135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_0064 on replicon NC_010084
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010084  Bmul_0064  lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 
148 aa  308  2e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0053  lytic transglycosylase, catalytic  90.54 
 
 
159 aa  284  4e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0063  lytic transglycosylase catalytic  88.51 
 
 
149 aa  280  6.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3245  lytic transglycosylase  87.76 
 
 
149 aa  275  1e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.432237 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0082  lytic transglycosylase catalytic  89.66 
 
 
161 aa  275  1e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0007  lytic transglycosylase, catalytic  88.97 
 
 
164 aa  274  3e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.37161  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0063  lytic transglycosylase, catalytic  88.97 
 
 
164 aa  274  3e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0219  HpaH precursor  80.14 
 
 
161 aa  256  6e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0006  putative invasion protein  80.14 
 
 
161 aa  256  6e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0006  putative invasion protein  80.14 
 
 
161 aa  256  6e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.435281  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3519  putative ipgF protein  82.01 
 
 
216 aa  249  8.000000000000001e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2787  ipgF protein, putative  83.82 
 
 
152 aa  249  1e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.062319  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1891  putative ipgF protein  83.82 
 
 
152 aa  249  1e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.65052  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2661  putative ipgF protein  83.82 
 
 
152 aa  249  1e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0006  BapC protein  83.09 
 
 
149 aa  245  1e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4502  hypothetical protein  73.65 
 
 
148 aa  226  6e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.362894 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3935  Lytic transglycosylase catalytic  71.23 
 
 
148 aa  226  7e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3069  lytic transglycosylase catalytic  74.26 
 
 
147 aa  223  8e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0145622 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2896  hypothetical protein  54 
 
 
170 aa  171  5e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5666  lytic transglycosylase catalytic  61.67 
 
 
155 aa  166  7e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.326026  hitchhiker  0.0069947 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5883  lytic transglycosylase, catalytic  61.98 
 
 
155 aa  165  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.161206  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3673  lytic transglycosylase catalytic  58.96 
 
 
164 aa  165  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.25232 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4766  Lytic transglycosylase catalytic  53.96 
 
 
161 aa  162  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2361  lytic transglycosylase, catalytic  51.63 
 
 
155 aa  159  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0782158  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5894  lytic transglycosylase catalytic  53.52 
 
 
161 aa  159  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.431421  normal  0.0993718 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3138  Lytic transglycosylase catalytic  57.38 
 
 
157 aa  156  7e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.82617  normal  0.443685 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2772  Lytic transglycosylase catalytic  56.56 
 
 
157 aa  155  3e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.806121 
 
 
-
 
NC_003296  RS05356  putative lipoprotein  56.3 
 
 
232 aa  145  2.0000000000000003e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.592846  normal  0.453874 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03391  Hpa2  65 
 
 
108 aa  143  7.0000000000000006e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5033  Lytic transglycosylase catalytic  54.39 
 
 
145 aa  132  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5439  Lytic transglycosylase catalytic  53.51 
 
 
145 aa  130  6e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0847  BapC protein  51.2 
 
 
182 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0565  BapC protein  51.61 
 
 
187 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.146526  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1524  BapC protein  51.64 
 
 
187 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.177877  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2079  BapC protein  51.64 
 
 
187 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.22209  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2068  BapC protein  51.64 
 
 
187 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0527025  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0760  BapC protein  51.64 
 
 
187 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.832936  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2156  BapC protein  53.51 
 
 
187 aa  125  3e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4498  lytic transglycosylase, catalytic  50.88 
 
 
404 aa  123  8.000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6296  lytic transglycosylase, catalytic  46.4 
 
 
140 aa  122  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.270773  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5196  Lytic transglycosylase catalytic  49.59 
 
 
158 aa  122  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1337  lytic transglycosylase catalytic  50 
 
 
408 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.545884  normal  0.0328335 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1531  Lytic transglycosylase catalytic  49.59 
 
 
158 aa  122  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1355  lytic transglycosylase, catalytic  50 
 
 
408 aa  121  3e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0669029  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5550  lytic transglycosylase catalytic  48 
 
 
141 aa  121  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0239978 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7409  Lytic transglycosylase catalytic  51.72 
 
 
226 aa  121  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2121  transglycosylase SLT domain-containing protein  44.83 
 
 
168 aa  120  5e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1938  lytic transglycosylase catalytic  49.12 
 
 
438 aa  120  6e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0154763 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0873  lytic transglycosylase, catalytic  46.56 
 
 
599 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1239  lytic transglycosylase, catalytic  50 
 
 
404 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1265  lytic transglycosylase catalytic  50 
 
 
407 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.254605 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6566  lytic transglycosylase catalytic  48 
 
 
140 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0379  invasion protein  50.88 
 
 
146 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.135493  normal 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5422  Lytic transglycosylase catalytic  47.2 
 
 
183 aa  118  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.984316  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5017  Lytic transglycosylase catalytic  46.4 
 
 
183 aa  116  7.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.260237  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5233  lytic transglycosylase, catalytic  49.59 
 
 
203 aa  116  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00145184  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4243  lytic transglycosylase, catalytic  50.36 
 
 
178 aa  116  9.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.547585  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0195  lytic transglycosylase catalytic protein  47.62 
 
 
239 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0177  Lytic transglycosylase catalytic  46.83 
 
 
239 aa  113  7.999999999999999e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000012846 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5437  lytic transglycosylase, catalytic  47.17 
 
 
179 aa  112  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.43825  normal  0.56373 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4488  lytic transglycosylase, catalytic  46.23 
 
 
248 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1098  Lytic transglycosylase catalytic  46.77 
 
 
213 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.891571  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0964  Lytic transglycosylase catalytic  47.54 
 
 
153 aa  108  3e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0248  Lytic transglycosylase catalytic  47.5 
 
 
168 aa  107  7.000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_23  transglycosylase PilT  44.03 
 
 
145 aa  106  1e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.846222  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0193  lytic transglycosylase, catalytic  45.08 
 
 
168 aa  105  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3796  lytic transglycosylase, catalytic  45.97 
 
 
179 aa  103  9e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.823369  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2099  lytic transglycosylase, catalytic  44.92 
 
 
210 aa  101  3e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.462435  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4187  lytic transglycosylase, catalytic  41.18 
 
 
166 aa  99.4  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.000629  decreased coverage  0.0000117899 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5072  transglycosylase SLT domain protein  42.5 
 
 
152 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.110513 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0043  lytic transglycosylase  45 
 
 
215 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3066  invasion protein IagB  41.27 
 
 
160 aa  93.2  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.490533 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3082  cell invasion protein  41.27 
 
 
160 aa  93.2  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000116628 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2999  invasion protein IagB  41.27 
 
 
160 aa  93.2  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000303944  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3187  cell invasion protein  41.27 
 
 
160 aa  93.2  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.927975 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3030  invasion protein IagB  41.27 
 
 
160 aa  92.8  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0325324 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2644  lytic transglycosylase, catalytic  41.86 
 
 
182 aa  90.9  5e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1544  lytic transglycosylase, catalytic  39.85 
 
 
175 aa  90.1  8e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0439375  normal  0.269164 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1431  lytic transglycosylase, catalytic  43.09 
 
 
170 aa  89.7  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2311  lytic transglycosylase, catalytic  42.59 
 
 
183 aa  87.4  5e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6234  lytic transglycosylase catalytic  38.93 
 
 
151 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0011  conjugal transfer protein  38.02 
 
 
159 aa  82  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0168  protein IpgF  41.18 
 
 
152 aa  80.5  0.000000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00546577  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0042  pilT protein  36.55 
 
 
163 aa  80.5  0.000000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4125  lytic transglycosylase PilT  35.71 
 
 
167 aa  80.5  0.000000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000476698 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0049  pilT protein, putative  36.96 
 
 
150 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0111  lytic transglycosylase PilT  37.14 
 
 
186 aa  79.7  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6789  lytic transglycosylase, catalytic  40.21 
 
 
165 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4280  lytic transglycosylase, catalytic  35.38 
 
 
157 aa  77  0.00000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.227858  normal 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0005  transglycosylase SLT domain-containing protein  36.29 
 
 
168 aa  72.8  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0014  conserved hypothetical protein, SLT family  35.83 
 
 
192 aa  72.4  0.000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0060  hypothetical protein  31.06 
 
 
187 aa  70.1  0.000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00816784 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0882  lytic transglycosylase, catalytic  36.22 
 
 
132 aa  70.1  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4262  lytic transglycosylase, catalytic  34.15 
 
 
162 aa  67.8  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0860  lytic transglycosylase catalytic  37.5 
 
 
124 aa  68.2  0.00000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.720569  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0632  Lytic transglycosylase catalytic  34.75 
 
 
175 aa  67.4  0.00000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.23689  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0163  lytic transglycosylase, catalytic  30.17 
 
 
145 aa  67  0.00000000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0042056  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0834  Lytic transglycosylase catalytic  36.46 
 
 
124 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0057  conjugal transfer protein TrbN  34.45 
 
 
206 aa  62  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0125  putative conjugal transfer protein TrbN  32.28 
 
 
159 aa  61.2  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.268051  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>