75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0593 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_0593  hypothetical protein  100 
 
 		 267 aa  533  1e-150  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.557269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2614  lytic transglycosylase, catalytic  46.32 
 
 		 229 aa  152  8e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.214877 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2978  lytic transglycosylase, catalytic  52.41 
 
 		 226 aa  142  4e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.993204 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1319  invasion protein  52.41 
 
 		 226 aa  142  4e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1661  lytic transglycosylase, catalytic  42.86 
 
 		 260 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.469495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0072  invasion protein  35.86 
 
 		 265 aa  118  7.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1708  lytic transglycosylase, catalytic  35.86 
 
 		 265 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0133415 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2548  hypothetical protein  41.72 
 
 		 302 aa  108  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2898  lytic transglycosylase, catalytic  34.34 
 
 		 369 aa  106  3e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  unclonable  0.00000087511  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3431  Lytic transglycosylase catalytic  38.03 
 
 		 320 aa  106  4e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0368  Lytic transglycosylase catalytic  42.07 
 
 		 185 aa  101  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.766168 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0336  Lytic transglycosylase catalytic  42.07 
 
 		 185 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.706731 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0274  lytic transglycosylase catalytic  41.67 
 
 		 174 aa  99.8  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.624808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4195  lytic transglycosylase catalytic  40.14 
 
 		 180 aa  99.8  4e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0761  hypothetical protein  36.81 
 
 		 182 aa  99  7e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.112238  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1124  transglycosylase  36.11 
 
 		 190 aa  97.1  2e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1996  lytic transglycosylase catalytic  39.31 
 
 		 310 aa  97.4  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000014768  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1141  hypothetical protein  40 
 
 		 190 aa  95.1  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3220  lytic transglycosylase catalytic  38.51 
 
 		 184 aa  93.6  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.140959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3707  hypothetical protein  40.74 
 
 		 251 aa  92.8  5e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0917691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0281  lytic transglycosylase, catalytic  37.18 
 
 		 182 aa  91.7  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1676  lytic transglycosylase catalytic  38.76 
 
 		 181 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0660127  normal  0.0250145 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2684  lytic transglycosylase catalytic  39.07 
 
 		 177 aa  90.5  3e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.173573 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1110  lytic transglycosylase, catalytic  35.71 
 
 		 175 aa  89.4  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.830854 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0613  Lytic transglycosylase catalytic  36.54 
 
 		 197 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.92837  normal  0.279374 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0645  Lytic transglycosylase catalytic  35.57 
 
 		 222 aa  87  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.176498 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0634  lytic transglycosylase catalytic  35.57 
 
 		 179 aa  86.7  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.308805  normal  0.480639 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0040  Lytic transglycosylase catalytic  36.92 
 
 		 187 aa  84.7  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3720  transglycosylase SLT domain-containing protein  34.81 
 
 		 212 aa  81.3  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0642  Lytic transglycosylase catalytic  40.16 
 
 		 216 aa  80.9  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1197  hypothetical protein  31.03 
 
 		 196 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.66344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4167  lytic transglycosylase catalytic  32.07 
 
 		 201 aa  79  0.00000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.381965  normal  0.719348 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3412  lytic transglycosylase catalytic  32.89 
 
 		 196 aa  78.6  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.17107  normal  0.120299 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0671  Lytic transglycosylase catalytic  36.67 
 
 		 194 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.720466 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1177  Lytic transglycosylase catalytic  33.11 
 
 		 196 aa  77.4  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0630  lytic transglycosylase, catalytic  34.06 
 
 		 187 aa  77.4  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2334  lytic transglycosylase, catalytic  33.99 
 
 		 196 aa  77  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000370979  unclonable  0.00000020611 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1410  lytic transglycosylase, catalytic  33.33 
 
 		 196 aa  75.5  0.0000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.942622 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6568  lytic transglycosylase catalytic  32.17 
 
 		 269 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1276  lytic transglycosylase, catalytic  33.33 
 
 		 196 aa  75.5  0.0000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.11854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2932  lytic transglycosylase, catalytic  37.78 
 
 		 184 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3303  lytic transglycosylase catalytic  36.67 
 
 		 184 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4099  lytic transglycosylase catalytic  35.29 
 
 		 230 aa  73.9  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2843  Lytic transglycosylase catalytic  30.81 
 
 		 194 aa  72.8  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3939  lytic transglycosylase, catalytic  32.8 
 
 		 178 aa  72.8  0.000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.307099  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3010  lytic transglycosylase, catalytic  33.93 
 
 		 171 aa  72.4  0.000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.857835 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1640  Lytic transglycosylase catalytic  31.09 
 
 		 196 aa  72  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0965  Lytic transglycosylase catalytic  35.48 
 
 		 206 aa  71.2  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2378  hypothetical protein  35.48 
 
 		 206 aa  70.9  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.268225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0323  lytic transglycosylase catalytic  34.56 
 
 		 230 aa  70.1  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00170183 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4182  lytic transglycosylase catalytic  33.82 
 
 		 230 aa  69.7  0.00000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2210  lytic transglycosylase, catalytic  34.68 
 
 		 206 aa  68.9  0.00000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.31341 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0450  putative signal peptide  29.56 
 
 		 196 aa  67.4  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1456  hypothetical protein  32.21 
 
 		 185 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.400951 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0529  lytic transglycosylase, catalytic  31.33 
 
 		 202 aa  65.5  0.0000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59660  hypothetical protein  29.81 
 
 		 193 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000384805  hitchhiker  1.2342600000000001e-18 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5548  lytic transglycosylase catalytic  29.22 
 
 		 268 aa  62  0.000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00871042 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1529  hypothetical protein  30 
 
 		 257 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5194  type IV secretory pathway, putative lytic transglycosylase; putative exported protein  30 
 
 		 257 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.851054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6298  hypothetical protein  30.08 
 
 		 265 aa  62  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.192208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4498  soluble lytic murein transglycosylase  29.55 
 
 		 193 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.92102  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0847  BapC protein  36.73 
 
 		 182 aa  52.8  0.000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2156  BapC protein  32.12 
 
 		 187 aa  52.4  0.000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0760  BapC protein  32.12 
 
 		 187 aa  52  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.832936  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1524  BapC protein  32.12 
 
 		 187 aa  52  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.177877  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0565  BapC protein  32.12 
 
 		 187 aa  52  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.146526  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2079  BapC protein  32.12 
 
 		 187 aa  52  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.22209  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2068  BapC protein  32.12 
 
 		 187 aa  52  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0527025  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0192  transglycosylase SLT domain-containing protein  30.83 
 
 		 177 aa  49.7  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000268096 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0082  lytic transglycosylase catalytic  28.1 
 
 		 161 aa  43.9  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0964  Lytic transglycosylase catalytic  33.33 
 
 		 153 aa  43.1  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0064  lytic transglycosylase catalytic  29.75 
 
 		 148 aa  42.7  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0007  lytic transglycosylase, catalytic  28.1 
 
 		 164 aa  42.4  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.37161  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0063  lytic transglycosylase, catalytic  28.1 
 
 		 164 aa  42.4  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3245  lytic transglycosylase  29.41 
 
 		 149 aa  42.4  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.432237 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>