More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1908 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1908  riboflavin synthase subunit alpha  100 
 
 
201 aa  410  1e-114  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000158987  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0555  riboflavin synthase subunit alpha  70.59 
 
 
204 aa  296  1e-79  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.560873  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1099  riboflavin synthase subunit alpha  67.33 
 
 
202 aa  289  2e-77  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.680954  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0512  riboflavin synthase subunit alpha  64.04 
 
 
203 aa  275  2e-73  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00148394  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1231  riboflavin synthase subunit alpha  63.55 
 
 
203 aa  276  2e-73  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000560393  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1353  riboflavin synthase subunit alpha  63.55 
 
 
203 aa  271  5.000000000000001e-72  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1445  riboflavin synthase subunit alpha  59.9 
 
 
207 aa  268  2.9999999999999997e-71  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.575179  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0712  riboflavin synthase subunit alpha  62.75 
 
 
204 aa  266  2e-70  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1825  riboflavin synthase, alpha subunit  51.98 
 
 
202 aa  228  7e-59  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1930  riboflavin synthase subunit alpha  49.26 
 
 
203 aa  209  2e-53  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1860  riboflavin synthase subunit alpha  46.2 
 
 
217 aa  146  2.0000000000000003e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0164931  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0009  riboflavin synthase subunit alpha  42.49 
 
 
208 aa  144  8.000000000000001e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11410  riboflavin synthase subunit alpha  42.27 
 
 
219 aa  140  9e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.593747  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1046  riboflavin synthase subunit alpha  41.75 
 
 
219 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1522  riboflavin synthase, alpha subunit  36.46 
 
 
217 aa  139  3.9999999999999997e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0515  riboflavin synthase subunit alpha  39.18 
 
 
221 aa  138  6e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0561  riboflavin synthase subunit alpha  39.18 
 
 
221 aa  138  6e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0550  riboflavin synthase subunit alpha  39.18 
 
 
221 aa  138  6e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0731  riboflavin synthase subunit alpha  35.44 
 
 
232 aa  137  1e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1750  riboflavin synthase, alpha subunit  40.21 
 
 
213 aa  137  1e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.206972  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01419  riboflavin synthase subunit alpha  39.38 
 
 
220 aa  136  2e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000127826  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004264  riboflavin synthase alpha chain  37.11 
 
 
217 aa  135  3.0000000000000003e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000121594  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0568  riboflavin synthase subunit alpha  38.66 
 
 
221 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0167  riboflavin synthase subunit alpha  39.59 
 
 
223 aa  135  3.0000000000000003e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3856  riboflavin synthase subunit alpha  45.57 
 
 
220 aa  135  5e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4461  riboflavin synthase subunit alpha  44.94 
 
 
220 aa  135  5e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.770295  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5018  riboflavin synthase subunit alpha  47.47 
 
 
220 aa  135  5e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01167  riboflavin synthase subunit alpha  42.41 
 
 
217 aa  135  5e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1441  riboflavin synthase subunit alpha  36.76 
 
 
220 aa  134  9.999999999999999e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0691  riboflavin synthase, alpha subunit  44.94 
 
 
220 aa  132  3e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06730  riboflavin synthase subunit alpha  46.79 
 
 
219 aa  132  3e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0923  riboflavin synthase subunit alpha  39.74 
 
 
218 aa  131  7.999999999999999e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3478  riboflavin synthase, alpha subunit  37.44 
 
 
200 aa  130  1.0000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0244211  normal  0.131699 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1016  riboflavin synthase subunit alpha  38.22 
 
 
214 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1145  riboflavin synthase subunit alpha  36.14 
 
 
217 aa  129  3e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000276723  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3463  hypothetical protein  36.98 
 
 
199 aa  128  6e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1097  riboflavin synthase subunit alpha  38.78 
 
 
218 aa  128  6e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0107827  normal  0.803042 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1163  riboflavin synthase subunit alpha  38.78 
 
 
218 aa  128  6e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.166605  normal  0.121939 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2005  riboflavin synthase subunit alpha  36.79 
 
 
218 aa  128  6e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0140108  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1073  riboflavin synthase subunit alpha  34.72 
 
 
215 aa  127  9.000000000000001e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0177  riboflavin synthase subunit alpha  37.95 
 
 
210 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.767417  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3468  riboflavin synthase subunit alpha  38.27 
 
 
218 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4221  riboflavin synthase subunit alpha  37.7 
 
 
214 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1036  riboflavin synthase subunit alpha  39.06 
 
 
219 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00015592  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1097  riboflavin synthase subunit alpha  38.27 
 
 
218 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0146706  normal  0.608902 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0547  riboflavin synthase subunit alpha  35.03 
 
 
217 aa  125  3e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0531  riboflavin synthase subunit alpha  35.03 
 
 
217 aa  125  5e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.990747  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2777  riboflavin synthase subunit alpha  37.76 
 
 
218 aa  125  6e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0829317  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3158  riboflavin synthase subunit alpha  38.27 
 
 
218 aa  124  6e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00280959  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1446  riboflavin synthase subunit alpha  34.65 
 
 
216 aa  124  8.000000000000001e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1383  riboflavin synthase subunit alpha  37.76 
 
 
220 aa  124  8.000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00417649  hitchhiker  0.000000386622 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3159  riboflavin synthase subunit alpha  37.76 
 
 
218 aa  124  1e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00317838  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1254  riboflavin synthase subunit alpha  40.53 
 
 
209 aa  124  1e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1188  riboflavin synthase subunit alpha  38.07 
 
 
221 aa  124  1e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0484679  normal  0.881373 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1212  riboflavin synthase subunit alpha  37.76 
 
 
218 aa  124  1e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.254692 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2741  riboflavin synthase subunit alpha  38.07 
 
 
215 aa  124  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0847  riboflavin synthase subunit alpha  38.42 
 
 
206 aa  123  1e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000849301  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0386  riboflavin synthase subunit alpha  37.76 
 
 
214 aa  124  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2238  riboflavin synthase subunit alpha  37.7 
 
 
215 aa  123  2e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1312  riboflavin synthase subunit alpha  34.6 
 
 
221 aa  123  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.903669  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2809  riboflavin synthase subunit alpha  34.55 
 
 
214 aa  123  2e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18150  riboflavin synthase, alpha subunit  36.18 
 
 
200 aa  122  3e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1274  riboflavin synthase subunit alpha  37 
 
 
220 aa  122  3e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000236102  hitchhiker  0.00000000155009 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2925  riboflavin synthase subunit alpha  37.56 
 
 
215 aa  122  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1078  riboflavin synthase subunit alpha  35.86 
 
 
205 aa  122  4e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0775  riboflavin synthase subunit alpha  41.51 
 
 
209 aa  122  5e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.509273  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0130  riboflavin synthase subunit alpha  37.89 
 
 
198 aa  121  6e-27  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0226834  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1560  riboflavin synthase, alpha subunit  39.18 
 
 
220 aa  121  6e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3302  riboflavin synthase subunit alpha  36.22 
 
 
218 aa  121  6e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.121431  decreased coverage  0.000098078 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2833  riboflavin synthase subunit alpha  37.56 
 
 
215 aa  121  6e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.226498  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04399  riboflavin synthase subunit alpha  37.06 
 
 
200 aa  121  7e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1009  riboflavin synthase, alpha subunit  40.24 
 
 
208 aa  121  9e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0747  riboflavin synthase subunit alpha  34.54 
 
 
216 aa  120  9.999999999999999e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.341199  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1758  riboflavin synthase subunit alpha  37.85 
 
 
218 aa  120  9.999999999999999e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2667  riboflavin synthase subunit alpha  37.38 
 
 
214 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0474  riboflavin synthase, alpha subunit  34.34 
 
 
218 aa  120  9.999999999999999e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000469056 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2469  riboflavin synthase subunit alpha  37.44 
 
 
223 aa  120  9.999999999999999e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.032999 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0298  riboflavin synthase, alpha subunit  34.34 
 
 
218 aa  120  9.999999999999999e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1765  riboflavin synthase, alpha subunit  36.84 
 
 
214 aa  119  1.9999999999999998e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2182  riboflavin synthase subunit alpha  36.27 
 
 
215 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000398274  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2024  riboflavin synthase subunit alpha  38.42 
 
 
218 aa  119  3e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1399  riboflavin synthase subunit alpha  39.05 
 
 
221 aa  119  3e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.706898  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0239  riboflavin synthase subunit alpha  33.85 
 
 
202 aa  119  3e-26  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07100  riboflavin synthase, alpha subunit  35.05 
 
 
223 aa  119  3e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.283211 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0773  riboflavin synthase subunit alpha  37.76 
 
 
202 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2946  riboflavin synthase subunit alpha  35.61 
 
 
205 aa  118  4.9999999999999996e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.175022  normal  0.644585 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1868  riboflavin synthase subunit alpha  38.97 
 
 
220 aa  118  6e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0061  riboflavin synthase subunit alpha  33.16 
 
 
218 aa  118  6e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.201459  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0916  riboflavin synthase subunit alpha  40.82 
 
 
217 aa  118  6e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00048096  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3417  riboflavin synthase subunit alpha  35.79 
 
 
196 aa  118  6e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.544383  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3942  riboflavin synthase subunit alpha  36.87 
 
 
214 aa  118  6e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2354  riboflavin synthase, alpha subunit  35.9 
 
 
215 aa  118  7e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0725923  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1868  riboflavin synthase, alpha subunit  36.08 
 
 
216 aa  118  7e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0165858  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1696  riboflavin synthase, alpha subunit  33.33 
 
 
196 aa  118  7e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.375182  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2730  riboflavin synthase subunit alpha  37.5 
 
 
215 aa  118  7e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.964623 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1017  riboflavin synthase subunit alpha  39.06 
 
 
217 aa  118  7e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.743536  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0937  riboflavin synthase, alpha subunit  36.22 
 
 
217 aa  117  9e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2140  riboflavin synthase subunit alpha  36.92 
 
 
223 aa  117  9e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00256216 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0853  riboflavin synthase subunit alpha  35.6 
 
 
200 aa  117  9e-26  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4244  riboflavin synthase subunit alpha  37.37 
 
 
214 aa  117  9e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>