71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2548 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2548  hypothetical protein  100 
 
 		 302 aa  605  9.999999999999999e-173  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3431  Lytic transglycosylase catalytic  40.33 
 
 		 320 aa  136  4e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1996  lytic transglycosylase catalytic  41.44 
 
 		 310 aa  136  4e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000014768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2898  lytic transglycosylase, catalytic  37.34 
 
 		 369 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  unclonable  0.00000087511  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1661  lytic transglycosylase, catalytic  40.81 
 
 		 260 aa  127  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.469495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0072  invasion protein  41.3 
 
 		 265 aa  120  3e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1708  lytic transglycosylase, catalytic  42.78 
 
 		 265 aa  120  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0133415 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0593  hypothetical protein  39.24 
 
 		 267 aa  110  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.557269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2614  lytic transglycosylase, catalytic  40.41 
 
 		 229 aa  109  6e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.214877 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2978  lytic transglycosylase, catalytic  39.16 
 
 		 226 aa  103  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.993204 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1319  invasion protein  39.16 
 
 		 226 aa  103  4e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3707  hypothetical protein  39.13 
 
 		 251 aa  100  3e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0917691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0336  Lytic transglycosylase catalytic  37.61 
 
 		 185 aa  89.4  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.706731 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0281  lytic transglycosylase, catalytic  36.08 
 
 		 182 aa  88.6  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0368  Lytic transglycosylase catalytic  37.93 
 
 		 185 aa  87.8  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.766168 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1124  transglycosylase  35.66 
 
 		 190 aa  85.9  9e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1676  lytic transglycosylase catalytic  34.18 
 
 		 181 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0660127  normal  0.0250145 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2843  Lytic transglycosylase catalytic  36.94 
 
 		 194 aa  84.7  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0613  Lytic transglycosylase catalytic  35.44 
 
 		 197 aa  84  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.92837  normal  0.279374 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0671  Lytic transglycosylase catalytic  39.1 
 
 		 194 aa  84  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.720466 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0761  hypothetical protein  34.85 
 
 		 182 aa  81.3  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.112238  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0634  lytic transglycosylase catalytic  36.62 
 
 		 179 aa  80.1  0.00000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.308805  normal  0.480639 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0645  Lytic transglycosylase catalytic  36.62 
 
 		 222 aa  80.1  0.00000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.176498 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1141  hypothetical protein  33.33 
 
 		 190 aa  80.1  0.00000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3220  lytic transglycosylase catalytic  32.91 
 
 		 184 aa  79.3  0.00000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.140959  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5548  lytic transglycosylase catalytic  40 
 
 		 268 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00871042 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3412  lytic transglycosylase catalytic  35.26 
 
 		 196 aa  79.3  0.00000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.17107  normal  0.120299 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2378  hypothetical protein  40.49 
 
 		 206 aa  78.2  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.268225  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4167  lytic transglycosylase catalytic  37.34 
 
 		 201 aa  79  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.381965  normal  0.719348 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4195  lytic transglycosylase catalytic  33.08 
 
 		 180 aa  78.6  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0040  Lytic transglycosylase catalytic  32.88 
 
 		 187 aa  78.6  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2210  lytic transglycosylase, catalytic  39.26 
 
 		 206 aa  76.6  0.0000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.31341 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2334  lytic transglycosylase, catalytic  36.94 
 
 		 196 aa  76.3  0.0000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000370979  unclonable  0.00000020611 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1197  hypothetical protein  36.71 
 
 		 196 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.66344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0274  lytic transglycosylase catalytic  35.9 
 
 		 174 aa  75.5  0.0000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.624808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2932  lytic transglycosylase, catalytic  40.34 
 
 		 184 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2684  lytic transglycosylase catalytic  32.47 
 
 		 177 aa  74.3  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.173573 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3303  lytic transglycosylase catalytic  40.34 
 
 		 184 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1276  lytic transglycosylase, catalytic  35.67 
 
 		 196 aa  72.8  0.000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.11854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6298  hypothetical protein  44.44 
 
 		 265 aa  73.2  0.000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.192208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1410  lytic transglycosylase, catalytic  35.67 
 
 		 196 aa  72.8  0.000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.942622 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1177  Lytic transglycosylase catalytic  35.26 
 
 		 196 aa  72  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0630  lytic transglycosylase, catalytic  26.86 
 
 		 187 aa  72  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0965  Lytic transglycosylase catalytic  38.06 
 
 		 206 aa  71.6  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6568  lytic transglycosylase catalytic  33.98 
 
 		 269 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3939  lytic transglycosylase, catalytic  33.62 
 
 		 178 aa  71.2  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.307099  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1110  lytic transglycosylase, catalytic  31.06 
 
 		 175 aa  70.1  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.830854 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4099  lytic transglycosylase catalytic  36.43 
 
 		 230 aa  68.6  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3720  transglycosylase SLT domain-containing protein  32.93 
 
 		 212 aa  68.6  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1640  Lytic transglycosylase catalytic  32.92 
 
 		 196 aa  68.2  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5194  type IV secretory pathway, putative lytic transglycosylase; putative exported protein  34.4 
 
 		 257 aa  67  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.851054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1529  hypothetical protein  34.4 
 
 		 257 aa  67  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0642  Lytic transglycosylase catalytic  33.06 
 
 		 216 aa  65.9  0.0000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3010  lytic transglycosylase, catalytic  35 
 
 		 171 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.857835 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4182  lytic transglycosylase catalytic  34.96 
 
 		 230 aa  63.9  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0529  lytic transglycosylase, catalytic  33.56 
 
 		 202 aa  64.3  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0323  lytic transglycosylase catalytic  34.96 
 
 		 230 aa  62  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00170183 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0450  putative signal peptide  29.56 
 
 		 196 aa  62  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1456  hypothetical protein  33.12 
 
 		 185 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.400951 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0192  transglycosylase SLT domain-containing protein  30.48 
 
 		 177 aa  53.1  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000268096 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59660  hypothetical protein  27.54 
 
 		 193 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000384805  hitchhiker  1.2342600000000001e-18 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4498  soluble lytic murein transglycosylase  26.4 
 
 		 193 aa  49.7  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.92102  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0847  BapC protein  35.56 
 
 		 182 aa  48.5  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2156  BapC protein  34.44 
 
 		 187 aa  46.2  0.0007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1524  BapC protein  34.44 
 
 		 187 aa  45.8  0.0009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.177877  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0760  BapC protein  34.44 
 
 		 187 aa  45.8  0.0009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.832936  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2079  BapC protein  34.44 
 
 		 187 aa  45.8  0.0009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.22209  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0565  BapC protein  34.44 
 
 		 187 aa  45.8  0.0009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.146526  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2068  BapC protein  34.44 
 
 		 187 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0527025  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2444  Lytic transglycosylase catalytic  34.04 
 
 		 327 aa  43.9  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.540003 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1609  Lytic transglycosylase catalytic  27.34 
 
 		 177 aa  43.1  0.006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>