26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1800 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_1800  lytic transglycosylase, catalytic  100 
 
 		 201 aa  405  1.0000000000000001e-112  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.474073  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2003  Lytic transglycosylase catalytic  40.22 
 
 		 207 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.323498  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2121  transglycosylase SLT domain-containing protein  26.88 
 
 		 168 aa  60.5  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0562  Lytic transglycosylase catalytic  31.25 
 
 		 180 aa  56.6  0.0000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1544  lytic transglycosylase, catalytic  22.29 
 
 		 175 aa  54.7  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0439375  normal  0.269164 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0163  lytic transglycosylase, catalytic  38.16 
 
 		 145 aa  53.1  0.000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0042056  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1431  lytic transglycosylase, catalytic  26 
 
 		 170 aa  48.1  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6296  lytic transglycosylase, catalytic  30 
 
 		 140 aa  47  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.270773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0193  lytic transglycosylase, catalytic  23.89 
 
 		 168 aa  47  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2355  Lytic transglycosylase catalytic  23.53 
 
 		 203 aa  47  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0248  Lytic transglycosylase catalytic  24.48 
 
 		 168 aa  46.6  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1591  conjugal transfer protein  27.33 
 
 		 173 aa  45.8  0.0004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0975326  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2644  lytic transglycosylase, catalytic  25.5 
 
 		 182 aa  44.7  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0834  lytic transglycosylase, catalytic  40 
 
 		 74 aa  44.3  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.136392  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2311  lytic transglycosylase, catalytic  24.83 
 
 		 183 aa  43.9  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6162  type IV secretion system lytic transglycosylase VirB1  25.42 
 
 		 235 aa  43.9  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151768  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1489  Lytic transglycosylase catalytic  24.44 
 
 		 215 aa  43.1  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1609  Lytic transglycosylase catalytic  27.78 
 
 		 177 aa  42.4  0.005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0847  BapC protein  33.8 
 
 		 182 aa  42.4  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2156  BapC protein  33.8 
 
 		 187 aa  41.6  0.008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5072  transglycosylase SLT domain protein  39.34 
 
 		 152 aa  41.6  0.008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.110513 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0565  BapC protein  33.8 
 
 		 187 aa  41.6  0.009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.146526  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2068  BapC protein  33.8 
 
 		 187 aa  41.2  0.01  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0527025  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0760  BapC protein  33.8 
 
 		 187 aa  41.2  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.832936  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2079  BapC protein  33.8 
 
 		 187 aa  41.2  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.22209  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1524  BapC protein  33.8 
 
 		 187 aa  41.2  0.01  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.177877  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>