62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_1456 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_1456  hypothetical protein  100 
 
 		 185 aa  375  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.400951 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3010  lytic transglycosylase, catalytic  60.62 
 
 		 171 aa  204  4e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.857835 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0671  Lytic transglycosylase catalytic  59.87 
 
 		 194 aa  198  3e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.720466 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4167  lytic transglycosylase catalytic  57.49 
 
 		 201 aa  198  3.9999999999999996e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.381965  normal  0.719348 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1197  hypothetical protein  56.89 
 
 		 196 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.66344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2843  Lytic transglycosylase catalytic  55.74 
 
 		 194 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3303  lytic transglycosylase catalytic  56.73 
 
 		 184 aa  195  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2932  lytic transglycosylase, catalytic  59.04 
 
 		 184 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3412  lytic transglycosylase catalytic  54.8 
 
 		 196 aa  196  2.0000000000000003e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.17107  normal  0.120299 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59660  hypothetical protein  59.34 
 
 		 193 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000384805  hitchhiker  1.2342600000000001e-18 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2210  lytic transglycosylase, catalytic  57.14 
 
 		 206 aa  194  7e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.31341 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1177  Lytic transglycosylase catalytic  56.97 
 
 		 196 aa  194  8.000000000000001e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2334  lytic transglycosylase, catalytic  56.36 
 
 		 196 aa  193  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000370979  unclonable  0.00000020611 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2378  hypothetical protein  56.63 
 
 		 206 aa  193  2e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.268225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1276  lytic transglycosylase, catalytic  56.44 
 
 		 196 aa  191  4e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.11854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1410  lytic transglycosylase, catalytic  56.44 
 
 		 196 aa  191  4e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.942622 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0529  lytic transglycosylase, catalytic  58.54 
 
 		 202 aa  191  5e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4498  soluble lytic murein transglycosylase  60.34 
 
 		 193 aa  191  7e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.92102  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1640  Lytic transglycosylase catalytic  51.7 
 
 		 196 aa  189  2e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0965  Lytic transglycosylase catalytic  55.97 
 
 		 206 aa  189  2e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0450  putative signal peptide  51.69 
 
 		 196 aa  189  2.9999999999999997e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3720  transglycosylase SLT domain-containing protein  45.62 
 
 		 212 aa  133  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0642  Lytic transglycosylase catalytic  45.16 
 
 		 216 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0323  lytic transglycosylase catalytic  43.39 
 
 		 230 aa  122  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00170183 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4182  lytic transglycosylase catalytic  43.09 
 
 		 230 aa  122  3e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4099  lytic transglycosylase catalytic  42.77 
 
 		 230 aa  122  3e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0630  lytic transglycosylase, catalytic  37.93 
 
 		 187 aa  96.3  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3939  lytic transglycosylase, catalytic  35.47 
 
 		 178 aa  92.4  3e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.307099  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1529  hypothetical protein  42.11 
 
 		 257 aa  86.7  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5194  type IV secretory pathway, putative lytic transglycosylase; putative exported protein  42.11 
 
 		 257 aa  86.7  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.851054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0192  transglycosylase SLT domain-containing protein  36.24 
 
 		 177 aa  82.8  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000268096 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2614  lytic transglycosylase, catalytic  36.69 
 
 		 229 aa  79  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.214877 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6568  lytic transglycosylase catalytic  39.57 
 
 		 269 aa  78.2  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0040  Lytic transglycosylase catalytic  37.12 
 
 		 187 aa  75.9  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2684  lytic transglycosylase catalytic  37.7 
 
 		 177 aa  76.3  0.0000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.173573 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0274  lytic transglycosylase catalytic  34.62 
 
 		 174 aa  75.5  0.0000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.624808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3707  hypothetical protein  37.32 
 
 		 251 aa  75.1  0.0000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0917691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1319  invasion protein  36.36 
 
 		 226 aa  74.3  0.0000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2978  lytic transglycosylase, catalytic  36.36 
 
 		 226 aa  74.3  0.0000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.993204 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5548  lytic transglycosylase catalytic  39.57 
 
 		 268 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00871042 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6298  hypothetical protein  36.42 
 
 		 265 aa  71.2  0.000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.192208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0072  invasion protein  37.5 
 
 		 265 aa  71.2  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1708  lytic transglycosylase, catalytic  37.5 
 
 		 265 aa  71.2  0.000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0133415 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0336  Lytic transglycosylase catalytic  32.58 
 
 		 185 aa  69.3  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.706731 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0281  lytic transglycosylase, catalytic  34.62 
 
 		 182 aa  68.9  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1676  lytic transglycosylase catalytic  35.34 
 
 		 181 aa  68.2  0.00000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0660127  normal  0.0250145 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0368  Lytic transglycosylase catalytic  31.82 
 
 		 185 aa  68.2  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.766168 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3431  Lytic transglycosylase catalytic  34.96 
 
 		 320 aa  68.2  0.00000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1661  lytic transglycosylase, catalytic  35.43 
 
 		 260 aa  66.6  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.469495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2898  lytic transglycosylase, catalytic  34.72 
 
 		 369 aa  66.6  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  unclonable  0.00000087511  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1110  lytic transglycosylase, catalytic  35.25 
 
 		 175 aa  64.7  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.830854 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1124  transglycosylase  33.08 
 
 		 190 aa  62.8  0.000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0593  hypothetical protein  32.76 
 
 		 267 aa  63.2  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.557269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0613  Lytic transglycosylase catalytic  33.33 
 
 		 197 aa  62.8  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.92837  normal  0.279374 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0761  hypothetical protein  32.31 
 
 		 182 aa  61.6  0.000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.112238  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3220  lytic transglycosylase catalytic  33.61 
 
 		 184 aa  61.6  0.000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.140959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0645  Lytic transglycosylase catalytic  33.61 
 
 		 222 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.176498 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0634  lytic transglycosylase catalytic  33.61 
 
 		 179 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.308805  normal  0.480639 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2548  hypothetical protein  34.15 
 
 		 302 aa  58.9  0.00000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1996  lytic transglycosylase catalytic  32.79 
 
 		 310 aa  58.9  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000014768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4195  lytic transglycosylase catalytic  31.2 
 
 		 180 aa  57  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1141  hypothetical protein  30.65 
 
 		 190 aa  54.7  0.0000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>