75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4738 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4738  lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 		 267 aa  530  1e-149  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.282263  normal  0.965292 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4216  lytic transglycosylase, catalytic  97 
 
 		 267 aa  473  1e-132  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5443  lytic transglycosylase catalytic  91.45 
 
 		 262 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.297116  normal  0.0393072 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4841  lytic transglycosylase, catalytic  91.45 
 
 		 262 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00117575  hitchhiker  0.00476271 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3525  lytic transglycosylase, catalytic  91.45 
 
 		 262 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.69394  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3753  lytic transglycosylase catalytic  87.36 
 
 		 267 aa  420  1e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.468615  hitchhiker  0.00223581 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6507  Lytic transglycosylase catalytic  56.32 
 
 		 215 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0160  Lytic transglycosylase catalytic  48.79 
 
 		 225 aa  171  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0063  type IV secretion system protein VirB1  51.46 
 
 		 238 aa  170  2e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0069  type IV secretion system protein VirB1  51.46 
 
 		 238 aa  170  2e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.165878  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0447  putative type IV secretion system protein VirB1  55.56 
 
 		 215 aa  170  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.941196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4203  lytic transglycosylase catalytic  53.89 
 
 		 215 aa  169  3e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4854  lytic transglycosylase, catalytic  53.29 
 
 		 215 aa  166  5e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3312  lytic transglycosylase, catalytic  53.29 
 
 		 215 aa  166  5e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7537  lytic transglycosylase catalytic  47.06 
 
 		 217 aa  165  8e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.75484  normal  0.0515023 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2658  putative conjugal transfer protein, VirB1/TraA like  55.92 
 
 		 217 aa  159  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.775372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6321  lytic transglycosylase catalytic  52.07 
 
 		 262 aa  159  7e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1753  putative type IV secretion system protein VirB1  51.18 
 
 		 217 aa  154  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.660532 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0873  lytic transglycosylase catalytic  54.84 
 
 		 169 aa  153  2e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2444  Lytic transglycosylase catalytic  48.67 
 
 		 327 aa  138  7.999999999999999e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.540003 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4379  lytic transglycosylase, catalytic  42.07 
 
 		 181 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1609  Lytic transglycosylase catalytic  43.88 
 
 		 177 aa  119  3.9999999999999996e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0106  type IV secretory pathway VirB1 component  38.99 
 
 		 220 aa  115  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3520  lytic transglycosylase, catalytic  45.27 
 
 		 228 aa  112  4.0000000000000004e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.940795  n/a   
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0033  conjugal transfer protein  42.22 
 
 		 225 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0859  hypothetical protein  83.61 
 
 		 146 aa  107  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.23027 
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0104  pilx1 protein  32.67 
 
 		 215 aa  105  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.718662 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1133  Lytic transglycosylase catalytic  42.57 
 
 		 216 aa  105  8e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02998  hypothetical protein  38.64 
 
 		 316 aa  103  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7344  Lytic transglycosylase catalytic  42.54 
 
 		 270 aa  103  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.301149  normal  0.254623 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08216  conjugal transfer protein TraB  38.06 
 
 		 200 aa  102  8e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8227  type IV secretion system lytic transglycosylase VirB1  40.37 
 
 		 238 aa  101  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.998898  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6162  type IV secretion system lytic transglycosylase VirB1  36.84 
 
 		 235 aa  95.1  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151768  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1489  Lytic transglycosylase catalytic  36.3 
 
 		 215 aa  94.7  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0009  conjugal transfer protein  35.53 
 
 		 203 aa  92.8  5e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.461383  normal  0.692739 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5010  lytic transglycosylase, catalytic  39.86 
 
 		 224 aa  92.8  6e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.417776  normal  0.129751 
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0035  pilx1 protein  30.89 
 
 		 206 aa  92.4  6e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2355  Lytic transglycosylase catalytic  33.33 
 
 		 203 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2494  lytic transglycosylase, catalytic  36.3 
 
 		 194 aa  81.6  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.180368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4349  lytic transglycosylase, catalytic  31.67 
 
 		 224 aa  81.3  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1698  conjugal transfer -like protein  36.55 
 
 		 223 aa  80.1  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1397  Lytic transglycosylase catalytic  36.55 
 
 		 218 aa  80.5  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0261  Lytic transglycosylase catalytic  35.17 
 
 		 225 aa  75.5  0.0000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.385484  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6492  transport secretion system IV protein, VirB1  37.21 
 
 		 220 aa  75.1  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.733642  normal  0.924712 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5089  transport secretion system IV, VirB1 protein  32.89 
 
 		 220 aa  71.6  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4928  transport secretion system IV protein, VirB1  34.38 
 
 		 220 aa  68.9  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0562  Lytic transglycosylase catalytic  26.85 
 
 		 180 aa  64.3  0.000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0674  virB1 type IV secretion protein  30.2 
 
 		 229 aa  63.5  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0253  Lytic transglycosylase catalytic  30.84 
 
 		 164 aa  62.4  0.000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2311  lytic transglycosylase, catalytic  29.57 
 
 		 183 aa  53.5  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1544  lytic transglycosylase, catalytic  29.9 
 
 		 175 aa  53.1  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0439375  normal  0.269164 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3628  lytic transglycosylase, catalytic  26.17 
 
 		 252 aa  50.1  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2906  lytic transglycosylase, catalytic  28.57 
 
 		 306 aa  50.4  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0327296  normal  0.0416217 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0258  Type IV secretory pathway AvhB1 protein  33.9 
 
 		 189 aa  48.1  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4954  lytic transglycosylase catalytic  24.83 
 
 		 303 aa  48.5  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2644  lytic transglycosylase, catalytic  26.73 
 
 		 182 aa  47.8  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2873  lytic transglycosylase, catalytic  25.55 
 
 		 296 aa  46.6  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.113557  normal  0.33639 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2657  lytic transglycosylase, catalytic  25.17 
 
 		 267 aa  46.6  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00887082  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3099  Lytic transglycosylase catalytic  27.86 
 
 		 272 aa  46.2  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.448974  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3707  hypothetical protein  29.7 
 
 		 251 aa  46.2  0.0006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0917691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4054  lytic transglycosylase, catalytic  29.41 
 
 		 370 aa  45.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2937  hypothetical protein  25.37 
 
 		 306 aa  45.1  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.88861 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5548  lytic transglycosylase catalytic  31.16 
 
 		 268 aa  45.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00871042 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0915  lytic transglycosylase catalytic  28.68 
 
 		 378 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.423978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0474  lytic transglycosylase, catalytic  28.68 
 
 		 378 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0953  lytic transglycosylase, catalytic  28.68 
 
 		 378 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3796  lytic transglycosylase, catalytic  27.72 
 
 		 179 aa  44.3  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.823369  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2444  lytic transglycosylase catalytic  28.68 
 
 		 374 aa  43.9  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0248  Lytic transglycosylase catalytic  26.28 
 
 		 168 aa  43.1  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1591  conjugal transfer protein  25 
 
 		 173 aa  43.1  0.005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0975326  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2991  lytic transglycosylase, catalytic  26.95 
 
 		 295 aa  42.7  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.617808  normal  0.305104 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0823  lytic transglycosylase catalytic  29.79 
 
 		 372 aa  42.7  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.600223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0193  lytic transglycosylase, catalytic  26.09 
 
 		 168 aa  42.7  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0812  lytic transglycosylase, catalytic  27.94 
 
 		 372 aa  42.4  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2926  lytic transglycosylase catalytic  23.7 
 
 		 311 aa  42.4  0.008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>