51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2658 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2658  putative conjugal transfer protein, VirB1/TraA like  100 
 
 
217 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.775372  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1753  putative type IV secretion system protein VirB1  71.89 
 
 
217 aa  297  8e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.660532 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6507  Lytic transglycosylase catalytic  65.14 
 
 
215 aa  268  5.9999999999999995e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0160  Lytic transglycosylase catalytic  57.46 
 
 
225 aa  227  1e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4854  lytic transglycosylase, catalytic  53.57 
 
 
215 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3312  lytic transglycosylase, catalytic  53.57 
 
 
215 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0447  putative type IV secretion system protein VirB1  54.04 
 
 
215 aa  211  5.999999999999999e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.941196  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4203  lytic transglycosylase catalytic  53.12 
 
 
215 aa  206  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0069  type IV secretion system protein VirB1  52.3 
 
 
238 aa  177  8e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.165878  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0063  type IV secretion system protein VirB1  52.3 
 
 
238 aa  177  8e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6321  lytic transglycosylase catalytic  47.37 
 
 
262 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3753  lytic transglycosylase catalytic  52.38 
 
 
267 aa  167  8e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.468615  hitchhiker  0.00223581 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4841  lytic transglycosylase, catalytic  51.06 
 
 
262 aa  166  4e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00117575  hitchhiker  0.00476271 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5443  lytic transglycosylase catalytic  51.06 
 
 
262 aa  166  4e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.297116  normal  0.0393072 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3525  lytic transglycosylase, catalytic  51.06 
 
 
262 aa  166  4e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.69394  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4738  lytic transglycosylase catalytic  51.06 
 
 
267 aa  160  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.282263  normal  0.965292 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4216  lytic transglycosylase, catalytic  52.6 
 
 
267 aa  160  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7537  lytic transglycosylase catalytic  43.84 
 
 
217 aa  152  5e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.75484  normal  0.0515023 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0873  lytic transglycosylase catalytic  47.17 
 
 
169 aa  137  1e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2444  Lytic transglycosylase catalytic  41.34 
 
 
327 aa  120  9.999999999999999e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.540003 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1609  Lytic transglycosylase catalytic  40.49 
 
 
177 aa  108  7.000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5010  lytic transglycosylase, catalytic  40.48 
 
 
224 aa  105  4e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.417776  normal  0.129751 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08216  conjugal transfer protein TraB  36.43 
 
 
200 aa  104  9e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02998  hypothetical protein  36.69 
 
 
316 aa  104  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0106  type IV secretory pathway VirB1 component  37.82 
 
 
220 aa  102  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4379  lytic transglycosylase, catalytic  39.75 
 
 
181 aa  101  9e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4349  lytic transglycosylase, catalytic  34.34 
 
 
224 aa  99.8  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3520  lytic transglycosylase, catalytic  37.2 
 
 
228 aa  95.5  6e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.940795  n/a   
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0033  conjugal transfer protein  32.26 
 
 
225 aa  92  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7344  Lytic transglycosylase catalytic  42.25 
 
 
270 aa  91.7  8e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.301149  normal  0.254623 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1133  Lytic transglycosylase catalytic  36.98 
 
 
216 aa  90.5  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6492  transport secretion system IV protein, VirB1  32.71 
 
 
220 aa  89.4  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.733642  normal  0.924712 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1489  Lytic transglycosylase catalytic  30.91 
 
 
215 aa  88.2  9e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0104  pilx1 protein  32.72 
 
 
215 aa  88.2  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.718662 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5089  transport secretion system IV, VirB1 protein  33.33 
 
 
220 aa  87  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0261  Lytic transglycosylase catalytic  36.25 
 
 
225 aa  85.9  4e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.385484  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6162  type IV secretion system lytic transglycosylase VirB1  34.18 
 
 
235 aa  85.5  5e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151768  normal 
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0009  conjugal transfer protein  32.24 
 
 
203 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.461383  normal  0.692739 
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0035  pilx1 protein  30.86 
 
 
206 aa  81.6  0.000000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4928  transport secretion system IV protein, VirB1  35.9 
 
 
220 aa  80.5  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8227  type IV secretion system lytic transglycosylase VirB1  35.22 
 
 
238 aa  79.3  0.00000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.998898  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2355  Lytic transglycosylase catalytic  33.74 
 
 
203 aa  79.3  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0674  virB1 type IV secretion protein  31.93 
 
 
229 aa  77.8  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1698  conjugal transfer -like protein  33.71 
 
 
223 aa  74.7  0.0000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1397  Lytic transglycosylase catalytic  34.34 
 
 
218 aa  73.9  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2494  lytic transglycosylase, catalytic  34.42 
 
 
194 aa  72.4  0.000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.180368  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0562  Lytic transglycosylase catalytic  38.24 
 
 
180 aa  65.9  0.0000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0253  Lytic transglycosylase catalytic  36.78 
 
 
164 aa  59.7  0.00000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0258  Type IV secretory pathway AvhB1 protein  32.64 
 
 
189 aa  52.8  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2926  lytic transglycosylase catalytic  27.01 
 
 
311 aa  45.1  0.0007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2644  lytic transglycosylase, catalytic  27.74 
 
 
182 aa  42  0.007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>