162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0253 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0253  Lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 		 164 aa  333  5e-91  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0562  Lytic transglycosylase catalytic  57.35 
 
 		 180 aa  153  9e-37  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0248  Lytic transglycosylase catalytic  37.34 
 
 		 168 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6296  lytic transglycosylase, catalytic  35.03 
 
 		 140 aa  82  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.270773  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2121  transglycosylase SLT domain-containing protein  31.87 
 
 		 168 aa  81.3  0.000000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0193  lytic transglycosylase, catalytic  35.37 
 
 		 168 aa  79.3  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3796  lytic transglycosylase, catalytic  33.33 
 
 		 179 aa  78.2  0.00000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.823369  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0379  invasion protein  33.33 
 
 		 146 aa  75.5  0.0000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.135493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1544  lytic transglycosylase, catalytic  31.79 
 
 		 175 aa  73.6  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0439375  normal  0.269164 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0964  Lytic transglycosylase catalytic  35.42 
 
 		 153 aa  72  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4498  lytic transglycosylase, catalytic  30.36 
 
 		 404 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4488  lytic transglycosylase, catalytic  34.57 
 
 		 248 aa  72  0.000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1938  lytic transglycosylase catalytic  32.19 
 
 		 438 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0154763 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1239  lytic transglycosylase, catalytic  31.71 
 
 		 404 aa  71.2  0.000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0873  lytic transglycosylase, catalytic  29.94 
 
 		 599 aa  70.9  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0195  lytic transglycosylase catalytic protein  35.51 
 
 		 239 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1265  lytic transglycosylase catalytic  31.1 
 
 		 407 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.254605 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3066  invasion protein IagB  30.25 
 
 		 160 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.490533 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0447  putative type IV secretion system protein VirB1  34.86 
 
 		 215 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.941196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1431  lytic transglycosylase, catalytic  33.55 
 
 		 170 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7409  Lytic transglycosylase catalytic  32.88 
 
 		 226 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3187  cell invasion protein  30.25 
 
 		 160 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.927975 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3030  invasion protein IagB  30.25 
 
 		 160 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0325324 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3082  cell invasion protein  30.25 
 
 		 160 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000116628 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2999  invasion protein IagB  30.25 
 
 		 160 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000303944  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2311  lytic transglycosylase, catalytic  30.46 
 
 		 183 aa  68.9  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2361  lytic transglycosylase, catalytic  31.1 
 
 		 155 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0782158  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0177  Lytic transglycosylase catalytic  35.51 
 
 		 239 aa  68.9  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000012846 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1337  lytic transglycosylase catalytic  31.94 
 
 		 408 aa  68.6  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.545884  normal  0.0328335 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1355  lytic transglycosylase, catalytic  31.94 
 
 		 408 aa  68.2  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0669029  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5894  lytic transglycosylase catalytic  29.76 
 
 		 161 aa  67.8  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.431421  normal  0.0993718 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5437  lytic transglycosylase, catalytic  29.58 
 
 		 179 aa  67.4  0.00000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.43825  normal  0.56373 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2494  lytic transglycosylase, catalytic  36.07 
 
 		 194 aa  67.8  0.00000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.180368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2644  lytic transglycosylase, catalytic  31.76 
 
 		 182 aa  66.2  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5010  lytic transglycosylase, catalytic  33.33 
 
 		 224 aa  65.1  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.417776  normal  0.129751 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3525  lytic transglycosylase, catalytic  32 
 
 		 262 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.69394  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4841  lytic transglycosylase, catalytic  32 
 
 		 262 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00117575  hitchhiker  0.00476271 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5443  lytic transglycosylase catalytic  32 
 
 		 262 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.297116  normal  0.0393072 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5017  Lytic transglycosylase catalytic  27.81 
 
 		 183 aa  64.7  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.260237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0168  protein IpgF  29.63 
 
 		 152 aa  64.3  0.0000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00546577  n/a   
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5422  Lytic transglycosylase catalytic  27.81 
 
 		 183 aa  64.3  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.984316  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3753  lytic transglycosylase catalytic  27.41 
 
 		 267 aa  64.3  0.0000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.468615  hitchhiker  0.00223581 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5033  Lytic transglycosylase catalytic  33.33 
 
 		 145 aa  63.9  0.0000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5439  Lytic transglycosylase catalytic  33.33 
 
 		 145 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1531  Lytic transglycosylase catalytic  33.33 
 
 		 158 aa  63.5  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5196  Lytic transglycosylase catalytic  33.33 
 
 		 158 aa  63.5  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4379  lytic transglycosylase, catalytic  36.05 
 
 		 181 aa  63.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6234  lytic transglycosylase catalytic  30.66 
 
 		 151 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3673  lytic transglycosylase catalytic  29.27 
 
 		 164 aa  62  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.25232 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5550  lytic transglycosylase catalytic  28.48 
 
 		 141 aa  62  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0239978 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4738  lytic transglycosylase catalytic  31.13 
 
 		 267 aa  62  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.282263  normal  0.965292 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4216  lytic transglycosylase, catalytic  30.84 
 
 		 267 aa  62  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1133  Lytic transglycosylase catalytic  34.34 
 
 		 216 aa  61.6  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4203  lytic transglycosylase catalytic  36.17 
 
 		 215 aa  62  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0873  lytic transglycosylase catalytic  32.71 
 
 		 169 aa  62  0.000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0069  type IV secretion system protein VirB1  34.44 
 
 		 238 aa  61.2  0.000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.165878  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4854  lytic transglycosylase, catalytic  37.08 
 
 		 215 aa  61.2  0.000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3312  lytic transglycosylase, catalytic  37.08 
 
 		 215 aa  61.2  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0063  type IV secretion system protein VirB1  34.44 
 
 		 238 aa  61.2  0.000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1609  Lytic transglycosylase catalytic  41.57 
 
 		 177 aa  60.8  0.000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7344  Lytic transglycosylase catalytic  34.83 
 
 		 270 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.301149  normal  0.254623 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2658  putative conjugal transfer protein, VirB1/TraA like  36.78 
 
 		 217 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.775372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4243  lytic transglycosylase, catalytic  29.46 
 
 		 178 aa  60.1  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.547585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6566  lytic transglycosylase catalytic  29.56 
 
 		 140 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0160  Lytic transglycosylase catalytic  32.26 
 
 		 225 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8227  type IV secretion system lytic transglycosylase VirB1  32.74 
 
 		 238 aa  58.2  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.998898  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0005  transglycosylase SLT domain-containing protein  29.7 
 
 		 168 aa  58.2  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4766  Lytic transglycosylase catalytic  31.33 
 
 		 161 aa  57.8  0.00000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6321  lytic transglycosylase catalytic  30.85 
 
 		 262 aa  57.8  0.00000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4349  lytic transglycosylase, catalytic  35.87 
 
 		 224 aa  57.8  0.00000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0219  HpaH precursor  26.38 
 
 		 161 aa  57.4  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0006  putative invasion protein  26.38 
 
 		 161 aa  57.4  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0006  putative invasion protein  26.38 
 
 		 161 aa  57.4  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.435281  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0006  BapC protein  26.75 
 
 		 149 aa  57.4  0.00000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3245  lytic transglycosylase  28.3 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.432237 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6507  Lytic transglycosylase catalytic  30.56 
 
 		 215 aa  57  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3519  putative ipgF protein  27.33 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0064  lytic transglycosylase catalytic  27.04 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0007  lytic transglycosylase, catalytic  28.3 
 
 		 164 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.37161  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0063  lytic transglycosylase, catalytic  28.3 
 
 		 164 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_23  transglycosylase PilT  29.73 
 
 		 145 aa  54.7  0.0000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.846222  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0082  lytic transglycosylase catalytic  28.3 
 
 		 161 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2355  Lytic transglycosylase catalytic  32.17 
 
 		 203 aa  54.3  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7537  lytic transglycosylase catalytic  30.25 
 
 		 217 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.75484  normal  0.0515023 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2787  ipgF protein, putative  26.92 
 
 		 152 aa  54.3  0.0000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.062319  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1891  putative ipgF protein  26.92 
 
 		 152 aa  54.3  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.65052  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2661  putative ipgF protein  26.92 
 
 		 152 aa  54.3  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0111  lytic transglycosylase PilT  28.03 
 
 		 186 aa  53.9  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2896  hypothetical protein  27.1 
 
 		 170 aa  53.9  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0053  lytic transglycosylase, catalytic  27.67 
 
 		 159 aa  53.5  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1661  lytic transglycosylase, catalytic  33.61 
 
 		 260 aa  53.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.469495  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1489  Lytic transglycosylase catalytic  34.58 
 
 		 215 aa  52.8  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3707  hypothetical protein  34.71 
 
 		 251 aa  52.8  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0917691  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0014  conserved hypothetical protein, SLT family  27.34 
 
 		 192 aa  52.8  0.000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3069  lytic transglycosylase catalytic  26.45 
 
 		 147 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0145622 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4125  lytic transglycosylase PilT  28.48 
 
 		 167 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000476698 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0063  lytic transglycosylase catalytic  27.95 
 
 		 149 aa  53.1  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2444  Lytic transglycosylase catalytic  28.33 
 
 		 327 aa  52.4  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.540003 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1098  Lytic transglycosylase catalytic  31.88 
 
 		 213 aa  52.4  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.891571  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0106  type IV secretory pathway VirB1 component  28.85 
 
 		 220 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>