52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6507 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6507  Lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 		 215 aa  431  1e-120  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1753  putative type IV secretion system protein VirB1  61.75 
 
 		 217 aa  247  1e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.660532 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2658  putative conjugal transfer protein, VirB1/TraA like  62.67 
 
 		 217 aa  247  1e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.775372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0160  Lytic transglycosylase catalytic  54.98 
 
 		 225 aa  212  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0447  putative type IV secretion system protein VirB1  56.71 
 
 		 215 aa  207  8e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.941196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4203  lytic transglycosylase catalytic  56.67 
 
 		 215 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4854  lytic transglycosylase, catalytic  49.55 
 
 		 215 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3312  lytic transglycosylase, catalytic  49.55 
 
 		 215 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0069  type IV secretion system protein VirB1  53.01 
 
 		 238 aa  176  3e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.165878  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3753  lytic transglycosylase catalytic  56.82 
 
 		 267 aa  176  3e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.468615  hitchhiker  0.00223581 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0063  type IV secretion system protein VirB1  53.01 
 
 		 238 aa  176  3e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4841  lytic transglycosylase, catalytic  57.31 
 
 		 262 aa  174  8e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00117575  hitchhiker  0.00476271 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5443  lytic transglycosylase catalytic  57.31 
 
 		 262 aa  174  8e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.297116  normal  0.0393072 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3525  lytic transglycosylase, catalytic  57.31 
 
 		 262 aa  174  8e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.69394  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6321  lytic transglycosylase catalytic  48.13 
 
 		 262 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4216  lytic transglycosylase, catalytic  55.17 
 
 		 267 aa  170  1e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4738  lytic transglycosylase catalytic  56.14 
 
 		 267 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.282263  normal  0.965292 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7537  lytic transglycosylase catalytic  47.14 
 
 		 217 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.75484  normal  0.0515023 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0873  lytic transglycosylase catalytic  49.68 
 
 		 169 aa  143  3e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2444  Lytic transglycosylase catalytic  46.43 
 
 		 327 aa  118  6e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.540003 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1609  Lytic transglycosylase catalytic  41.14 
 
 		 177 aa  117  9.999999999999999e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4379  lytic transglycosylase, catalytic  45.1 
 
 		 181 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5010  lytic transglycosylase, catalytic  39.46 
 
 		 224 aa  105  4e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.417776  normal  0.129751 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3520  lytic transglycosylase, catalytic  39.53 
 
 		 228 aa  103  2e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.940795  n/a   
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0033  conjugal transfer protein  38.41 
 
 		 225 aa  101  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0106  type IV secretory pathway VirB1 component  35.9 
 
 		 220 aa  100  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08216  conjugal transfer protein TraB  32.58 
 
 		 200 aa  100  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02998  hypothetical protein  31.09 
 
 		 316 aa  99.8  3e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0009  conjugal transfer protein  30.48 
 
 		 203 aa  97.8  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.461383  normal  0.692739 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4349  lytic transglycosylase, catalytic  36.57 
 
 		 224 aa  96.7  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1489  Lytic transglycosylase catalytic  33.33 
 
 		 215 aa  95.9  4e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0104  pilx1 protein  30.93 
 
 		 215 aa  96.3  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.718662 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6162  type IV secretion system lytic transglycosylase VirB1  38.82 
 
 		 235 aa  95.1  7e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7344  Lytic transglycosylase catalytic  44.19 
 
 		 270 aa  93.6  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.301149  normal  0.254623 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5089  transport secretion system IV, VirB1 protein  38.96 
 
 		 220 aa  90.5  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0261  Lytic transglycosylase catalytic  40.62 
 
 		 225 aa  89.4  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.385484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1698  conjugal transfer -like protein  39.35 
 
 		 223 aa  87  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1397  Lytic transglycosylase catalytic  39.35 
 
 		 218 aa  87  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0674  virB1 type IV secretion protein  34.19 
 
 		 229 aa  85.1  7e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1133  Lytic transglycosylase catalytic  44.62 
 
 		 216 aa  84.7  9e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0035  pilx1 protein  32.26 
 
 		 206 aa  84  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6492  transport secretion system IV protein, VirB1  33.49 
 
 		 220 aa  82.8  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.733642  normal  0.924712 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8227  type IV secretion system lytic transglycosylase VirB1  35.37 
 
 		 238 aa  82  0.000000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.998898  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2494  lytic transglycosylase, catalytic  38.41 
 
 		 194 aa  78.6  0.00000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.180368  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2355  Lytic transglycosylase catalytic  34 
 
 		 203 aa  78.6  0.00000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4928  transport secretion system IV protein, VirB1  37.41 
 
 		 220 aa  77.8  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0562  Lytic transglycosylase catalytic  37.37 
 
 		 180 aa  62.8  0.000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0253  Lytic transglycosylase catalytic  30.56 
 
 		 164 aa  57  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0258  Type IV secretory pathway AvhB1 protein  34.51 
 
 		 189 aa  52.4  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1591  conjugal transfer protein  23.49 
 
 		 173 aa  42.7  0.004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0975326  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1544  lytic transglycosylase, catalytic  27.37 
 
 		 175 aa  42  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0439375  normal  0.269164 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2311  lytic transglycosylase, catalytic  29.23 
 
 		 183 aa  41.6  0.01  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>