169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0562 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0562  Lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 		 180 aa  365  1e-100  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0253  Lytic transglycosylase catalytic  57.35 
 
 		 164 aa  153  1e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0248  Lytic transglycosylase catalytic  32.95 
 
 		 168 aa  81.6  0.000000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0193  lytic transglycosylase, catalytic  34.16 
 
 		 168 aa  80.5  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2644  lytic transglycosylase, catalytic  30.81 
 
 		 182 aa  79  0.00000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3796  lytic transglycosylase, catalytic  33.83 
 
 		 179 aa  78.6  0.00000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.823369  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2311  lytic transglycosylase, catalytic  32 
 
 		 183 aa  78.2  0.00000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2121  transglycosylase SLT domain-containing protein  33.58 
 
 		 168 aa  77.4  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0195  lytic transglycosylase catalytic protein  33.57 
 
 		 239 aa  76.6  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0177  Lytic transglycosylase catalytic  33.57 
 
 		 239 aa  76.3  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000012846 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0379  invasion protein  31.21 
 
 		 146 aa  75.5  0.0000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.135493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1544  lytic transglycosylase, catalytic  30.41 
 
 		 175 aa  74.7  0.0000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0439375  normal  0.269164 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2361  lytic transglycosylase, catalytic  32.73 
 
 		 155 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0782158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0964  Lytic transglycosylase catalytic  33.12 
 
 		 153 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0847  BapC protein  28.77 
 
 		 182 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0565  BapC protein  28.77 
 
 		 187 aa  68.6  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.146526  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1133  Lytic transglycosylase catalytic  35.35 
 
 		 216 aa  67.8  0.00000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5422  Lytic transglycosylase catalytic  28.93 
 
 		 183 aa  67.4  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.984316  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0447  putative type IV secretion system protein VirB1  38 
 
 		 215 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.941196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5017  Lytic transglycosylase catalytic  28.93 
 
 		 183 aa  67.4  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.260237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2156  BapC protein  30.83 
 
 		 187 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1524  BapC protein  32.26 
 
 		 187 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.177877  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4854  lytic transglycosylase, catalytic  38.14 
 
 		 215 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1431  lytic transglycosylase, catalytic  26.51 
 
 		 170 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3312  lytic transglycosylase, catalytic  38.14 
 
 		 215 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2079  BapC protein  32.26 
 
 		 187 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.22209  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2068  BapC protein  32.26 
 
 		 187 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0527025  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0760  BapC protein  32.26 
 
 		 187 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.832936  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0014  conserved hypothetical protein, SLT family  31.37 
 
 		 192 aa  66.6  0.0000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2658  putative conjugal transfer protein, VirB1/TraA like  38.24 
 
 		 217 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.775372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4379  lytic transglycosylase, catalytic  33.67 
 
 		 181 aa  66.2  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0873  lytic transglycosylase catalytic  35.16 
 
 		 169 aa  65.1  0.0000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2772  Lytic transglycosylase catalytic  33.33 
 
 		 157 aa  64.7  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.806121 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2896  hypothetical protein  32.62 
 
 		 170 aa  64.7  0.0000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3753  lytic transglycosylase catalytic  28 
 
 		 267 aa  64.7  0.0000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.468615  hitchhiker  0.00223581 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1098  Lytic transglycosylase catalytic  30.67 
 
 		 213 aa  63.5  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.891571  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3525  lytic transglycosylase, catalytic  31.13 
 
 		 262 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.69394  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4841  lytic transglycosylase, catalytic  31.13 
 
 		 262 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00117575  hitchhiker  0.00476271 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2099  lytic transglycosylase, catalytic  29.58 
 
 		 210 aa  63.9  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.462435  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7344  Lytic transglycosylase catalytic  34.41 
 
 		 270 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.301149  normal  0.254623 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3138  Lytic transglycosylase catalytic  33.33 
 
 		 157 aa  64.3  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.82617  normal  0.443685 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5443  lytic transglycosylase catalytic  31.13 
 
 		 262 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.297116  normal  0.0393072 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1938  lytic transglycosylase catalytic  29.61 
 
 		 438 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0154763 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4203  lytic transglycosylase catalytic  38.04 
 
 		 215 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6507  Lytic transglycosylase catalytic  37.37 
 
 		 215 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1753  putative type IV secretion system protein VirB1  39 
 
 		 217 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.660532 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4349  lytic transglycosylase, catalytic  34.78 
 
 		 224 aa  62  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0104  pilx1 protein  31.75 
 
 		 215 aa  61.6  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.718662 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0069  type IV secretion system protein VirB1  30.22 
 
 		 238 aa  61.2  0.000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.165878  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3673  lytic transglycosylase catalytic  32.62 
 
 		 164 aa  61.2  0.000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.25232 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0063  type IV secretion system protein VirB1  30.22 
 
 		 238 aa  61.2  0.000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4738  lytic transglycosylase catalytic  29.57 
 
 		 267 aa  61.2  0.000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.282263  normal  0.965292 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3066  invasion protein IagB  30.07 
 
 		 160 aa  60.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.490533 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3082  cell invasion protein  30.07 
 
 		 160 aa  60.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000116628 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5033  Lytic transglycosylase catalytic  32.79 
 
 		 145 aa  60.5  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4216  lytic transglycosylase, catalytic  29.57 
 
 		 267 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3187  cell invasion protein  30.07 
 
 		 160 aa  60.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.927975 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3030  invasion protein IagB  30.07 
 
 		 160 aa  60.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0325324 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2999  invasion protein IagB  30.07 
 
 		 160 aa  60.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000303944  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1489  Lytic transglycosylase catalytic  30.43 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5894  lytic transglycosylase catalytic  32.35 
 
 		 161 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.431421  normal  0.0993718 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4488  lytic transglycosylase, catalytic  34.31 
 
 		 248 aa  59.7  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1239  lytic transglycosylase, catalytic  29.73 
 
 		 404 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0168  protein IpgF  32.28 
 
 		 152 aa  60.1  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00546577  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8227  type IV secretion system lytic transglycosylase VirB1  34.07 
 
 		 238 aa  59.3  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.998898  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2003  Lytic transglycosylase catalytic  30.71 
 
 		 207 aa  59.3  0.00000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.323498  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0160  Lytic transglycosylase catalytic  35.05 
 
 		 225 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5010  lytic transglycosylase, catalytic  38.46 
 
 		 224 aa  58.5  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.417776  normal  0.129751 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1265  lytic transglycosylase catalytic  30.71 
 
 		 407 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.254605 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2355  Lytic transglycosylase catalytic  30.08 
 
 		 203 aa  58.5  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4243  lytic transglycosylase, catalytic  30.16 
 
 		 178 aa  58.5  0.00000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.547585  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4498  lytic transglycosylase, catalytic  30 
 
 		 404 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5439  Lytic transglycosylase catalytic  31.97 
 
 		 145 aa  58.2  0.00000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6321  lytic transglycosylase catalytic  36.56 
 
 		 262 aa  58.2  0.00000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0873  lytic transglycosylase, catalytic  30 
 
 		 599 aa  57.8  0.00000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4125  lytic transglycosylase PilT  28.92 
 
 		 167 aa  57.4  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000476698 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6296  lytic transglycosylase, catalytic  30 
 
 		 140 aa  57.4  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.270773  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1609  Lytic transglycosylase catalytic  32.61 
 
 		 177 aa  57  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3520  lytic transglycosylase, catalytic  32.26 
 
 		 228 aa  57  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.940795  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0219  HpaH precursor  28.75 
 
 		 161 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1800  lytic transglycosylase, catalytic  31.25 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.474073  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1355  lytic transglycosylase, catalytic  30 
 
 		 408 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0669029  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7537  lytic transglycosylase catalytic  34.07 
 
 		 217 aa  57  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.75484  normal  0.0515023 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0006  putative invasion protein  28.75 
 
 		 161 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0006  putative invasion protein  28.75 
 
 		 161 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.435281  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1337  lytic transglycosylase catalytic  30 
 
 		 408 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.545884  normal  0.0328335 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0053  lytic transglycosylase, catalytic  30.15 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2444  Lytic transglycosylase catalytic  29.93 
 
 		 327 aa  55.8  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.540003 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0064  lytic transglycosylase catalytic  29.41 
 
 		 148 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4766  Lytic transglycosylase catalytic  32.03 
 
 		 161 aa  55.5  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0006  BapC protein  29.08 
 
 		 149 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5437  lytic transglycosylase, catalytic  27.97 
 
 		 179 aa  55.5  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.43825  normal  0.56373 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3519  putative ipgF protein  29.66 
 
 		 216 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0063  lytic transglycosylase catalytic  30.15 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2787  ipgF protein, putative  31.15 
 
 		 152 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.062319  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1891  putative ipgF protein  31.15 
 
 		 152 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.65052  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2661  putative ipgF protein  31.15 
 
 		 152 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0106  type IV secretory pathway VirB1 component  25.2 
 
 		 220 aa  54.7  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0754  lytic transglycosylase, catalytic  30.16 
 
 		 291 aa  54.3  0.0000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.970703  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0082  lytic transglycosylase catalytic  29.41 
 
 		 161 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>