More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1445 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1445  riboflavin synthase subunit alpha  100 
 
 		 207 aa  422  1e-117  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.575179  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1908  riboflavin synthase subunit alpha  59.9 
 
 		 201 aa  268  2.9999999999999997e-71  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000158987  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0555  riboflavin synthase subunit alpha  60.87 
 
 		 204 aa  263  2e-69  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.560873  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1231  riboflavin synthase subunit alpha  58.45 
 
 		 203 aa  254  7e-67  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000560393  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0512  riboflavin synthase subunit alpha  57.97 
 
 		 203 aa  251  7e-66  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00148394  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0712  riboflavin synthase subunit alpha  56.46 
 
 		 204 aa  250  8.000000000000001e-66  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1353  riboflavin synthase subunit alpha  57.49 
 
 		 203 aa  247  8e-65  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1099  riboflavin synthase subunit alpha  55.07 
 
 		 202 aa  243  1.9999999999999999e-63  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.680954  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1930  riboflavin synthase subunit alpha  53.14 
 
 		 203 aa  221  7e-57  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1825  riboflavin synthase, alpha subunit  50.24 
 
 		 202 aa  211  5.999999999999999e-54  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0009  riboflavin synthase subunit alpha  37.68 
 
 		 208 aa  150  1e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0923  riboflavin synthase subunit alpha  37.11 
 
 		 218 aa  140  9.999999999999999e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1221  riboflavin synthase subunit alpha  37.86 
 
 		 226 aa  138  6e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.464139  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11410  riboflavin synthase subunit alpha  38.19 
 
 		 219 aa  138  6e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.593747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004264  riboflavin synthase alpha chain  40.72 
 
 		 217 aa  138  6e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000121594  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1860  riboflavin synthase subunit alpha  40.76 
 
 		 217 aa  138  6e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0164931  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0167  riboflavin synthase subunit alpha  40.1 
 
 		 223 aa  138  7e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1046  riboflavin synthase subunit alpha  37.69 
 
 		 219 aa  137  8.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0731  riboflavin synthase subunit alpha  34.78 
 
 		 232 aa  136  2e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2182  riboflavin synthase subunit alpha  35.27 
 
 		 215 aa  137  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000398274  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0177  riboflavin synthase subunit alpha  39.2 
 
 		 210 aa  135  3.0000000000000003e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.767417  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1441  riboflavin synthase subunit alpha  34.43 
 
 		 220 aa  135  3.0000000000000003e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01419  riboflavin synthase subunit alpha  36.41 
 
 		 220 aa  134  6.0000000000000005e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000127826  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1868  riboflavin synthase subunit alpha  35.92 
 
 		 220 aa  134  7.000000000000001e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01167  riboflavin synthase subunit alpha  40.51 
 
 		 217 aa  134  9.999999999999999e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0568  riboflavin synthase subunit alpha  36.6 
 
 		 221 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0515  riboflavin synthase subunit alpha  36.6 
 
 		 221 aa  132  3e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0550  riboflavin synthase subunit alpha  36.6 
 
 		 221 aa  132  3e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1145  riboflavin synthase subunit alpha  32.21 
 
 		 217 aa  132  3e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000276723  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0561  riboflavin synthase subunit alpha  36.6 
 
 		 221 aa  132  3e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5018  riboflavin synthase subunit alpha  36.18 
 
 		 220 aa  132  5e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1312  riboflavin synthase subunit alpha  33.02 
 
 		 221 aa  131  6e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.903669  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2925  riboflavin synthase subunit alpha  36.54 
 
 		 215 aa  130  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2833  riboflavin synthase subunit alpha  36.54 
 
 		 215 aa  129  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.226498  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1522  riboflavin synthase, alpha subunit  35.82 
 
 		 217 aa  130  2.0000000000000002e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2741  riboflavin synthase subunit alpha  36.54 
 
 		 215 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06730  riboflavin synthase subunit alpha  38.98 
 
 		 219 aa  130  2.0000000000000002e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1875  riboflavin synthase subunit alpha  35.1 
 
 		 221 aa  129  2.0000000000000002e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.816365 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1868  riboflavin synthase, alpha subunit  35.5 
 
 		 216 aa  129  3e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0165858  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2597  riboflavin synthase subunit alpha  34.38 
 
 		 193 aa  129  4.0000000000000003e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.195355  normal  0.238083 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2024  riboflavin synthase subunit alpha  37.11 
 
 		 218 aa  129  4.0000000000000003e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3023  riboflavin synthase subunit alpha  34.48 
 
 		 214 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.20126  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1227  riboflavin synthase subunit alpha  34.48 
 
 		 214 aa  128  5.0000000000000004e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00725897 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2730  riboflavin synthase subunit alpha  36.06 
 
 		 215 aa  128  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.964623 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0604  riboflavin synthase subunit alpha  35.64 
 
 		 222 aa  126  2.0000000000000002e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.128519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2809  riboflavin synthase subunit alpha  33.83 
 
 		 214 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3856  riboflavin synthase subunit alpha  38.42 
 
 		 220 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3478  riboflavin synthase, alpha subunit  33.51 
 
 		 200 aa  126  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0244211  normal  0.131699 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3468  riboflavin synthase subunit alpha  32.51 
 
 		 218 aa  125  3e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0691  riboflavin synthase, alpha subunit  35.68 
 
 		 220 aa  126  3e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4461  riboflavin synthase subunit alpha  35.18 
 
 		 220 aa  126  3e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.770295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0474  riboflavin synthase, alpha subunit  35.94 
 
 		 218 aa  125  3e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000469056 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0298  riboflavin synthase, alpha subunit  35.94 
 
 		 218 aa  125  3e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1758  riboflavin synthase subunit alpha  35.18 
 
 		 218 aa  125  4.0000000000000003e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1097  riboflavin synthase subunit alpha  32.51 
 
 		 218 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0107827  normal  0.803042 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1163  riboflavin synthase subunit alpha  32.51 
 
 		 218 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.166605  normal  0.121939 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1097  riboflavin synthase subunit alpha  32.51 
 
 		 218 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0146706  normal  0.608902 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1016  riboflavin synthase subunit alpha  34.11 
 
 		 214 aa  125  6e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0624  riboflavin synthase subunit alpha  33.17 
 
 		 215 aa  125  7e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00110444  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1073  riboflavin synthase subunit alpha  34.52 
 
 		 215 aa  124  7e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1254  riboflavin synthase subunit alpha  34.33 
 
 		 209 aa  124  8.000000000000001e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1981  riboflavin synthase subunit alpha  34.78 
 
 		 216 aa  124  8.000000000000001e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4095  riboflavin synthase subunit alpha  32.82 
 
 		 197 aa  124  9e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1446  riboflavin synthase subunit alpha  36.79 
 
 		 216 aa  124  9e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1017  riboflavin synthase subunit alpha  32.04 
 
 		 217 aa  124  9e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.743536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1884  riboflavin synthase, alpha subunit  33.79 
 
 		 227 aa  123  2e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.219798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3158  riboflavin synthase subunit alpha  33.17 
 
 		 218 aa  123  2e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00280959  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0847  riboflavin synthase subunit alpha  36.92 
 
 		 206 aa  123  2e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000849301  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0853  riboflavin synthase subunit alpha  36.04 
 
 		 200 aa  123  2e-27  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2777  riboflavin synthase subunit alpha  32.68 
 
 		 218 aa  123  2e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0829317  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1036  riboflavin synthase subunit alpha  32.99 
 
 		 219 aa  123  2e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00015592  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4221  riboflavin synthase subunit alpha  33.64 
 
 		 214 aa  122  3e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1773  riboflavin synthase subunit alpha  34.18 
 
 		 217 aa  122  3e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0488322  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3159  riboflavin synthase subunit alpha  32.68 
 
 		 218 aa  122  4e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00317838  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1212  riboflavin synthase subunit alpha  32.68 
 
 		 218 aa  122  4e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.254692 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0239  riboflavin synthase subunit alpha  34.36 
 
 		 202 aa  122  4e-27  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2005  riboflavin synthase subunit alpha  31.43 
 
 		 218 aa  122  5e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0140108  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2693  riboflavin synthase subunit alpha  34.98 
 
 		 205 aa  121  6e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2809  riboflavin synthase subunit alpha  36.41 
 
 		 214 aa  121  8e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.352562  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3959  riboflavin synthase, alpha subunit  32.68 
 
 		 207 aa  121  9e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0989485 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04961  riboflavin synthase subunit alpha  33.67 
 
 		 217 aa  120  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.184408 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2779  riboflavin synthase, alpha subunit  36.08 
 
 		 211 aa  120  9.999999999999999e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2078  riboflavin synthase, alpha subunit  33.17 
 
 		 216 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00424988  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3302  riboflavin synthase subunit alpha  32.2 
 
 		 218 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.121431  decreased coverage  0.000098078 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3362  riboflavin synthase, alpha subunit  31.88 
 
 		 212 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0547  riboflavin synthase subunit alpha  35.2 
 
 		 217 aa  120  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0531  riboflavin synthase subunit alpha  35.2 
 
 		 217 aa  120  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.990747  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0386  riboflavin synthase subunit alpha  35.32 
 
 		 214 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1372  riboflavin synthase subunit alpha  37.06 
 
 		 199 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.336061  normal  0.17313 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0775  riboflavin synthase subunit alpha  36.25 
 
 		 209 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.509273  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0761  riboflavin synthase subunit alpha  35.03 
 
 		 202 aa  120  1.9999999999999998e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1009  riboflavin synthase, alpha subunit  37.2 
 
 		 208 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3457  riboflavin synthase subunit alpha  33.51 
 
 		 220 aa  119  1.9999999999999998e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766476 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1188  riboflavin synthase subunit alpha  31.98 
 
 		 221 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0484679  normal  0.881373 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0899  riboflavin synthase subunit alpha  35.05 
 
 		 219 aa  119  1.9999999999999998e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.484781  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0747  riboflavin synthase subunit alpha  34.12 
 
 		 216 aa  119  3e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.341199  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3721  riboflavin synthase subunit alpha  33.83 
 
 		 203 aa  119  3e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0647678 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0301  riboflavin synthase subunit alpha  31.55 
 
 		 214 aa  119  3e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.769715 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1383  riboflavin synthase subunit alpha  31 
 
 		 220 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00417649  hitchhiker  0.000000386622 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1304  riboflavin synthase, alpha subunit  36.14 
 
 		 216 aa  119  3.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.851086  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>