67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1609 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_1609  Lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 		 177 aa  366  1e-101  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4379  lytic transglycosylase, catalytic  43.36 
 
 		 181 aa  122  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0447  putative type IV secretion system protein VirB1  44.23 
 
 		 215 aa  120  8e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.941196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6321  lytic transglycosylase catalytic  41.92 
 
 		 262 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4203  lytic transglycosylase catalytic  42.86 
 
 		 215 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4738  lytic transglycosylase catalytic  43.88 
 
 		 267 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.282263  normal  0.965292 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0069  type IV secretion system protein VirB1  42.77 
 
 		 238 aa  118  3.9999999999999996e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.165878  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0063  type IV secretion system protein VirB1  42.77 
 
 		 238 aa  118  3.9999999999999996e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5443  lytic transglycosylase catalytic  45.19 
 
 		 262 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.297116  normal  0.0393072 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3525  lytic transglycosylase, catalytic  45.19 
 
 		 262 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.69394  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4841  lytic transglycosylase, catalytic  45.19 
 
 		 262 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00117575  hitchhiker  0.00476271 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6507  Lytic transglycosylase catalytic  41.14 
 
 		 215 aa  117  9e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2355  Lytic transglycosylase catalytic  43.66 
 
 		 203 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4854  lytic transglycosylase, catalytic  40.24 
 
 		 215 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3312  lytic transglycosylase, catalytic  40.24 
 
 		 215 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3753  lytic transglycosylase catalytic  44.44 
 
 		 267 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.468615  hitchhiker  0.00223581 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4216  lytic transglycosylase, catalytic  42.96 
 
 		 267 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0160  Lytic transglycosylase catalytic  44.06 
 
 		 225 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7537  lytic transglycosylase catalytic  41.48 
 
 		 217 aa  108  5e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.75484  normal  0.0515023 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2658  putative conjugal transfer protein, VirB1/TraA like  40.37 
 
 		 217 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.775372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5010  lytic transglycosylase, catalytic  45.32 
 
 		 224 aa  105  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.417776  normal  0.129751 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0873  lytic transglycosylase catalytic  40.29 
 
 		 169 aa  105  4e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6162  type IV secretion system lytic transglycosylase VirB1  43.07 
 
 		 235 aa  105  5e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8227  type IV secretion system lytic transglycosylase VirB1  42.55 
 
 		 238 aa  104  7e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.998898  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3520  lytic transglycosylase, catalytic  44.53 
 
 		 228 aa  104  8e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.940795  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4349  lytic transglycosylase, catalytic  42.25 
 
 		 224 aa  103  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2494  lytic transglycosylase, catalytic  46.76 
 
 		 194 aa  102  3e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.180368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1753  putative type IV secretion system protein VirB1  40.94 
 
 		 217 aa  99.4  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.660532 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1698  conjugal transfer -like protein  41.54 
 
 		 223 aa  96.3  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1397  Lytic transglycosylase catalytic  41.54 
 
 		 218 aa  96.3  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1133  Lytic transglycosylase catalytic  36.62 
 
 		 216 aa  95.1  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0261  Lytic transglycosylase catalytic  39.39 
 
 		 225 aa  94.7  5e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.385484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7344  Lytic transglycosylase catalytic  34.56 
 
 		 270 aa  94.4  7e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.301149  normal  0.254623 
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0009  conjugal transfer protein  38.82 
 
 		 203 aa  92  4e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.461383  normal  0.692739 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0674  virB1 type IV secretion protein  34.64 
 
 		 229 aa  88.6  4e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5089  transport secretion system IV, VirB1 protein  36.36 
 
 		 220 aa  86.7  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6492  transport secretion system IV protein, VirB1  41.82 
 
 		 220 aa  85.1  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.733642  normal  0.924712 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4928  transport secretion system IV protein, VirB1  46.94 
 
 		 220 aa  84.3  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2444  Lytic transglycosylase catalytic  37.24 
 
 		 327 aa  82.8  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.540003 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0106  type IV secretory pathway VirB1 component  33.09 
 
 		 220 aa  80.9  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1489  Lytic transglycosylase catalytic  31.88 
 
 		 215 aa  73.6  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0033  conjugal transfer protein  34.31 
 
 		 225 aa  73.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0035  pilx1 protein  31.85 
 
 		 206 aa  71.6  0.000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02998  hypothetical protein  32.31 
 
 		 316 aa  68.6  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08216  conjugal transfer protein TraB  29.25 
 
 		 200 aa  68.6  0.00000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0104  pilx1 protein  31.11 
 
 		 215 aa  66.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.718662 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0253  Lytic transglycosylase catalytic  41.57 
 
 		 164 aa  60.8  0.00000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0562  Lytic transglycosylase catalytic  32.61 
 
 		 180 aa  57  0.0000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1996  lytic transglycosylase catalytic  31.62 
 
 		 310 aa  53.9  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000014768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0258  Type IV secretory pathway AvhB1 protein  28.8 
 
 		 189 aa  52.8  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0072  invasion protein  28.89 
 
 		 265 aa  47.8  0.00008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1708  lytic transglycosylase, catalytic  28.89 
 
 		 265 aa  47.4  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0133415 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1591  conjugal transfer protein  24.83 
 
 		 173 aa  46.6  0.0002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0975326  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1661  lytic transglycosylase, catalytic  28.15 
 
 		 260 aa  46.2  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.469495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3707  hypothetical protein  28.57 
 
 		 251 aa  45.1  0.0005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0917691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3431  Lytic transglycosylase catalytic  31.71 
 
 		 320 aa  45.1  0.0006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2311  lytic transglycosylase, catalytic  30.61 
 
 		 183 aa  44.7  0.0007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1544  lytic transglycosylase, catalytic  27.55 
 
 		 175 aa  43.9  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0439375  normal  0.269164 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6568  lytic transglycosylase catalytic  26.43 
 
 		 269 aa  42.4  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2548  hypothetical protein  27.34 
 
 		 302 aa  42.7  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1800  lytic transglycosylase, catalytic  27.78 
 
 		 201 aa  42.4  0.003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.474073  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2003  Lytic transglycosylase catalytic  27.44 
 
 		 207 aa  42.4  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.323498  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3796  lytic transglycosylase, catalytic  27.85 
 
 		 179 aa  42  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.823369  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0248  Lytic transglycosylase catalytic  28 
 
 		 168 aa  41.6  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0192  transglycosylase SLT domain-containing protein  33.78 
 
 		 177 aa  41.2  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000268096 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3720  transglycosylase SLT domain-containing protein  31.67 
 
 		 212 aa  40.8  0.01  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2644  lytic transglycosylase, catalytic  29.59 
 
 		 182 aa  40.8  0.01  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>