52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_1133 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_1133  Lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 
216 aa  432  1e-120  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4738  lytic transglycosylase catalytic  45.74 
 
 
267 aa  112  5e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.282263  normal  0.965292 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3753  lytic transglycosylase catalytic  42.47 
 
 
267 aa  112  6e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.468615  hitchhiker  0.00223581 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5443  lytic transglycosylase catalytic  41.78 
 
 
262 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.297116  normal  0.0393072 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3525  lytic transglycosylase, catalytic  41.78 
 
 
262 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.69394  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4841  lytic transglycosylase, catalytic  41.78 
 
 
262 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00117575  hitchhiker  0.00476271 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4216  lytic transglycosylase, catalytic  41.78 
 
 
267 aa  109  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4379  lytic transglycosylase, catalytic  47.69 
 
 
181 aa  108  5e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2444  Lytic transglycosylase catalytic  39.04 
 
 
327 aa  107  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.540003 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0063  type IV secretion system protein VirB1  38.46 
 
 
238 aa  107  1e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0069  type IV secretion system protein VirB1  38.46 
 
 
238 aa  107  1e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.165878  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0447  putative type IV secretion system protein VirB1  42.57 
 
 
215 aa  106  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.941196  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4203  lytic transglycosylase catalytic  43.48 
 
 
215 aa  105  7e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7537  lytic transglycosylase catalytic  39.86 
 
 
217 aa  102  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.75484  normal  0.0515023 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3312  lytic transglycosylase, catalytic  42.03 
 
 
215 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4854  lytic transglycosylase, catalytic  42.03 
 
 
215 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1609  Lytic transglycosylase catalytic  36.62 
 
 
177 aa  99.8  3e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6321  lytic transglycosylase catalytic  42.98 
 
 
262 aa  98.6  6e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0873  lytic transglycosylase catalytic  40.99 
 
 
169 aa  97.4  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2658  putative conjugal transfer protein, VirB1/TraA like  41.73 
 
 
217 aa  96.7  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.775372  normal 
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0033  conjugal transfer protein  32.5 
 
 
225 aa  95.9  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0160  Lytic transglycosylase catalytic  39.74 
 
 
225 aa  94.7  9e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6507  Lytic transglycosylase catalytic  44.62 
 
 
215 aa  93.6  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5010  lytic transglycosylase, catalytic  42.36 
 
 
224 aa  86.7  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.417776  normal  0.129751 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3520  lytic transglycosylase, catalytic  38.13 
 
 
228 aa  86.3  3e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.940795  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2355  Lytic transglycosylase catalytic  33.09 
 
 
203 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8227  type IV secretion system lytic transglycosylase VirB1  32.81 
 
 
238 aa  82.8  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.998898  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4349  lytic transglycosylase, catalytic  41.28 
 
 
224 aa  83.2  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0106  type IV secretory pathway VirB1 component  29.79 
 
 
220 aa  80.9  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1698  conjugal transfer -like protein  38.35 
 
 
223 aa  79.3  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1397  Lytic transglycosylase catalytic  38.35 
 
 
218 aa  79.3  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0261  Lytic transglycosylase catalytic  36.84 
 
 
225 aa  79.3  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.385484  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1753  putative type IV secretion system protein VirB1  39.69 
 
 
217 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.660532 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7344  Lytic transglycosylase catalytic  31.5 
 
 
270 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.301149  normal  0.254623 
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0035  pilx1 protein  27.89 
 
 
206 aa  75.9  0.0000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0562  Lytic transglycosylase catalytic  35.35 
 
 
180 aa  74.3  0.000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6162  type IV secretion system lytic transglycosylase VirB1  31.14 
 
 
235 aa  72.8  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151768  normal 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08216  conjugal transfer protein TraB  26.24 
 
 
200 aa  72.4  0.000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02998  hypothetical protein  27.21 
 
 
316 aa  72  0.000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0104  pilx1 protein  26.06 
 
 
215 aa  69.3  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.718662 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0253  Lytic transglycosylase catalytic  34.34 
 
 
164 aa  68.9  0.00000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5089  transport secretion system IV, VirB1 protein  30.2 
 
 
220 aa  68.6  0.00000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0009  conjugal transfer protein  25.74 
 
 
203 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.461383  normal  0.692739 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1489  Lytic transglycosylase catalytic  26.39 
 
 
215 aa  62.4  0.000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2494  lytic transglycosylase, catalytic  30.94 
 
 
194 aa  58.9  0.00000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.180368  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4928  transport secretion system IV protein, VirB1  28.28 
 
 
220 aa  55.1  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6492  transport secretion system IV protein, VirB1  27.97 
 
 
220 aa  53.9  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.733642  normal  0.924712 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0674  virB1 type IV secretion protein  27.07 
 
 
229 aa  49.7  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6296  lytic transglycosylase, catalytic  35.14 
 
 
140 aa  47  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.270773  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0258  Type IV secretory pathway AvhB1 protein  28 
 
 
189 aa  44.7  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1591  conjugal transfer protein  22.54 
 
 
173 aa  44.3  0.001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0975326  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3720  transglycosylase SLT domain-containing protein  25.85 
 
 
212 aa  41.6  0.008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>