81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0336 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0336  Lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 		 185 aa  390  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.706731 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0368  Lytic transglycosylase catalytic  94.05 
 
 		 185 aa  353  1e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.766168 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0761  hypothetical protein  75.69 
 
 		 182 aa  289  2e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.112238  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0274  lytic transglycosylase catalytic  74.57 
 
 		 174 aa  281  4.0000000000000003e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.624808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4195  lytic transglycosylase catalytic  61.45 
 
 		 180 aa  238  2.9999999999999997e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0281  lytic transglycosylase, catalytic  63.31 
 
 		 182 aa  236  1e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1141  hypothetical protein  59.02 
 
 		 190 aa  235  3e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3220  lytic transglycosylase catalytic  57.61 
 
 		 184 aa  233  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.140959  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1676  lytic transglycosylase catalytic  57.61 
 
 		 181 aa  233  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0660127  normal  0.0250145 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2684  lytic transglycosylase catalytic  62.96 
 
 		 177 aa  230  7.000000000000001e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.173573 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0040  Lytic transglycosylase catalytic  55.91 
 
 		 187 aa  229  2e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1124  transglycosylase  58.29 
 
 		 190 aa  228  5e-59  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0613  Lytic transglycosylase catalytic  60.38 
 
 		 197 aa  223  1e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.92837  normal  0.279374 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0645  Lytic transglycosylase catalytic  59.75 
 
 		 222 aa  219  9.999999999999999e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.176498 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0634  lytic transglycosylase catalytic  59.75 
 
 		 179 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.308805  normal  0.480639 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1110  lytic transglycosylase, catalytic  55.56 
 
 		 175 aa  205  4e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.830854 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1708  lytic transglycosylase, catalytic  39.84 
 
 		 265 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0133415 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0072  invasion protein  39.84 
 
 		 265 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1661  lytic transglycosylase, catalytic  37.59 
 
 		 260 aa  107  7.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.469495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1996  lytic transglycosylase catalytic  36.71 
 
 		 310 aa  94.4  9e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000014768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0593  hypothetical protein  42.07 
 
 		 267 aa  92.8  3e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.557269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2614  lytic transglycosylase, catalytic  36.15 
 
 		 229 aa  92.4  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.214877 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1319  invasion protein  36.72 
 
 		 226 aa  91.3  8e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2978  lytic transglycosylase, catalytic  36.72 
 
 		 226 aa  91.3  8e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.993204 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1177  Lytic transglycosylase catalytic  35.8 
 
 		 196 aa  89.4  3e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1197  hypothetical protein  36.05 
 
 		 196 aa  88.6  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.66344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2548  hypothetical protein  37.61 
 
 		 302 aa  88.6  4e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3412  lytic transglycosylase catalytic  37.88 
 
 		 196 aa  86.7  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.17107  normal  0.120299 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2334  lytic transglycosylase, catalytic  36.73 
 
 		 196 aa  86.3  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000370979  unclonable  0.00000020611 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0630  lytic transglycosylase, catalytic  36.09 
 
 		 187 aa  85.9  3e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3431  Lytic transglycosylase catalytic  34.38 
 
 		 320 aa  85.5  4e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1276  lytic transglycosylase, catalytic  37.12 
 
 		 196 aa  83.6  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.11854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1410  lytic transglycosylase, catalytic  37.12 
 
 		 196 aa  83.6  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.942622 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4167  lytic transglycosylase catalytic  34.69 
 
 		 201 aa  81.3  0.000000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.381965  normal  0.719348 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0671  Lytic transglycosylase catalytic  33.77 
 
 		 194 aa  76.6  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.720466 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0529  lytic transglycosylase, catalytic  32.65 
 
 		 202 aa  75.9  0.0000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2843  Lytic transglycosylase catalytic  34.09 
 
 		 194 aa  74.3  0.0000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2898  lytic transglycosylase, catalytic  33.33 
 
 		 369 aa  73.6  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  unclonable  0.00000087511  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3707  hypothetical protein  31.54 
 
 		 251 aa  73.6  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0917691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2378  hypothetical protein  32.17 
 
 		 206 aa  70.9  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.268225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2210  lytic transglycosylase, catalytic  31.51 
 
 		 206 aa  70.9  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.31341 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6568  lytic transglycosylase catalytic  30.4 
 
 		 269 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0965  Lytic transglycosylase catalytic  32.58 
 
 		 206 aa  70.1  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1456  hypothetical protein  32.58 
 
 		 185 aa  68.9  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.400951 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1640  Lytic transglycosylase catalytic  29.14 
 
 		 196 aa  68.2  0.00000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3720  transglycosylase SLT domain-containing protein  29.81 
 
 		 212 aa  67.4  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5548  lytic transglycosylase catalytic  32 
 
 		 268 aa  67  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00871042 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0450  putative signal peptide  29.66 
 
 		 196 aa  66.6  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0642  Lytic transglycosylase catalytic  32.28 
 
 		 216 aa  66.2  0.0000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3010  lytic transglycosylase, catalytic  31.16 
 
 		 171 aa  65.1  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.857835 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4099  lytic transglycosylase catalytic  29.75 
 
 		 230 aa  63.2  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4182  lytic transglycosylase catalytic  28.65 
 
 		 230 aa  62  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2932  lytic transglycosylase, catalytic  32.47 
 
 		 184 aa  62.4  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0323  lytic transglycosylase catalytic  29.24 
 
 		 230 aa  61.6  0.000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00170183 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3303  lytic transglycosylase catalytic  31.06 
 
 		 184 aa  61.6  0.000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5194  type IV secretory pathway, putative lytic transglycosylase; putative exported protein  31.01 
 
 		 257 aa  61.2  0.000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.851054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1529  hypothetical protein  31.01 
 
 		 257 aa  61.2  0.000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0192  transglycosylase SLT domain-containing protein  29.52 
 
 		 177 aa  60.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000268096 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6298  hypothetical protein  27.36 
 
 		 265 aa  56.2  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.192208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3939  lytic transglycosylase, catalytic  26.47 
 
 		 178 aa  55.8  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.307099  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59660  hypothetical protein  29.19 
 
 		 193 aa  55.1  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000384805  hitchhiker  1.2342600000000001e-18 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4498  soluble lytic murein transglycosylase  30.08 
 
 		 193 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.92102  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0014  conserved hypothetical protein, SLT family  27.4 
 
 		 192 aa  50.4  0.00002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4379  lytic transglycosylase, catalytic  29.93 
 
 		 181 aa  49.7  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0562  Lytic transglycosylase catalytic  28.12 
 
 		 180 aa  47  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0452  lytic transglycosylase, catalytic  44.74 
 
 		 204 aa  46.2  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0428943 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2442  Lytic transglycosylase catalytic  42.11 
 
 		 245 aa  45.4  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0440  lytic transglycosylase, catalytic  26 
 
 		 204 aa  45.1  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1794  putative lytic transglycosylase  26.03 
 
 		 204 aa  44.7  0.0008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.391793  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3686  lytic transglycosylase catalytic  26.82 
 
 		 209 aa  44.3  0.0009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2464  lytic transglycosylase, catalytic  32 
 
 		 442 aa  43.5  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329237 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3687  lytic transglycosylase, catalytic  30.08 
 
 		 300 aa  43.5  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2981  lytic transglycosylase, catalytic  42.11 
 
 		 438 aa  42.7  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1173  lytic transglycosylase catalytic  31.2 
 
 		 195 aa  42.7  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.79573  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1364  lytic transglycosylase, catalytic  25.2 
 
 		 140 aa  42.4  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0515588  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3905  lytic transglycosylase, catalytic  41.27 
 
 		 301 aa  42  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2644  lytic transglycosylase, catalytic  28.86 
 
 		 182 aa  41.6  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1379  peptidoglycan-binding LysM  38.78 
 
 		 556 aa  41.2  0.008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6203  Lytic transglycosylase catalytic  34.18 
 
 		 384 aa  41.2  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0827287  normal  0.0199903 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1544  lytic transglycosylase, catalytic  30 
 
 		 175 aa  41.2  0.008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0439375  normal  0.269164 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3705  Lytic transglycosylase catalytic  26.97 
 
 		 209 aa  40.8  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>