63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_1640 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_1640  Lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 
196 aa  393  1e-109  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0450  putative signal peptide  83.67 
 
 
196 aa  337  5.9999999999999996e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1177  Lytic transglycosylase catalytic  69.89 
 
 
196 aa  263  2e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1197  hypothetical protein  67.51 
 
 
196 aa  259  1e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.66344  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4167  lytic transglycosylase catalytic  65.17 
 
 
201 aa  258  3e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.381965  normal  0.719348 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2334  lytic transglycosylase, catalytic  65.99 
 
 
196 aa  257  6e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000370979  unclonable  0.00000020611 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3412  lytic transglycosylase catalytic  68.51 
 
 
196 aa  253  2.0000000000000002e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.17107  normal  0.120299 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1410  lytic transglycosylase, catalytic  69.61 
 
 
196 aa  251  6e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.942622 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1276  lytic transglycosylase, catalytic  69.61 
 
 
196 aa  251  6e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.11854  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0671  Lytic transglycosylase catalytic  69.41 
 
 
194 aa  246  2e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.720466 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2210  lytic transglycosylase, catalytic  68.02 
 
 
206 aa  244  8e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.31341 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0965  Lytic transglycosylase catalytic  66.86 
 
 
206 aa  241  5e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2378  hypothetical protein  66.28 
 
 
206 aa  238  4e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.268225  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2843  Lytic transglycosylase catalytic  59.18 
 
 
194 aa  229  2e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0529  lytic transglycosylase, catalytic  63.01 
 
 
202 aa  218  6e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1456  hypothetical protein  51.7 
 
 
185 aa  189  2e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.400951 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3010  lytic transglycosylase, catalytic  53.85 
 
 
171 aa  185  4e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.857835 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2932  lytic transglycosylase, catalytic  54.55 
 
 
184 aa  174  7e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3303  lytic transglycosylase catalytic  50.3 
 
 
184 aa  173  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59660  hypothetical protein  48.09 
 
 
193 aa  161  7e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000384805  hitchhiker  1.2342600000000001e-18 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4498  soluble lytic murein transglycosylase  50.61 
 
 
193 aa  154  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.92102  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0642  Lytic transglycosylase catalytic  40.41 
 
 
216 aa  137  1e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4099  lytic transglycosylase catalytic  41.08 
 
 
230 aa  128  6e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4182  lytic transglycosylase catalytic  39.59 
 
 
230 aa  127  1.0000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0323  lytic transglycosylase catalytic  39.58 
 
 
230 aa  126  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00170183 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3720  transglycosylase SLT domain-containing protein  38.83 
 
 
212 aa  119  3.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3939  lytic transglycosylase, catalytic  36.57 
 
 
178 aa  99.8  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.307099  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0630  lytic transglycosylase, catalytic  32.4 
 
 
187 aa  92.8  3e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0192  transglycosylase SLT domain-containing protein  36.3 
 
 
177 aa  83.6  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000268096 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2978  lytic transglycosylase, catalytic  38.79 
 
 
226 aa  76.6  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.993204 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1319  invasion protein  38.79 
 
 
226 aa  76.6  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2614  lytic transglycosylase, catalytic  37.07 
 
 
229 aa  73.9  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.214877 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0281  lytic transglycosylase, catalytic  33.53 
 
 
182 aa  73.9  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3707  hypothetical protein  34.06 
 
 
251 aa  71.6  0.000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0917691  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0368  Lytic transglycosylase catalytic  29.14 
 
 
185 aa  69.3  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.766168 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0274  lytic transglycosylase catalytic  30.82 
 
 
174 aa  68.2  0.00000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.624808  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0336  Lytic transglycosylase catalytic  29.14 
 
 
185 aa  68.2  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.706731 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0593  hypothetical protein  31.76 
 
 
267 aa  67.8  0.00000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.557269  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2548  hypothetical protein  33.58 
 
 
302 aa  65.9  0.0000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5194  type IV secretory pathway, putative lytic transglycosylase; putative exported protein  31.33 
 
 
257 aa  65.9  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.851054  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1529  hypothetical protein  31.33 
 
 
257 aa  65.9  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5548  lytic transglycosylase catalytic  35.04 
 
 
268 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00871042 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0761  hypothetical protein  30.82 
 
 
182 aa  63.2  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.112238  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6568  lytic transglycosylase catalytic  33.09 
 
 
269 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0613  Lytic transglycosylase catalytic  33.85 
 
 
197 aa  63.2  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.92837  normal  0.279374 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2898  lytic transglycosylase, catalytic  30.38 
 
 
369 aa  61.6  0.000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  unclonable  0.00000087511  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1661  lytic transglycosylase, catalytic  33.33 
 
 
260 aa  61.6  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.469495  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6298  hypothetical protein  30.53 
 
 
265 aa  60.8  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.192208  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3220  lytic transglycosylase catalytic  35.11 
 
 
184 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.140959  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1141  hypothetical protein  29.76 
 
 
190 aa  60.1  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0645  Lytic transglycosylase catalytic  31.54 
 
 
222 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.176498 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0634  lytic transglycosylase catalytic  31.54 
 
 
179 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.308805  normal  0.480639 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2684  lytic transglycosylase catalytic  30.82 
 
 
177 aa  60.5  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.173573 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0040  Lytic transglycosylase catalytic  32.86 
 
 
187 aa  59.7  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1708  lytic transglycosylase, catalytic  32.5 
 
 
265 aa  58.9  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0133415 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0072  invasion protein  30.83 
 
 
265 aa  57.8  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1110  lytic transglycosylase, catalytic  32.23 
 
 
175 aa  57  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.830854 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1124  transglycosylase  27.16 
 
 
190 aa  56.6  0.0000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1676  lytic transglycosylase catalytic  28.57 
 
 
181 aa  54.7  0.0000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0660127  normal  0.0250145 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1996  lytic transglycosylase catalytic  30 
 
 
310 aa  53.9  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000014768  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4195  lytic transglycosylase catalytic  26.8 
 
 
180 aa  52.8  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0253  Lytic transglycosylase catalytic  32.33 
 
 
164 aa  50.4  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3431  Lytic transglycosylase catalytic  30.71 
 
 
320 aa  48.1  0.00009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>