53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_6321 on replicon NC_010509
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010509  Mrad2831_6321  lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 		 262 aa  518  1e-146  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0069  type IV secretion system protein VirB1  56.65 
 
 		 238 aa  264  1e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.165878  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0063  type IV secretion system protein VirB1  56.65 
 
 		 238 aa  264  1e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0160  Lytic transglycosylase catalytic  50.72 
 
 		 225 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0447  putative type IV secretion system protein VirB1  55.49 
 
 		 215 aa  182  7e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.941196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1753  putative type IV secretion system protein VirB1  49.55 
 
 		 217 aa  176  5e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.660532 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6507  Lytic transglycosylase catalytic  48.13 
 
 		 215 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7537  lytic transglycosylase catalytic  50.28 
 
 		 217 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.75484  normal  0.0515023 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4203  lytic transglycosylase catalytic  49.4 
 
 		 215 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2658  putative conjugal transfer protein, VirB1/TraA like  52.83 
 
 		 217 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.775372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4854  lytic transglycosylase, catalytic  48.55 
 
 		 215 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3312  lytic transglycosylase, catalytic  48.55 
 
 		 215 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4841  lytic transglycosylase, catalytic  47.22 
 
 		 262 aa  161  9e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00117575  hitchhiker  0.00476271 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3525  lytic transglycosylase, catalytic  47.22 
 
 		 262 aa  161  9e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.69394  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5443  lytic transglycosylase catalytic  47.22 
 
 		 262 aa  161  9e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.297116  normal  0.0393072 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4216  lytic transglycosylase, catalytic  52.07 
 
 		 267 aa  157  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4738  lytic transglycosylase catalytic  52.41 
 
 		 267 aa  156  4e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.282263  normal  0.965292 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3753  lytic transglycosylase catalytic  52.07 
 
 		 267 aa  155  6e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.468615  hitchhiker  0.00223581 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0873  lytic transglycosylase catalytic  48.8 
 
 		 169 aa  149  3e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2444  Lytic transglycosylase catalytic  42.8 
 
 		 327 aa  146  3e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.540003 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1609  Lytic transglycosylase catalytic  41.92 
 
 		 177 aa  119  4.9999999999999996e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0106  type IV secretory pathway VirB1 component  36.54 
 
 		 220 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08216  conjugal transfer protein TraB  38.46 
 
 		 200 aa  108  7.000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02998  hypothetical protein  38.71 
 
 		 316 aa  108  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0104  pilx1 protein  34.64 
 
 		 215 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.718662 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3520  lytic transglycosylase, catalytic  39.87 
 
 		 228 aa  106  3e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.940795  n/a   
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0033  conjugal transfer protein  35.33 
 
 		 225 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1489  Lytic transglycosylase catalytic  35.22 
 
 		 215 aa  103  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4379  lytic transglycosylase, catalytic  41.21 
 
 		 181 aa  102  5e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0009  conjugal transfer protein  34.44 
 
 		 203 aa  100  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.461383  normal  0.692739 
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0035  pilx1 protein  30.41 
 
 		 206 aa  97.4  2e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5010  lytic transglycosylase, catalytic  40.22 
 
 		 224 aa  95.9  5e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.417776  normal  0.129751 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4349  lytic transglycosylase, catalytic  35.08 
 
 		 224 aa  94.7  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2355  Lytic transglycosylase catalytic  33.53 
 
 		 203 aa  92  9e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7344  Lytic transglycosylase catalytic  42.62 
 
 		 270 aa  90.5  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.301149  normal  0.254623 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1133  Lytic transglycosylase catalytic  40.77 
 
 		 216 aa  89.7  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6492  transport secretion system IV protein, VirB1  33.5 
 
 		 220 aa  88.6  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.733642  normal  0.924712 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0261  Lytic transglycosylase catalytic  34.39 
 
 		 225 aa  84.3  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.385484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2494  lytic transglycosylase, catalytic  35.98 
 
 		 194 aa  84  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.180368  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1698  conjugal transfer -like protein  34.81 
 
 		 223 aa  82.4  0.000000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1397  Lytic transglycosylase catalytic  34.81 
 
 		 218 aa  81.6  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5089  transport secretion system IV, VirB1 protein  40 
 
 		 220 aa  80.5  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4928  transport secretion system IV protein, VirB1  41.82 
 
 		 220 aa  80.9  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0674  virB1 type IV secretion protein  38.74 
 
 		 229 aa  75.5  0.0000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6162  type IV secretion system lytic transglycosylase VirB1  34.15 
 
 		 235 aa  73.9  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8227  type IV secretion system lytic transglycosylase VirB1  31.85 
 
 		 238 aa  68.2  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.998898  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0562  Lytic transglycosylase catalytic  36.56 
 
 		 180 aa  57.8  0.0000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0253  Lytic transglycosylase catalytic  30.85 
 
 		 164 aa  57.4  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0258  Type IV secretory pathway AvhB1 protein  26.76 
 
 		 189 aa  46.2  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2926  lytic transglycosylase catalytic  25.96 
 
 		 311 aa  43.1  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0846  TonB-dependent receptor, plug  31.73 
 
 		 879 aa  42.4  0.007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0458483 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2906  lytic transglycosylase, catalytic  30.3 
 
 		 306 aa  42  0.009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0327296  normal  0.0416217 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3628  lytic transglycosylase, catalytic  31.43 
 
 		 252 aa  42  0.009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>