87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_1489 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_1489  Lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 		 215 aa  444  1.0000000000000001e-124  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0106  type IV secretory pathway VirB1 component  51.14 
 
 		 220 aa  223  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0104  pilx1 protein  52.48 
 
 		 215 aa  222  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.718662 
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0035  pilx1 protein  48.74 
 
 		 206 aa  208  6e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0069  type IV secretion system protein VirB1  37.11 
 
 		 238 aa  111  8.000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.165878  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0063  type IV secretion system protein VirB1  37.11 
 
 		 238 aa  111  8.000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0009  conjugal transfer protein  37.63 
 
 		 203 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.461383  normal  0.692739 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3312  lytic transglycosylase, catalytic  33.64 
 
 		 215 aa  105  7e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4854  lytic transglycosylase, catalytic  33.64 
 
 		 215 aa  105  7e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6321  lytic transglycosylase catalytic  35.22 
 
 		 262 aa  103  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0447  putative type IV secretion system protein VirB1  34.15 
 
 		 215 aa  101  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.941196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4203  lytic transglycosylase catalytic  34.76 
 
 		 215 aa  98.2  9e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6507  Lytic transglycosylase catalytic  33.33 
 
 		 215 aa  95.9  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0160  Lytic transglycosylase catalytic  32.93 
 
 		 225 aa  95.1  7e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3753  lytic transglycosylase catalytic  37.32 
 
 		 267 aa  94.4  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.468615  hitchhiker  0.00223581 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4216  lytic transglycosylase, catalytic  36.62 
 
 		 267 aa  94.4  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3525  lytic transglycosylase, catalytic  36.3 
 
 		 262 aa  93.2  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.69394  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4841  lytic transglycosylase, catalytic  36.3 
 
 		 262 aa  93.2  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00117575  hitchhiker  0.00476271 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5443  lytic transglycosylase catalytic  36.3 
 
 		 262 aa  93.2  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.297116  normal  0.0393072 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4738  lytic transglycosylase catalytic  36.96 
 
 		 267 aa  93.6  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.282263  normal  0.965292 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0873  lytic transglycosylase catalytic  34.73 
 
 		 169 aa  91.3  9e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7537  lytic transglycosylase catalytic  32.91 
 
 		 217 aa  91.3  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.75484  normal  0.0515023 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1753  putative type IV secretion system protein VirB1  32.12 
 
 		 217 aa  89  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.660532 
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0033  conjugal transfer protein  33.33 
 
 		 225 aa  88.6  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2658  putative conjugal transfer protein, VirB1/TraA like  30.91 
 
 		 217 aa  87.4  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.775372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2444  Lytic transglycosylase catalytic  32.53 
 
 		 327 aa  82.8  0.000000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.540003 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02998  hypothetical protein  29.13 
 
 		 316 aa  77.8  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08216  conjugal transfer protein TraB  31.36 
 
 		 200 aa  77.4  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1609  Lytic transglycosylase catalytic  31.88 
 
 		 177 aa  73.6  0.000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3520  lytic transglycosylase, catalytic  30.41 
 
 		 228 aa  70.9  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.940795  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4379  lytic transglycosylase, catalytic  31.16 
 
 		 181 aa  70.1  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8227  type IV secretion system lytic transglycosylase VirB1  32.88 
 
 		 238 aa  67.8  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.998898  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2355  Lytic transglycosylase catalytic  32.09 
 
 		 203 aa  66.6  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2494  lytic transglycosylase, catalytic  29.71 
 
 		 194 aa  63.5  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.180368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6162  type IV secretion system lytic transglycosylase VirB1  32.09 
 
 		 235 aa  61.2  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0562  Lytic transglycosylase catalytic  30.43 
 
 		 180 aa  60.5  0.00000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1133  Lytic transglycosylase catalytic  26.39 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6296  lytic transglycosylase, catalytic  45 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.270773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4187  lytic transglycosylase, catalytic  29.93 
 
 		 166 aa  55.1  0.0000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.000629  decreased coverage  0.0000117899 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3796  lytic transglycosylase, catalytic  30.17 
 
 		 179 aa  55.1  0.0000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.823369  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1698  conjugal transfer -like protein  30.08 
 
 		 223 aa  53.5  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1397  Lytic transglycosylase catalytic  30.08 
 
 		 218 aa  53.5  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5010  lytic transglycosylase, catalytic  32.11 
 
 		 224 aa  53.1  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.417776  normal  0.129751 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0248  Lytic transglycosylase catalytic  30.43 
 
 		 168 aa  53.1  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0253  Lytic transglycosylase catalytic  34.58 
 
 		 164 aa  52.8  0.000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0193  lytic transglycosylase, catalytic  28.47 
 
 		 168 aa  52.8  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7344  Lytic transglycosylase catalytic  34.04 
 
 		 270 aa  52  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.301149  normal  0.254623 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0261  Lytic transglycosylase catalytic  29.36 
 
 		 225 aa  52.4  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.385484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4349  lytic transglycosylase, catalytic  29.06 
 
 		 224 aa  49.7  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1544  lytic transglycosylase, catalytic  28.57 
 
 		 175 aa  49.3  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0439375  normal  0.269164 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0674  virB1 type IV secretion protein  28.81 
 
 		 229 aa  48.9  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6568  lytic transglycosylase catalytic  35.14 
 
 		 269 aa  47  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2003  Lytic transglycosylase catalytic  27.94 
 
 		 207 aa  47.4  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.323498  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6298  hypothetical protein  34.62 
 
 		 265 aa  46.6  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.192208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6789  lytic transglycosylase, catalytic  40.35 
 
 		 165 aa  46.6  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2121  transglycosylase SLT domain-containing protein  38.6 
 
 		 168 aa  45.8  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0953  lytic transglycosylase, catalytic  28.57 
 
 		 378 aa  45.4  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0915  lytic transglycosylase catalytic  28.57 
 
 		 378 aa  45.4  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.423978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0474  lytic transglycosylase, catalytic  28.57 
 
 		 378 aa  45.4  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0889  transglycosylase SLT domain-containing lipoprotein  28.57 
 
 		 398 aa  45.1  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3105  Lytic transglycosylase catalytic  28.57 
 
 		 393 aa  45.1  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.375115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0823  lytic transglycosylase catalytic  29.41 
 
 		 372 aa  45.1  0.0009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.600223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4054  lytic transglycosylase, catalytic  28.57 
 
 		 370 aa  45.1  0.0009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0615  lytic transglycosylase catalytic  27.73 
 
 		 404 aa  44.3  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.659925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0812  lytic transglycosylase, catalytic  29.41 
 
 		 372 aa  44.7  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5194  type IV secretory pathway, putative lytic transglycosylase; putative exported protein  31.17 
 
 		 257 aa  44.3  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.851054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1529  hypothetical protein  31.17 
 
 		 257 aa  44.3  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2444  lytic transglycosylase catalytic  29.41 
 
 		 374 aa  44.3  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5089  transport secretion system IV, VirB1 protein  27.35 
 
 		 220 aa  44.3  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2592  Slt family transglycosylase  28.03 
 
 		 319 aa  43.9  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0014  conserved hypothetical protein, SLT family  32.73 
 
 		 192 aa  43.9  0.002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2021  Slt family transglycosylase  28.57 
 
 		 337 aa  43.5  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2311  lytic transglycosylase, catalytic  35.59 
 
 		 183 aa  43.5  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0759  Slt family transglycosylase  28.57 
 
 		 337 aa  43.5  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.404866  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3105  transglycosylase SLT domain-containing protein  28.57 
 
 		 370 aa  43.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1800  lytic transglycosylase, catalytic  24.44 
 
 		 201 aa  43.1  0.003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.474073  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3074  Slt family transglycosylase  28.57 
 
 		 370 aa  43.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1527  transglycosylase SLT domain-containing protein  28.33 
 
 		 367 aa  43.1  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.165503  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2149  transglycosylase SLT domain-containing protein  28.57 
 
 		 370 aa  43.1  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3021  Slt family transglycosylase  28.57 
 
 		 370 aa  43.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.734248  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2644  lytic transglycosylase, catalytic  35.59 
 
 		 182 aa  42.7  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6234  lytic transglycosylase catalytic  32.1 
 
 		 151 aa  42.7  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2926  lytic transglycosylase catalytic  33.33 
 
 		 311 aa  42  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0964  Lytic transglycosylase catalytic  41.82 
 
 		 153 aa  41.6  0.008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4954  lytic transglycosylase catalytic  36.21 
 
 		 303 aa  41.6  0.009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5548  lytic transglycosylase catalytic  30.68 
 
 		 268 aa  41.6  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00871042 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0163  lytic transglycosylase, catalytic  22.96 
 
 		 145 aa  41.6  0.01  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0042056  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>