82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0630 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_0630  lytic transglycosylase, catalytic  100 
 
 		 187 aa  387  1e-107  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4182  lytic transglycosylase catalytic  37.13 
 
 		 230 aa  125  5e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4099  lytic transglycosylase catalytic  38.25 
 
 		 230 aa  122  4e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0323  lytic transglycosylase catalytic  36.18 
 
 		 230 aa  122  4e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00170183 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2843  Lytic transglycosylase catalytic  37.91 
 
 		 194 aa  117  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0642  Lytic transglycosylase catalytic  37.13 
 
 		 216 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3720  transglycosylase SLT domain-containing protein  38.04 
 
 		 212 aa  110  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3939  lytic transglycosylase, catalytic  35.06 
 
 		 178 aa  105  6e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.307099  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0965  Lytic transglycosylase catalytic  38.04 
 
 		 206 aa  104  9e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1177  Lytic transglycosylase catalytic  35.09 
 
 		 196 aa  103  2e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3412  lytic transglycosylase catalytic  35.8 
 
 		 196 aa  102  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.17107  normal  0.120299 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1197  hypothetical protein  36.52 
 
 		 196 aa  103  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.66344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2334  lytic transglycosylase, catalytic  37.18 
 
 		 196 aa  103  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000370979  unclonable  0.00000020611 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2378  hypothetical protein  38.06 
 
 		 206 aa  102  3e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.268225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0529  lytic transglycosylase, catalytic  36.36 
 
 		 202 aa  102  3e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4167  lytic transglycosylase catalytic  37.18 
 
 		 201 aa  102  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.381965  normal  0.719348 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3010  lytic transglycosylase, catalytic  41.04 
 
 		 171 aa  102  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.857835 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2210  lytic transglycosylase, catalytic  36.88 
 
 		 206 aa  100  9e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.31341 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2932  lytic transglycosylase, catalytic  36.67 
 
 		 184 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1410  lytic transglycosylase, catalytic  36.6 
 
 		 196 aa  99  4e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.942622 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1276  lytic transglycosylase, catalytic  36.6 
 
 		 196 aa  99  4e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.11854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3303  lytic transglycosylase catalytic  36.67 
 
 		 184 aa  98.6  5e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0671  Lytic transglycosylase catalytic  35.95 
 
 		 194 aa  96.7  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.720466 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1456  hypothetical protein  37.93 
 
 		 185 aa  96.3  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.400951 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0450  putative signal peptide  32.14 
 
 		 196 aa  94.7  6e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1640  Lytic transglycosylase catalytic  32.4 
 
 		 196 aa  92.8  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59660  hypothetical protein  42.31 
 
 		 193 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000384805  hitchhiker  1.2342600000000001e-18 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1529  hypothetical protein  38.97 
 
 		 257 aa  92  4e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5194  type IV secretory pathway, putative lytic transglycosylase; putative exported protein  38.97 
 
 		 257 aa  92  4e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.851054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4498  soluble lytic murein transglycosylase  42.31 
 
 		 193 aa  92.4  4e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.92102  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5548  lytic transglycosylase catalytic  37.8 
 
 		 268 aa  87  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00871042 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1708  lytic transglycosylase, catalytic  34.38 
 
 		 265 aa  86.3  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0133415 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0336  Lytic transglycosylase catalytic  36.57 
 
 		 185 aa  86.3  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.706731 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0072  invasion protein  33.12 
 
 		 265 aa  83.6  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6298  hypothetical protein  34.85 
 
 		 265 aa  83.6  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.192208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6568  lytic transglycosylase catalytic  36.8 
 
 		 269 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0192  transglycosylase SLT domain-containing protein  36.67 
 
 		 177 aa  82.8  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000268096 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2978  lytic transglycosylase, catalytic  37.29 
 
 		 226 aa  81.6  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.993204 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1319  invasion protein  37.29 
 
 		 226 aa  81.6  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0368  Lytic transglycosylase catalytic  33.83 
 
 		 185 aa  80.5  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.766168 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0274  lytic transglycosylase catalytic  33.73 
 
 		 174 aa  79.3  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.624808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1661  lytic transglycosylase, catalytic  32.92 
 
 		 260 aa  79.3  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.469495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2614  lytic transglycosylase, catalytic  35.88 
 
 		 229 aa  76.3  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.214877 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0593  hypothetical protein  34.62 
 
 		 267 aa  74.7  0.0000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.557269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2684  lytic transglycosylase catalytic  34.35 
 
 		 177 aa  72.8  0.000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.173573 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2898  lytic transglycosylase, catalytic  31.65 
 
 		 369 aa  72.4  0.000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  unclonable  0.00000087511  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0761  hypothetical protein  34.09 
 
 		 182 aa  72  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.112238  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2548  hypothetical protein  29.63 
 
 		 302 aa  71.6  0.000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0613  Lytic transglycosylase catalytic  31.33 
 
 		 197 aa  71.2  0.000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.92837  normal  0.279374 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4195  lytic transglycosylase catalytic  31.29 
 
 		 180 aa  69.7  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3431  Lytic transglycosylase catalytic  31.62 
 
 		 320 aa  69.7  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3707  hypothetical protein  32.67 
 
 		 251 aa  70.1  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0917691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0634  lytic transglycosylase catalytic  33.09 
 
 		 179 aa  68.9  0.00000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.308805  normal  0.480639 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0281  lytic transglycosylase, catalytic  31.87 
 
 		 182 aa  68.9  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0645  Lytic transglycosylase catalytic  33.09 
 
 		 222 aa  68.9  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.176498 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1676  lytic transglycosylase catalytic  30.56 
 
 		 181 aa  68.2  0.00000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0660127  normal  0.0250145 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0040  Lytic transglycosylase catalytic  35.34 
 
 		 187 aa  68.2  0.00000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1141  hypothetical protein  31.21 
 
 		 190 aa  67.8  0.00000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3220  lytic transglycosylase catalytic  32.58 
 
 		 184 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.140959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1996  lytic transglycosylase catalytic  34.56 
 
 		 310 aa  63.9  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000014768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1110  lytic transglycosylase, catalytic  31.15 
 
 		 175 aa  61.6  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.830854 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0248  Lytic transglycosylase catalytic  27.11 
 
 		 168 aa  59.7  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1124  transglycosylase  30 
 
 		 190 aa  58.9  0.00000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2121  transglycosylase SLT domain-containing protein  27.98 
 
 		 168 aa  55.8  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0193  lytic transglycosylase, catalytic  26.35 
 
 		 168 aa  53.9  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2003  Lytic transglycosylase catalytic  26.87 
 
 		 207 aa  51.6  0.000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.323498  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0964  Lytic transglycosylase catalytic  28.47 
 
 		 153 aa  51.6  0.000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3796  lytic transglycosylase, catalytic  24.2 
 
 		 179 aa  48.9  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.823369  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2444  lytic transglycosylase catalytic  30.69 
 
 		 374 aa  45.4  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1544  lytic transglycosylase, catalytic  31.33 
 
 		 175 aa  45.4  0.0005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0439375  normal  0.269164 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0953  lytic transglycosylase, catalytic  31.25 
 
 		 378 aa  42.7  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0812  lytic transglycosylase, catalytic  31.25 
 
 		 372 aa  42.4  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0474  lytic transglycosylase, catalytic  31.25 
 
 		 378 aa  42.7  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4054  lytic transglycosylase, catalytic  31.65 
 
 		 370 aa  42.7  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0915  lytic transglycosylase catalytic  31.25 
 
 		 378 aa  42.7  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.423978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0823  lytic transglycosylase catalytic  31.25 
 
 		 372 aa  42.7  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.600223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0562  Lytic transglycosylase catalytic  24.64 
 
 		 180 aa  42.4  0.004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0104  pilx1 protein  35.09 
 
 		 215 aa  42  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.718662 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0195  lytic transglycosylase catalytic protein  23.65 
 
 		 239 aa  42  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2991  lytic transglycosylase, catalytic  29.2 
 
 		 295 aa  42  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.617808  normal  0.305104 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0177  Lytic transglycosylase catalytic  22.97 
 
 		 239 aa  42  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000012846 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2099  lytic transglycosylase, catalytic  30.68 
 
 		 210 aa  41.6  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.462435  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>