91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2898 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_2898  lytic transglycosylase, catalytic  100 
 
 		 369 aa  740    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  unclonable  0.00000087511  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3431  Lytic transglycosylase catalytic  42.8 
 
 		 320 aa  175  9.999999999999999e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1996  lytic transglycosylase catalytic  46.79 
 
 		 310 aa  143  6e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000014768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2548  hypothetical protein  42.67 
 
 		 302 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0072  invasion protein  39.22 
 
 		 265 aa  116  6e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1708  lytic transglycosylase, catalytic  39.47 
 
 		 265 aa  116  6.9999999999999995e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0133415 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1661  lytic transglycosylase, catalytic  38.96 
 
 		 260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.469495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2614  lytic transglycosylase, catalytic  37.2 
 
 		 229 aa  107  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.214877 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0593  hypothetical protein  34.38 
 
 		 267 aa  103  6e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.557269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1319  invasion protein  38 
 
 		 226 aa  101  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2978  lytic transglycosylase, catalytic  38 
 
 		 226 aa  101  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.993204 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0281  lytic transglycosylase, catalytic  37.98 
 
 		 182 aa  93.2  7e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3707  hypothetical protein  37.21 
 
 		 251 aa  92.4  1e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0917691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0040  Lytic transglycosylase catalytic  38.46 
 
 		 187 aa  86.7  5e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1124  transglycosylase  33.08 
 
 		 190 aa  85.9  0.000000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0613  Lytic transglycosylase catalytic  33.99 
 
 		 197 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.92837  normal  0.279374 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1141  hypothetical protein  30.71 
 
 		 190 aa  83.2  0.000000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3220  lytic transglycosylase catalytic  36.15 
 
 		 184 aa  82.8  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.140959  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2684  lytic transglycosylase catalytic  36.92 
 
 		 177 aa  81.3  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.173573 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0645  Lytic transglycosylase catalytic  35.61 
 
 		 222 aa  82  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.176498 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0634  lytic transglycosylase catalytic  35.61 
 
 		 179 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.308805  normal  0.480639 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1676  lytic transglycosylase catalytic  33.8 
 
 		 181 aa  80.1  0.00000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0660127  normal  0.0250145 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0761  hypothetical protein  36.64 
 
 		 182 aa  79.7  0.00000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.112238  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3939  lytic transglycosylase, catalytic  28.93 
 
 		 178 aa  77.4  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.307099  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3720  transglycosylase SLT domain-containing protein  35 
 
 		 212 aa  77  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1110  lytic transglycosylase, catalytic  32.56 
 
 		 175 aa  76.3  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.830854 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4195  lytic transglycosylase catalytic  29.23 
 
 		 180 aa  75.9  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0274  lytic transglycosylase catalytic  32.06 
 
 		 174 aa  74.7  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.624808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2378  hypothetical protein  36.96 
 
 		 206 aa  75.1  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.268225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6298  hypothetical protein  36.28 
 
 		 265 aa  74.3  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.192208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0965  Lytic transglycosylase catalytic  37.04 
 
 		 206 aa  74.3  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0368  Lytic transglycosylase catalytic  33.33 
 
 		 185 aa  73.9  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.766168 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0336  Lytic transglycosylase catalytic  33.33 
 
 		 185 aa  73.6  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.706731 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2932  lytic transglycosylase, catalytic  34.31 
 
 		 184 aa  73.2  0.000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2210  lytic transglycosylase, catalytic  36.23 
 
 		 206 aa  73.2  0.000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.31341 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2334  lytic transglycosylase, catalytic  33.15 
 
 		 196 aa  72.8  0.000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000370979  unclonable  0.00000020611 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0630  lytic transglycosylase, catalytic  31.65 
 
 		 187 aa  72.4  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4099  lytic transglycosylase catalytic  39.42 
 
 		 230 aa  70.5  0.00000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0671  Lytic transglycosylase catalytic  35.56 
 
 		 194 aa  70.5  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.720466 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6568  lytic transglycosylase catalytic  34 
 
 		 269 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5194  type IV secretory pathway, putative lytic transglycosylase; putative exported protein  30.6 
 
 		 257 aa  70.1  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.851054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1529  hypothetical protein  30.6 
 
 		 257 aa  70.1  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5548  lytic transglycosylase catalytic  33.57 
 
 		 268 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00871042 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2843  Lytic transglycosylase catalytic  34.9 
 
 		 194 aa  70.1  0.00000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0323  lytic transglycosylase catalytic  36.51 
 
 		 230 aa  69.7  0.00000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00170183 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3303  lytic transglycosylase catalytic  33.58 
 
 		 184 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4182  lytic transglycosylase catalytic  38.46 
 
 		 230 aa  68.2  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1276  lytic transglycosylase, catalytic  32.04 
 
 		 196 aa  67.8  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.11854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1410  lytic transglycosylase, catalytic  32.04 
 
 		 196 aa  67.8  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.942622 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0642  Lytic transglycosylase catalytic  31.11 
 
 		 216 aa  67.4  0.0000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1177  Lytic transglycosylase catalytic  33.33 
 
 		 196 aa  66.6  0.0000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1456  hypothetical protein  35.04 
 
 		 185 aa  66.6  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.400951 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1197  hypothetical protein  32.62 
 
 		 196 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.66344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0529  lytic transglycosylase, catalytic  34.06 
 
 		 202 aa  65.9  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3412  lytic transglycosylase catalytic  32.62 
 
 		 196 aa  65.9  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.17107  normal  0.120299 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4167  lytic transglycosylase catalytic  32.62 
 
 		 201 aa  65.1  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.381965  normal  0.719348 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3010  lytic transglycosylase, catalytic  32.61 
 
 		 171 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.857835 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1640  Lytic transglycosylase catalytic  30.38 
 
 		 196 aa  61.2  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59660  hypothetical protein  30.26 
 
 		 193 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000384805  hitchhiker  1.2342600000000001e-18 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4498  soluble lytic murein transglycosylase  30.26 
 
 		 193 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.92102  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0192  transglycosylase SLT domain-containing protein  31.01 
 
 		 177 aa  58.9  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000268096 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0450  putative signal peptide  29.92 
 
 		 196 aa  55.1  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3519  putative ipgF protein  31.65 
 
 		 216 aa  52.4  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2787  ipgF protein, putative  40.24 
 
 		 152 aa  49.7  0.00008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.062319  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2661  putative ipgF protein  40.24 
 
 		 152 aa  49.7  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0219  HpaH precursor  40.24 
 
 		 161 aa  49.7  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0006  putative invasion protein  40.24 
 
 		 161 aa  49.7  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.435281  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0006  putative invasion protein  40.24 
 
 		 161 aa  49.7  0.00008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1891  putative ipgF protein  40.24 
 
 		 152 aa  49.7  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.65052  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1938  lytic transglycosylase catalytic  27.16 
 
 		 438 aa  47.4  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0154763 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0063  lytic transglycosylase catalytic  37.04 
 
 		 149 aa  47  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4502  hypothetical protein  40 
 
 		 148 aa  47.4  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.362894 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0053  lytic transglycosylase, catalytic  37.04 
 
 		 159 aa  47  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3245  lytic transglycosylase  35.8 
 
 		 149 aa  46.6  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.432237 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0006  BapC protein  36.59 
 
 		 149 aa  46.2  0.0009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0847  BapC protein  32.93 
 
 		 182 aa  46.2  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0082  lytic transglycosylase catalytic  35.8 
 
 		 161 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0007  lytic transglycosylase, catalytic  35.8 
 
 		 164 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.37161  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0063  lytic transglycosylase, catalytic  35.8 
 
 		 164 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0064  lytic transglycosylase catalytic  34.57 
 
 		 148 aa  45.1  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3935  Lytic transglycosylase catalytic  38.27 
 
 		 148 aa  44.7  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3069  lytic transglycosylase catalytic  38.67 
 
 		 147 aa  43.9  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0145622 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2156  BapC protein  32.93 
 
 		 187 aa  43.9  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0565  BapC protein  32.93 
 
 		 187 aa  43.5  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.146526  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1524  BapC protein  32.93 
 
 		 187 aa  43.5  0.006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.177877  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1364  lytic transglycosylase, catalytic  28.7 
 
 		 140 aa  43.5  0.006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0515588  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2079  BapC protein  32.93 
 
 		 187 aa  43.5  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.22209  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2068  BapC protein  32.93 
 
 		 187 aa  43.5  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0527025  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0760  BapC protein  32.93 
 
 		 187 aa  43.5  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.832936  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4498  lytic transglycosylase, catalytic  25.16 
 
 		 404 aa  42.7  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0873  lytic transglycosylase, catalytic  24.6 
 
 		 599 aa  42.7  0.01  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>