63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2378 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2378  hypothetical protein  100 
 
 		 206 aa  403  1.0000000000000001e-112  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.268225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0965  Lytic transglycosylase catalytic  94.66 
 
 		 206 aa  387  1e-107  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2210  lytic transglycosylase, catalytic  94.17 
 
 		 206 aa  386  1e-106  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.31341 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0671  Lytic transglycosylase catalytic  76.32 
 
 		 194 aa  289  2e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.720466 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2334  lytic transglycosylase, catalytic  75.45 
 
 		 196 aa  260  1e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000370979  unclonable  0.00000020611 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1410  lytic transglycosylase, catalytic  73.05 
 
 		 196 aa  252  3e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.942622 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1276  lytic transglycosylase, catalytic  73.05 
 
 		 196 aa  252  3e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.11854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1177  Lytic transglycosylase catalytic  72.89 
 
 		 196 aa  249  2e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2843  Lytic transglycosylase catalytic  67.93 
 
 		 194 aa  249  2e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3412  lytic transglycosylase catalytic  70.66 
 
 		 196 aa  249  2e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.17107  normal  0.120299 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1197  hypothetical protein  71.86 
 
 		 196 aa  247  9e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.66344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4167  lytic transglycosylase catalytic  70.66 
 
 		 201 aa  245  4e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.381965  normal  0.719348 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0529  lytic transglycosylase, catalytic  73.58 
 
 		 202 aa  238  4e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1640  Lytic transglycosylase catalytic  66.28 
 
 		 196 aa  238  5e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0450  putative signal peptide  63.92 
 
 		 196 aa  221  4e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3010  lytic transglycosylase, catalytic  62.66 
 
 		 171 aa  211  7.999999999999999e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.857835 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2932  lytic transglycosylase, catalytic  64.05 
 
 		 184 aa  198  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3303  lytic transglycosylase catalytic  63.4 
 
 		 184 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1456  hypothetical protein  56.63 
 
 		 185 aa  193  2e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.400951 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59660  hypothetical protein  52.2 
 
 		 193 aa  169  3e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000384805  hitchhiker  1.2342600000000001e-18 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4498  soluble lytic murein transglycosylase  55.7 
 
 		 193 aa  168  6e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.92102  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4099  lytic transglycosylase catalytic  43.89 
 
 		 230 aa  129  3e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4182  lytic transglycosylase catalytic  43.88 
 
 		 230 aa  128  7.000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0323  lytic transglycosylase catalytic  45.05 
 
 		 230 aa  127  1.0000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00170183 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0642  Lytic transglycosylase catalytic  46.31 
 
 		 216 aa  124  9e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3720  transglycosylase SLT domain-containing protein  44.97 
 
 		 212 aa  123  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3939  lytic transglycosylase, catalytic  37.57 
 
 		 178 aa  107  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.307099  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0630  lytic transglycosylase, catalytic  38.06 
 
 		 187 aa  102  3e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1529  hypothetical protein  36.36 
 
 		 257 aa  81.6  0.000000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5194  type IV secretory pathway, putative lytic transglycosylase; putative exported protein  36.36 
 
 		 257 aa  81.6  0.000000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.851054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6298  hypothetical protein  36.05 
 
 		 265 aa  79.7  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.192208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0192  transglycosylase SLT domain-containing protein  34.19 
 
 		 177 aa  78.6  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000268096 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5548  lytic transglycosylase catalytic  35.88 
 
 		 268 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00871042 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2898  lytic transglycosylase, catalytic  37.04 
 
 		 369 aa  75.1  0.0000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  unclonable  0.00000087511  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0281  lytic transglycosylase, catalytic  34.69 
 
 		 182 aa  74.7  0.0000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2548  hypothetical protein  41.18 
 
 		 302 aa  73.9  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3707  hypothetical protein  35.14 
 
 		 251 aa  74.7  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0917691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6568  lytic transglycosylase catalytic  33.53 
 
 		 269 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2684  lytic transglycosylase catalytic  35.48 
 
 		 177 aa  73.6  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.173573 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0368  Lytic transglycosylase catalytic  30.23 
 
 		 185 aa  72.8  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.766168 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0274  lytic transglycosylase catalytic  31.94 
 
 		 174 aa  72  0.000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.624808  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0336  Lytic transglycosylase catalytic  31.51 
 
 		 185 aa  70.9  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.706731 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1661  lytic transglycosylase, catalytic  35.53 
 
 		 260 aa  69.7  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.469495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1319  invasion protein  35.65 
 
 		 226 aa  69.3  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2614  lytic transglycosylase, catalytic  35.65 
 
 		 229 aa  69.3  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.214877 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2978  lytic transglycosylase, catalytic  35.65 
 
 		 226 aa  69.3  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.993204 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0593  hypothetical protein  35.09 
 
 		 267 aa  68.2  0.00000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.557269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3220  lytic transglycosylase catalytic  32.42 
 
 		 184 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.140959  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0613  Lytic transglycosylase catalytic  30.32 
 
 		 197 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.92837  normal  0.279374 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0072  invasion protein  36.67 
 
 		 265 aa  66.6  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1124  transglycosylase  29.81 
 
 		 190 aa  66.2  0.0000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1996  lytic transglycosylase catalytic  36.52 
 
 		 310 aa  65.9  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000014768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1708  lytic transglycosylase, catalytic  36.67 
 
 		 265 aa  65.5  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0133415 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0040  Lytic transglycosylase catalytic  34.85 
 
 		 187 aa  65.1  0.0000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0761  hypothetical protein  32.64 
 
 		 182 aa  64.3  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.112238  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4195  lytic transglycosylase catalytic  30.13 
 
 		 180 aa  60.8  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0645  Lytic transglycosylase catalytic  31.9 
 
 		 222 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.176498 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1110  lytic transglycosylase, catalytic  32.23 
 
 		 175 aa  60.1  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.830854 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1676  lytic transglycosylase catalytic  32.41 
 
 		 181 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0660127  normal  0.0250145 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3431  Lytic transglycosylase catalytic  34.4 
 
 		 320 aa  59.3  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0634  lytic transglycosylase catalytic  31.9 
 
 		 179 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.308805  normal  0.480639 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1141  hypothetical protein  28.85 
 
 		 190 aa  53.9  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0253  Lytic transglycosylase catalytic  32.06 
 
 		 164 aa  44.3  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>