More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B2929 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008543  Bcen2424_3191  RND efflux system outer membrane lipoprotein  85.65 
 
 
497 aa  702    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2929  RND efflux system outer membrane lipoprotein  100 
 
 
484 aa  928    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4288  RND efflux system outer membrane lipoprotein  85.96 
 
 
467 aa  710    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.22095  normal  0.428638 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4969  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  85.65 
 
 
497 aa  702    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2115  RND efflux system outer membrane lipoprotein  46.17 
 
 
497 aa  335  7.999999999999999e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1154  RND efflux system outer membrane lipoprotein  46.7 
 
 
473 aa  335  9e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.182996  normal  0.122717 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2069  multidrug efflux MFS outer membrane protein, putative  39.11 
 
 
473 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.582601 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5459  RND efflux system outer membrane lipoprotein  41.03 
 
 
493 aa  291  1e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.628466  normal  0.0370061 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3674  RND efflux system outer membrane lipoprotein  38.44 
 
 
472 aa  292  1e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5768  RND efflux system outer membrane lipoprotein  41.76 
 
 
499 aa  291  2e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.20317  normal  0.984778 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6012  RND efflux system outer membrane lipoprotein  41.53 
 
 
499 aa  289  8e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7725  RND efflux system outer membrane lipoprotein  41.09 
 
 
499 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0870  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  45.11 
 
 
493 aa  282  7.000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4081  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  41.67 
 
 
517 aa  278  2e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6151  RND efflux system outer membrane lipoprotein  41.01 
 
 
502 aa  277  3e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.808287  normal  0.205282 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6626  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  38.37 
 
 
508 aa  272  1e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4319  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  42.45 
 
 
483 aa  271  2.9999999999999997e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.239033  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2615  aromatic acid efflux system NodT family outer membrane lipoprotein  38.95 
 
 
510 aa  269  7e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4790  NodT family outer membrane lipoprotein  38.53 
 
 
496 aa  269  8.999999999999999e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.031941  normal  0.791068 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6180  RND efflux system outer membrane lipoprotein  40.43 
 
 
498 aa  263  6.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0879819  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6660  RND efflux system outer membrane lipoprotein  40.43 
 
 
498 aa  262  1e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.958876 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3621  outer membrane efflux protein  37.21 
 
 
477 aa  259  9e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.21353  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48240  putative outer membrane component of multidrug efflux pump  46.95 
 
 
482 aa  259  1e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0030067  normal  0.0214896 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4010  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  39.21 
 
 
486 aa  256  5e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.940434  normal  0.118266 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3381  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  38.27 
 
 
477 aa  256  6e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.261059  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0108  outer membrane efflux protein  42.61 
 
 
477 aa  249  1e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.998776  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0174  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  37.39 
 
 
480 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1101  outer membrane protein  36.21 
 
 
470 aa  240  4e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1086  RND efflux system outer membrane lipoprotein  37.3 
 
 
482 aa  239  9e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.981132  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5048  RND efflux system outer membrane lipoprotein  36.5 
 
 
472 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.11831  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3167  RND efflux system outer membrane lipoprotein  41.04 
 
 
480 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.487226 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2657  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  34.71 
 
 
473 aa  227  4e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0121184  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0200  RND efflux system outer membrane lipoprotein  36.27 
 
 
472 aa  227  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.844152  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2969  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  36.09 
 
 
465 aa  225  1e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.678758  normal  0.17281 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0204  RND efflux system outer membrane lipoprotein  35.71 
 
 
472 aa  225  1e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0179  RND efflux transporter  36.27 
 
 
472 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3101  outer membrane efflux protein  36.04 
 
 
465 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00986507  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2179  RND efflux system outer membrane lipoprotein  35.03 
 
 
462 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.159854  normal  0.0708517 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2509  RND efflux system outer membrane lipoprotein  35.37 
 
 
471 aa  220  5e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.293505  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2446  RND efflux system outer membrane lipoprotein  35.15 
 
 
471 aa  219  6e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.177234  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1570  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  38.44 
 
 
473 aa  219  1e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3427  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  34.72 
 
 
471 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0491334  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2809  RND efflux system outer membrane lipoprotein  33.62 
 
 
497 aa  217  4e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2335  RND efflux system outer membrane lipoprotein  34.72 
 
 
471 aa  217  4e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3274  RND efflux system outer membrane lipoprotein  33.6 
 
 
495 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1695  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  32.16 
 
 
512 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2193  RND efflux system outer membrane lipoprotein  32.34 
 
 
495 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0126086  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2127  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  31.92 
 
 
513 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3793  RND efflux system outer membrane lipoprotein  33.8 
 
 
495 aa  213  7e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.351966 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32380  multidrug efflux outer membrane protein OprN precursor  36.69 
 
 
472 aa  210  6e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0450823  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2743  outer membrane protein OprN precursor  36.06 
 
 
472 aa  208  1e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3498  RND efflux system outer membrane lipoprotein  39.83 
 
 
466 aa  207  3e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.916304  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3093  outer membrane protein  32.48 
 
 
503 aa  207  3e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2318  outer membrane protein  33.69 
 
 
479 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.510391  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2340  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  30.9 
 
 
502 aa  197  4.0000000000000005e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3899  RND efflux system outer membrane lipoprotein  32.06 
 
 
495 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.624231 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3628  RND efflux system outer membrane lipoprotein  32.06 
 
 
495 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.399788  normal  0.615306 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4467  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  32.06 
 
 
495 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.419427  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3923  outer membrane efflux protein  33.33 
 
 
569 aa  195  1e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.19723 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3360  RND efflux system outer membrane lipoprotein  34.34 
 
 
494 aa  194  3e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.414328  hitchhiker  0.00000000121747 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3709  RND efflux system outer membrane lipoprotein  35.98 
 
 
485 aa  194  3e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27410  putative outer membrane protein precursor  34.1 
 
 
479 aa  193  6e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.721932  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2616  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  35.76 
 
 
501 aa  193  7e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1085  RND efflux system outer membrane lipoprotein  36.52 
 
 
486 aa  192  8e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.377293  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0400  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  33.12 
 
 
494 aa  191  2e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4998  RND efflux system outer membrane lipoprotein  32.17 
 
 
515 aa  190  5e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.599541  normal  0.824643 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0143  RND efflux system outer membrane lipoprotein  33.94 
 
 
541 aa  190  5.999999999999999e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.302016 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1872  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  34.16 
 
 
509 aa  190  5.999999999999999e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0447  Fis family transcriptional regulator  32.31 
 
 
512 aa  189  9e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.818927 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1301  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  35.67 
 
 
514 aa  189  1e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2256  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  38.62 
 
 
478 aa  189  1e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6200  multidrug efflux system outer membrane subunit  33.96 
 
 
504 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.584656  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0284  outer membrane efflux family protein  32.87 
 
 
518 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.552621  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1397  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  35.76 
 
 
483 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0470639  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0563  RND efflux system outer membrane lipoprotein  31.42 
 
 
519 aa  184  3e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5379  RND efflux system outer membrane lipoprotein  33.91 
 
 
482 aa  184  4.0000000000000006e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.320478  normal  0.694464 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2924  RND efflux system outer membrane lipoprotein  32.14 
 
 
511 aa  184  4.0000000000000006e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0890  outer membrane protein  35.09 
 
 
480 aa  183  6e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.189882  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1595  multidrug efflux system outer membrane subunit  31.63 
 
 
520 aa  182  1e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1267  RND efflux system outer membrane lipoprotein NodT  35.27 
 
 
512 aa  182  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0522165  normal  0.0121166 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2024  RND efflux system outer membrane lipoprotein  30.3 
 
 
525 aa  181  2e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0689129  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0814  outer membrane protein  34.9 
 
 
479 aa  182  2e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1155  MFS efflux system, outer membrane porin  31.76 
 
 
511 aa  181  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0159689  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0144  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  31.13 
 
 
483 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.16245  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4684  RND efflux system outer membrane lipoprotein  33.67 
 
 
494 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00459  outer membrane protein OprN  31.88 
 
 
497 aa  181  2.9999999999999997e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.018305  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1325  major facilitator superfamily efflux pump outer membrane lipoprotein  34.6 
 
 
547 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.324666  normal  0.0263416 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5590  NodT family outer membrane lipoprotein  33.61 
 
 
485 aa  181  2.9999999999999997e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46400  Outer membrane protein  31.36 
 
 
479 aa  179  8e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4575  RND efflux system outer membrane lipoprotein  30.51 
 
 
483 aa  179  8e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1362  outer membrane efflux family protein  30.5 
 
 
558 aa  179  1e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2820  RND efflux system outer membrane lipoprotein  28.99 
 
 
517 aa  179  1e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2742  RND efflux system outer membrane lipoprotein  28.99 
 
 
517 aa  179  1e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09500  outer membrane protein  34.5 
 
 
487 aa  179  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2663  RND efflux system outer membrane lipoprotein  31.78 
 
 
496 aa  179  1e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1557  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  32.14 
 
 
495 aa  178  2e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.275301  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2240  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  32.99 
 
 
518 aa  178  2e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2426  RND efflux system outer membrane lipoprotein  31.75 
 
 
487 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.335348  normal  0.737188 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0874  RND efflux system outer membrane lipoprotein  29.91 
 
 
483 aa  177  5e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2451  RND efflux system outer membrane lipoprotein  35.83 
 
 
514 aa  177  5e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.628376 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>