More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJJ81176_1231 on replicon NC_008787
Organism: Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008787  CJJ81176_1231  riboflavin synthase subunit alpha  100 
 
 		 203 aa  413  9.999999999999999e-116  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000560393  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0512  riboflavin synthase subunit alpha  98.03 
 
 		 203 aa  407  1e-113  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00148394  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1353  riboflavin synthase subunit alpha  96.55 
 
 		 203 aa  402  1e-111  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1099  riboflavin synthase subunit alpha  71.92 
 
 		 202 aa  304  5.0000000000000004e-82  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.680954  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0555  riboflavin synthase subunit alpha  70.59 
 
 		 204 aa  303  2.0000000000000002e-81  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.560873  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0712  riboflavin synthase subunit alpha  65.85 
 
 		 204 aa  280  8.000000000000001e-75  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1908  riboflavin synthase subunit alpha  63.55 
 
 		 201 aa  276  2e-73  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000158987  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1825  riboflavin synthase, alpha subunit  56.16 
 
 		 202 aa  256  2e-67  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1445  riboflavin synthase subunit alpha  58.45 
 
 		 207 aa  254  7e-67  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.575179  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1930  riboflavin synthase subunit alpha  52.71 
 
 		 203 aa  228  6e-59  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01167  riboflavin synthase subunit alpha  37.69 
 
 		 217 aa  144  6e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11410  riboflavin synthase subunit alpha  39.8 
 
 		 219 aa  144  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.593747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1046  riboflavin synthase subunit alpha  39.29 
 
 		 219 aa  143  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1657  riboflavin synthase subunit alpha  39.9 
 
 		 219 aa  142  3e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.389961  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4461  riboflavin synthase subunit alpha  39.8 
 
 		 220 aa  142  3e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.770295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004264  riboflavin synthase alpha chain  37.19 
 
 		 217 aa  141  8e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000121594  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1860  riboflavin synthase subunit alpha  37.19 
 
 		 217 aa  140  9e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0164931  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3856  riboflavin synthase subunit alpha  39.8 
 
 		 220 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1441  riboflavin synthase subunit alpha  37.56 
 
 		 220 aa  140  9.999999999999999e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1522  riboflavin synthase, alpha subunit  36.22 
 
 		 217 aa  139  1.9999999999999998e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0515  riboflavin synthase subunit alpha  39.8 
 
 		 221 aa  139  3e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0691  riboflavin synthase, alpha subunit  39.29 
 
 		 220 aa  139  3e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5018  riboflavin synthase subunit alpha  39.8 
 
 		 220 aa  139  3e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0561  riboflavin synthase subunit alpha  39.8 
 
 		 221 aa  139  3e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2005  riboflavin synthase subunit alpha  36.55 
 
 		 218 aa  139  3e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0140108  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0550  riboflavin synthase subunit alpha  39.8 
 
 		 221 aa  139  3e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1750  riboflavin synthase, alpha subunit  37.02 
 
 		 213 aa  139  3e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.206972  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0167  riboflavin synthase subunit alpha  39.38 
 
 		 223 aa  139  3e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0568  riboflavin synthase subunit alpha  39.8 
 
 		 221 aa  138  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2024  riboflavin synthase subunit alpha  38.89 
 
 		 218 aa  138  6e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1981  riboflavin synthase subunit alpha  35.92 
 
 		 216 aa  137  1e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0731  riboflavin synthase subunit alpha  36.14 
 
 		 232 aa  136  2e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2182  riboflavin synthase subunit alpha  34.88 
 
 		 215 aa  136  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000398274  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0923  riboflavin synthase subunit alpha  38.54 
 
 		 218 aa  136  2e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0009  riboflavin synthase subunit alpha  37.57 
 
 		 208 aa  134  7.000000000000001e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0747  riboflavin synthase subunit alpha  38.86 
 
 		 216 aa  134  9.999999999999999e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.341199  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1868  riboflavin synthase, alpha subunit  38.07 
 
 		 216 aa  134  9.999999999999999e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0165858  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06730  riboflavin synthase subunit alpha  38.95 
 
 		 219 aa  133  1.9999999999999998e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2777  riboflavin synthase subunit alpha  34.56 
 
 		 218 aa  132  3e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0829317  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1446  riboflavin synthase subunit alpha  35.98 
 
 		 216 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1073  riboflavin synthase subunit alpha  37.06 
 
 		 215 aa  131  7.999999999999999e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3158  riboflavin synthase subunit alpha  34.56 
 
 		 218 aa  130  9e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00280959  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3468  riboflavin synthase subunit alpha  33.18 
 
 		 218 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0298  riboflavin synthase, alpha subunit  35.26 
 
 		 218 aa  130  1.0000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0474  riboflavin synthase, alpha subunit  35.26 
 
 		 218 aa  130  1.0000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000469056 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1212  riboflavin synthase subunit alpha  34.1 
 
 		 218 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.254692 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3159  riboflavin synthase subunit alpha  34.1 
 
 		 218 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00317838  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1097  riboflavin synthase subunit alpha  33.18 
 
 		 218 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0107827  normal  0.803042 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1163  riboflavin synthase subunit alpha  33.18 
 
 		 218 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.166605  normal  0.121939 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1884  riboflavin synthase, alpha subunit  41.88 
 
 		 227 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.219798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1097  riboflavin synthase subunit alpha  33.18 
 
 		 218 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0146706  normal  0.608902 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3478  riboflavin synthase, alpha subunit  35.2 
 
 		 200 aa  129  3e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0244211  normal  0.131699 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2469  riboflavin synthase subunit alpha  36.95 
 
 		 223 aa  129  3e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.032999 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3302  riboflavin synthase subunit alpha  34.56 
 
 		 218 aa  129  3e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.121431  decreased coverage  0.000098078 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0853  riboflavin synthase subunit alpha  38.62 
 
 		 200 aa  128  4.0000000000000003e-29  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1312  riboflavin synthase subunit alpha  32.86 
 
 		 221 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.903669  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01419  riboflavin synthase subunit alpha  37.7 
 
 		 220 aa  129  4.0000000000000003e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000127826  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1595  riboflavin synthase subunit alpha  35.45 
 
 		 213 aa  128  5.0000000000000004e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000438085  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1383  riboflavin synthase subunit alpha  35.26 
 
 		 220 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00417649  hitchhiker  0.000000386622 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1254  riboflavin synthase subunit alpha  36.17 
 
 		 209 aa  126  2.0000000000000002e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1421  riboflavin synthase subunit alpha  34.39 
 
 		 220 aa  126  2.0000000000000002e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00972231  normal  0.185271 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3023  riboflavin synthase subunit alpha  34.67 
 
 		 214 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.20126  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1227  riboflavin synthase subunit alpha  34.67 
 
 		 214 aa  125  3e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00725897 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0847  riboflavin synthase subunit alpha  35.53 
 
 		 206 aa  125  4.0000000000000003e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000849301  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2078  riboflavin synthase, alpha subunit  34.17 
 
 		 216 aa  125  4.0000000000000003e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00424988  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2299  riboflavin synthase subunit alpha  35.2 
 
 		 221 aa  125  5e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.433385  hitchhiker  0.00000264198 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2766  riboflavin synthase, alpha subunit  36.27 
 
 		 201 aa  125  5e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.210112  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18150  riboflavin synthase, alpha subunit  35.42 
 
 		 200 aa  124  7e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1617  riboflavin synthase subunit alpha  38.54 
 
 		 197 aa  124  8.000000000000001e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04399  riboflavin synthase subunit alpha  33.16 
 
 		 200 aa  124  8.000000000000001e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0624  riboflavin synthase subunit alpha  32.32 
 
 		 215 aa  123  1e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00110444  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2741  riboflavin synthase subunit alpha  36.02 
 
 		 215 aa  123  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1145  riboflavin synthase subunit alpha  36.31 
 
 		 217 aa  124  1e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000276723  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0177  riboflavin synthase subunit alpha  37.19 
 
 		 210 aa  124  1e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.767417  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2092  riboflavin synthase subunit alpha  38.79 
 
 		 187 aa  124  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0540242  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0604  riboflavin synthase subunit alpha  35.64 
 
 		 222 aa  123  2e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.128519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1625  riboflavin synthase subunit alpha  32.41 
 
 		 216 aa  123  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00676611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1036  riboflavin synthase subunit alpha  40.51 
 
 		 219 aa  123  2e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00015592  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2140  riboflavin synthase subunit alpha  35.82 
 
 		 223 aa  122  3e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00256216 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2730  riboflavin synthase subunit alpha  34.12 
 
 		 215 aa  122  3e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.964623 
 
 
-
 
NC_002978  WD0130  riboflavin synthase subunit alpha  37.2 
 
 		 198 aa  121  6e-27  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0226834  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3457  riboflavin synthase subunit alpha  40.25 
 
 		 220 aa  121  6e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766476 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0105  riboflavin synthase subunit alpha  34.92 
 
 		 218 aa  121  6e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2925  riboflavin synthase subunit alpha  34.6 
 
 		 215 aa  121  7e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1188  riboflavin synthase subunit alpha  34.21 
 
 		 221 aa  121  7e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0484679  normal  0.881373 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2833  riboflavin synthase subunit alpha  34.6 
 
 		 215 aa  121  7e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.226498  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1274  riboflavin synthase subunit alpha  35.79 
 
 		 220 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000236102  hitchhiker  0.00000000155009 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1163  riboflavin synthase subunit alpha  34.21 
 
 		 221 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000497127  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1689  riboflavin synthase subunit alpha  34.34 
 
 		 217 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.1872  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2189  riboflavin synthase subunit alpha  34.36 
 
 		 201 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000572802 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2238  riboflavin synthase subunit alpha  34.12 
 
 		 215 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0061  riboflavin synthase subunit alpha  31.84 
 
 		 218 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.201459  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0916  riboflavin synthase subunit alpha  36.51 
 
 		 217 aa  120  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00048096  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0829  riboflavin synthase subunit alpha  33.82 
 
 		 209 aa  119  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2384  riboflavin synthase subunit alpha  41.56 
 
 		 200 aa  119  3e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.599759  normal  0.02171 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06371  riboflavin synthase subunit alpha  34.01 
 
 		 220 aa  119  3e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0855264 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3707  riboflavin synthase, alpha subunit  32.98 
 
 		 196 aa  119  3e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1619  riboflavin synthase subunit alpha  33.51 
 
 		 218 aa  119  3.9999999999999996e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0904946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1078  riboflavin synthase subunit alpha  33.17 
 
 		 205 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1560  riboflavin synthase, alpha subunit  35.03 
 
 		 220 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>