53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0160 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0160  Lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 		 225 aa  449  1e-125  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0447  putative type IV secretion system protein VirB1  64.76 
 
 		 215 aa  259  2e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.941196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1753  putative type IV secretion system protein VirB1  69.54 
 
 		 217 aa  226  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.660532 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2658  putative conjugal transfer protein, VirB1/TraA like  73.03 
 
 		 217 aa  221  6e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.775372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6507  Lytic transglycosylase catalytic  54.98 
 
 		 215 aa  212  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4203  lytic transglycosylase catalytic  62.11 
 
 		 215 aa  209  3e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3312  lytic transglycosylase, catalytic  54.21 
 
 		 215 aa  208  6e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4854  lytic transglycosylase, catalytic  54.21 
 
 		 215 aa  208  6e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0069  type IV secretion system protein VirB1  55.81 
 
 		 238 aa  189  2.9999999999999997e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.165878  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0063  type IV secretion system protein VirB1  55.81 
 
 		 238 aa  189  2.9999999999999997e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6321  lytic transglycosylase catalytic  50.72 
 
 		 262 aa  182  3e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3525  lytic transglycosylase, catalytic  52.51 
 
 		 262 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.69394  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4841  lytic transglycosylase, catalytic  52.51 
 
 		 262 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00117575  hitchhiker  0.00476271 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5443  lytic transglycosylase catalytic  52.51 
 
 		 262 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.297116  normal  0.0393072 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3753  lytic transglycosylase catalytic  60 
 
 		 267 aa  169  4e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.468615  hitchhiker  0.00223581 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4738  lytic transglycosylase catalytic  52.91 
 
 		 267 aa  167  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.282263  normal  0.965292 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4216  lytic transglycosylase, catalytic  51.41 
 
 		 267 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7537  lytic transglycosylase catalytic  46.77 
 
 		 217 aa  158  7e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.75484  normal  0.0515023 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0873  lytic transglycosylase catalytic  51.7 
 
 		 169 aa  140  1.9999999999999998e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2444  Lytic transglycosylase catalytic  49.23 
 
 		 327 aa  122  5e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.540003 
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0104  pilx1 protein  33.17 
 
 		 215 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.718662 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1609  Lytic transglycosylase catalytic  44.06 
 
 		 177 aa  113  3e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0106  type IV secretory pathway VirB1 component  37.8 
 
 		 220 aa  112  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3520  lytic transglycosylase, catalytic  42.01 
 
 		 228 aa  110  3e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.940795  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4379  lytic transglycosylase, catalytic  44.06 
 
 		 181 aa  109  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5010  lytic transglycosylase, catalytic  42.22 
 
 		 224 aa  108  6e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.417776  normal  0.129751 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02998  hypothetical protein  37.24 
 
 		 316 aa  106  3e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08216  conjugal transfer protein TraB  36.3 
 
 		 200 aa  104  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0033  conjugal transfer protein  34.16 
 
 		 225 aa  102  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4349  lytic transglycosylase, catalytic  33.18 
 
 		 224 aa  99  6e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0009  conjugal transfer protein  34.18 
 
 		 203 aa  96.7  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.461383  normal  0.692739 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1489  Lytic transglycosylase catalytic  32.93 
 
 		 215 aa  95.1  7e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7344  Lytic transglycosylase catalytic  40.74 
 
 		 270 aa  94  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.301149  normal  0.254623 
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0035  pilx1 protein  31.33 
 
 		 206 aa  91.7  9e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8227  type IV secretion system lytic transglycosylase VirB1  35.06 
 
 		 238 aa  91.3  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.998898  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6492  transport secretion system IV protein, VirB1  34.72 
 
 		 220 aa  89.4  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.733642  normal  0.924712 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0261  Lytic transglycosylase catalytic  43.38 
 
 		 225 aa  87.8  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.385484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1133  Lytic transglycosylase catalytic  39.74 
 
 		 216 aa  85.9  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6162  type IV secretion system lytic transglycosylase VirB1  36.13 
 
 		 235 aa  85.1  7e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4928  transport secretion system IV protein, VirB1  33.82 
 
 		 220 aa  82  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2494  lytic transglycosylase, catalytic  36.69 
 
 		 194 aa  81.6  0.000000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.180368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0674  virB1 type IV secretion protein  34.93 
 
 		 229 aa  80.1  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5089  transport secretion system IV, VirB1 protein  38.24 
 
 		 220 aa  77.8  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1698  conjugal transfer -like protein  41.35 
 
 		 223 aa  77.8  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1397  Lytic transglycosylase catalytic  41.35 
 
 		 218 aa  77.8  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2355  Lytic transglycosylase catalytic  32.02 
 
 		 203 aa  72.8  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0562  Lytic transglycosylase catalytic  35.05 
 
 		 180 aa  59.3  0.00000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0253  Lytic transglycosylase catalytic  32.26 
 
 		 164 aa  58.9  0.00000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0258  Type IV secretory pathway AvhB1 protein  32.35 
 
 		 189 aa  54.7  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1544  lytic transglycosylase, catalytic  27.14 
 
 		 175 aa  44.3  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0439375  normal  0.269164 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2873  lytic transglycosylase, catalytic  24.88 
 
 		 296 aa  43.5  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.113557  normal  0.33639 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2311  lytic transglycosylase, catalytic  30.93 
 
 		 183 aa  42  0.008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2644  lytic transglycosylase, catalytic  27.42 
 
 		 182 aa  41.6  0.01  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>