subunit alpha  36.27 
 
 		 215 aa  123  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000398274  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1758  riboflavin synthase subunit alpha  34.58 
 
 		 218 aa  123  2e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2469  riboflavin synthase subunit alpha  35.64 
 
 		 223 aa  123  2e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.032999 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3478  riboflavin synthase, alpha subunit  34.87 
 
 		 200 aa  123  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0244211  normal  0.131699 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1160  riboflavin synthase, alpha subunit  36.13 
 
 		 204 aa  122  3e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0775  riboflavin synthase subunit alpha  32.85 
 
 		 209 aa  122  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.509273  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3457  riboflavin synthase subunit alpha  38.85 
 
 		 220 aa  122  3e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766476 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0061  riboflavin synthase subunit alpha  33.33 
 
 		 218 aa  122  5e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.201459  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06371  riboflavin synthase subunit alpha  36.08 
 
 		 220 aa  122  5e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0855264 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0386  riboflavin synthase subunit alpha  35.71 
 
 		 214 aa  121  6e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1446  riboflavin synthase subunit alpha  34.72 
 
 		 216 aa  121  6e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1221  riboflavin synthase subunit alpha  35.03 
 
 		 226 aa  121  8e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.464139  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2809  riboflavin synthase subunit alpha  35.6 
 
 		 214 aa  121  9e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1625  riboflavin synthase subunit alpha  36.41 
 
 		 216 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00676611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1670  riboflavin synthase subunit alpha  35.47 
 
 		 226 aa  120  9.999999999999999e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.57182e-16 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1868  riboflavin synthase subunit alpha  34.85 
 
 		 220 aa  120  9.999999999999999e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2078  riboflavin synthase, alpha subunit  35.92 
 
 		 216 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00424988  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2140  riboflavin synthase subunit alpha  34.67 
 
 		 223 aa  120  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00256216 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2730  riboflavin synthase subunit alpha  31.98 
 
 		 215 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.964623 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1016  riboflavin synthase subunit alpha  35.6 
 
 		 214 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2097  riboflavin synthase subunit alpha  34.87 
 
 		 199 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0312217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2741  riboflavin synthase subunit alpha  34.9 
 
 		 215 aa  119  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2252  riboflavin synthase subunit alpha  35 
 
 		 200 aa  119  3.9999999999999996e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.743387 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3417  riboflavin synthase subunit alpha  34.02 
 
 		 196 aa  119  3.9999999999999996e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.544383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1675  riboflavin synthase subunit alpha  36.32 
 
 		 222 aa  119  3.9999999999999996e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.420891  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2030  riboflavin synthase, alpha subunit  36.46 
 
 		 211 aa  119  3.9999999999999996e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>