81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_8227 on replicon NC_011982
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011982  Avi_8227  type IV secretion system lytic transglycosylase VirB1  100 
 
 		 238 aa  492  9.999999999999999e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.998898  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6162  type IV secretion system lytic transglycosylase VirB1  60 
 
 		 235 aa  236  3e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3520  lytic transglycosylase, catalytic  46.1 
 
 		 228 aa  124  1e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.940795  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1609  Lytic transglycosylase catalytic  42.55 
 
 		 177 aa  104  1e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4379  lytic transglycosylase, catalytic  35.91 
 
 		 181 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5443  lytic transglycosylase catalytic  40.4 
 
 		 262 aa  99  7e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.297116  normal  0.0393072 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3753  lytic transglycosylase catalytic  40.82 
 
 		 267 aa  98.6  7e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.468615  hitchhiker  0.00223581 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4841  lytic transglycosylase, catalytic  40.4 
 
 		 262 aa  99  7e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00117575  hitchhiker  0.00476271 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4216  lytic transglycosylase, catalytic  42.11 
 
 		 267 aa  98.6  7e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3525  lytic transglycosylase, catalytic  40.4 
 
 		 262 aa  99  7e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.69394  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4738  lytic transglycosylase catalytic  40 
 
 		 267 aa  97.1  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.282263  normal  0.965292 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5010  lytic transglycosylase, catalytic  35.96 
 
 		 224 aa  97.1  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.417776  normal  0.129751 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4203  lytic transglycosylase catalytic  37.2 
 
 		 215 aa  94  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3312  lytic transglycosylase, catalytic  35.93 
 
 		 215 aa  91.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0160  Lytic transglycosylase catalytic  35.06 
 
 		 225 aa  91.3  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1698  conjugal transfer -like protein  40 
 
 		 223 aa  91.3  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1397  Lytic transglycosylase catalytic  40 
 
 		 218 aa  91.7  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4854  lytic transglycosylase, catalytic  35.93 
 
 		 215 aa  91.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2355  Lytic transglycosylase catalytic  33.33 
 
 		 203 aa  90.9  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0261  Lytic transglycosylase catalytic  39.07 
 
 		 225 aa  89.7  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.385484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0447  putative type IV secretion system protein VirB1  36.99 
 
 		 215 aa  88.6  9e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.941196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0009  conjugal transfer protein  33.54 
 
 		 203 aa  83.2  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.461383  normal  0.692739 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6507  Lytic transglycosylase catalytic  35.37 
 
 		 215 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1133  Lytic transglycosylase catalytic  32.29 
 
 		 216 aa  80.9  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2494  lytic transglycosylase, catalytic  36.31 
 
 		 194 aa  80.5  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.180368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2658  putative conjugal transfer protein, VirB1/TraA like  35.22 
 
 		 217 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.775372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4349  lytic transglycosylase, catalytic  31.51 
 
 		 224 aa  79.3  0.00000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5089  transport secretion system IV, VirB1 protein  33.94 
 
 		 220 aa  77  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7537  lytic transglycosylase catalytic  28.85 
 
 		 217 aa  75.1  0.0000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.75484  normal  0.0515023 
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0104  pilx1 protein  30.26 
 
 		 215 aa  73.9  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.718662 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1753  putative type IV secretion system protein VirB1  33.99 
 
 		 217 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.660532 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0069  type IV secretion system protein VirB1  32.1 
 
 		 238 aa  72.4  0.000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.165878  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0063  type IV secretion system protein VirB1  32.1 
 
 		 238 aa  72.4  0.000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0106  type IV secretory pathway VirB1 component  29.56 
 
 		 220 aa  70.5  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0033  conjugal transfer protein  32.58 
 
 		 225 aa  68.6  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6321  lytic transglycosylase catalytic  31.85 
 
 		 262 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1489  Lytic transglycosylase catalytic  32.88 
 
 		 215 aa  67.8  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0873  lytic transglycosylase catalytic  33.77 
 
 		 169 aa  67.4  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6492  transport secretion system IV protein, VirB1  30.24 
 
 		 220 aa  65.5  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.733642  normal  0.924712 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4928  transport secretion system IV protein, VirB1  31.43 
 
 		 220 aa  62.8  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0562  Lytic transglycosylase catalytic  34.07 
 
 		 180 aa  59.3  0.00000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0253  Lytic transglycosylase catalytic  32.74 
 
 		 164 aa  58.2  0.0000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0674  virB1 type IV secretion protein  27.5 
 
 		 229 aa  54.3  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7344  Lytic transglycosylase catalytic  28.91 
 
 		 270 aa  53.9  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.301149  normal  0.254623 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0193  lytic transglycosylase, catalytic  27.37 
 
 		 168 aa  53.5  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0035  pilx1 protein  28.39 
 
 		 206 aa  53.1  0.000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0064  lytic transglycosylase catalytic  31.41 
 
 		 148 aa  52.4  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0006  BapC protein  31.21 
 
 		 149 aa  52.4  0.000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0248  Lytic transglycosylase catalytic  28.39 
 
 		 168 aa  51.6  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0063  lytic transglycosylase catalytic  31.41 
 
 		 149 aa  50.8  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0053  lytic transglycosylase, catalytic  31.41 
 
 		 159 aa  51.2  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0219  HpaH precursor  32 
 
 		 161 aa  50.1  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0006  putative invasion protein  32 
 
 		 161 aa  50.1  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.435281  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2787  ipgF protein, putative  32 
 
 		 152 aa  49.7  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.062319  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2661  putative ipgF protein  32 
 
 		 152 aa  49.7  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1891  putative ipgF protein  32 
 
 		 152 aa  49.7  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.65052  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0006  putative invasion protein  32 
 
 		 161 aa  49.7  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4766  Lytic transglycosylase catalytic  28.48 
 
 		 161 aa  48.5  0.00008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3519  putative ipgF protein  32 
 
 		 216 aa  48.9  0.00008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3245  lytic transglycosylase  30.82 
 
 		 149 aa  48.1  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.432237 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0195  lytic transglycosylase catalytic protein  28.97 
 
 		 239 aa  46.2  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0063  lytic transglycosylase, catalytic  31.58 
 
 		 164 aa  46.2  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0007  lytic transglycosylase, catalytic  31.58 
 
 		 164 aa  46.2  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.37161  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2361  lytic transglycosylase, catalytic  30.08 
 
 		 155 aa  46.2  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0782158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0082  lytic transglycosylase catalytic  31.58 
 
 		 161 aa  45.4  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0177  Lytic transglycosylase catalytic  28.28 
 
 		 239 aa  45.4  0.0009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000012846 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0379  invasion protein  27.14 
 
 		 146 aa  45.1  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.135493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1529  hypothetical protein  28.97 
 
 		 257 aa  43.9  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3069  lytic transglycosylase catalytic  29.32 
 
 		 147 aa  43.9  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0145622 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4502  hypothetical protein  31.06 
 
 		 148 aa  44.3  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.362894 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5194  type IV secretory pathway, putative lytic transglycosylase; putative exported protein  28.97 
 
 		 257 aa  43.9  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.851054  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2896  hypothetical protein  30.82 
 
 		 170 aa  43.1  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1938  lytic transglycosylase catalytic  28.37 
 
 		 438 aa  43.1  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0154763 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3935  Lytic transglycosylase catalytic  31.4 
 
 		 148 aa  42.7  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1239  lytic transglycosylase, catalytic  28.37 
 
 		 404 aa  42.7  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4498  lytic transglycosylase, catalytic  27.66 
 
 		 404 aa  42.4  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08216  conjugal transfer protein TraB  24.24 
 
 		 200 aa  42.4  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1265  lytic transglycosylase catalytic  28.37 
 
 		 407 aa  42.4  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.254605 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02998  hypothetical protein  25 
 
 		 316 aa  42  0.008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2121  transglycosylase SLT domain-containing protein  24.51 
 
 		 168 aa  42  0.009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2444  Lytic transglycosylase catalytic  32.14 
 
 		 327 aa  42  0.01  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.540003 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>