36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_p0258 on replicon NC_009475
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009475  BBta_p0258  Type IV secretory pathway AvhB1 protein  100 
 
 		 189 aa  380  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4349  lytic transglycosylase, catalytic  27.52 
 
 		 224 aa  69.3  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6492  transport secretion system IV protein, VirB1  27.36 
 
 		 220 aa  62.8  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.733642  normal  0.924712 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5089  transport secretion system IV, VirB1 protein  36.19 
 
 		 220 aa  61.2  0.000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4203  lytic transglycosylase catalytic  38.26 
 
 		 215 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0447  putative type IV secretion system protein VirB1  42 
 
 		 215 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.941196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3520  lytic transglycosylase, catalytic  38.39 
 
 		 228 aa  59.3  0.00000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.940795  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7344  Lytic transglycosylase catalytic  28.16 
 
 		 270 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.301149  normal  0.254623 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4854  lytic transglycosylase, catalytic  31.64 
 
 		 215 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3312  lytic transglycosylase, catalytic  31.64 
 
 		 215 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0069  type IV secretion system protein VirB1  32.28 
 
 		 238 aa  55.8  0.0000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.165878  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0063  type IV secretion system protein VirB1  32.28 
 
 		 238 aa  55.8  0.0000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4379  lytic transglycosylase, catalytic  25.6 
 
 		 181 aa  55.5  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4928  transport secretion system IV protein, VirB1  31.43 
 
 		 220 aa  55.1  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0160  Lytic transglycosylase catalytic  32.35 
 
 		 225 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1609  Lytic transglycosylase catalytic  28.8 
 
 		 177 aa  52.8  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0674  virB1 type IV secretion protein  29.63 
 
 		 229 aa  52.8  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2658  putative conjugal transfer protein, VirB1/TraA like  32.64 
 
 		 217 aa  52.8  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.775372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6507  Lytic transglycosylase catalytic  34.51 
 
 		 215 aa  52.4  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0261  Lytic transglycosylase catalytic  31.4 
 
 		 225 aa  51.2  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.385484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4841  lytic transglycosylase, catalytic  29.38 
 
 		 262 aa  48.1  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00117575  hitchhiker  0.00476271 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3525  lytic transglycosylase, catalytic  29.38 
 
 		 262 aa  48.1  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.69394  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1698  conjugal transfer -like protein  33.33 
 
 		 223 aa  48.1  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5443  lytic transglycosylase catalytic  29.38 
 
 		 262 aa  48.1  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.297116  normal  0.0393072 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1397  Lytic transglycosylase catalytic  33.33 
 
 		 218 aa  47.8  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1753  putative type IV secretion system protein VirB1  32.46 
 
 		 217 aa  47  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.660532 
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6321  lytic transglycosylase catalytic  26.76 
 
 		 262 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4216  lytic transglycosylase, catalytic  32.5 
 
 		 267 aa  46.6  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4738  lytic transglycosylase catalytic  32.69 
 
 		 267 aa  45.4  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.282263  normal  0.965292 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02998  hypothetical protein  31.31 
 
 		 316 aa  45.4  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5010  lytic transglycosylase, catalytic  26.16 
 
 		 224 aa  45.1  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.417776  normal  0.129751 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08216  conjugal transfer protein TraB  26.14 
 
 		 200 aa  44.7  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0033  conjugal transfer protein  32.73 
 
 		 225 aa  43.5  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3753  lytic transglycosylase catalytic  31.19 
 
 		 267 aa  42.4  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.468615  hitchhiker  0.00223581 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1133  Lytic transglycosylase catalytic  28 
 
 		 216 aa  41.6  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7537  lytic transglycosylase catalytic  30.85 
 
 		 217 aa  41.2  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.75484  normal  0.0515023 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>