47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6492 on replicon NC_012854
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012854  Rleg_6492  transport secretion system IV protein, VirB1  100 
 
 		 220 aa  445  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.733642  normal  0.924712 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4928  transport secretion system IV protein, VirB1  71.36 
 
 		 220 aa  315  5e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5089  transport secretion system IV, VirB1 protein  53.64 
 
 		 220 aa  226  2e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0674  virB1 type IV secretion protein  51.09 
 
 		 229 aa  216  2e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4349  lytic transglycosylase, catalytic  51.79 
 
 		 224 aa  215  4e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2658  putative conjugal transfer protein, VirB1/TraA like  39.04 
 
 		 217 aa  89.4  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.775372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0160  Lytic transglycosylase catalytic  34.72 
 
 		 225 aa  89.4  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6321  lytic transglycosylase catalytic  33.5 
 
 		 262 aa  88.6  8e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1609  Lytic transglycosylase catalytic  41.82 
 
 		 177 aa  85.1  7e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0069  type IV secretion system protein VirB1  41.82 
 
 		 238 aa  83.2  0.000000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.165878  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6507  Lytic transglycosylase catalytic  33.49 
 
 		 215 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0063  type IV secretion system protein VirB1  41.82 
 
 		 238 aa  83.2  0.000000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0873  lytic transglycosylase catalytic  37.69 
 
 		 169 aa  80.5  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7537  lytic transglycosylase catalytic  37.98 
 
 		 217 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.75484  normal  0.0515023 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5010  lytic transglycosylase, catalytic  48.54 
 
 		 224 aa  78.2  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.417776  normal  0.129751 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1753  putative type IV secretion system protein VirB1  36.99 
 
 		 217 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.660532 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0447  putative type IV secretion system protein VirB1  36.81 
 
 		 215 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.941196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4203  lytic transglycosylase catalytic  32.26 
 
 		 215 aa  75.1  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2355  Lytic transglycosylase catalytic  39 
 
 		 203 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4216  lytic transglycosylase, catalytic  36.43 
 
 		 267 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4738  lytic transglycosylase catalytic  37.4 
 
 		 267 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.282263  normal  0.965292 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3525  lytic transglycosylase, catalytic  36.43 
 
 		 262 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.69394  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3753  lytic transglycosylase catalytic  37.01 
 
 		 267 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.468615  hitchhiker  0.00223581 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5443  lytic transglycosylase catalytic  36.43 
 
 		 262 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.297116  normal  0.0393072 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4841  lytic transglycosylase, catalytic  36.43 
 
 		 262 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00117575  hitchhiker  0.00476271 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3312  lytic transglycosylase, catalytic  34.27 
 
 		 215 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4854  lytic transglycosylase, catalytic  34.27 
 
 		 215 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4379  lytic transglycosylase, catalytic  35.25 
 
 		 181 aa  68.6  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7344  Lytic transglycosylase catalytic  30.83 
 
 		 270 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.301149  normal  0.254623 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8227  type IV secretion system lytic transglycosylase VirB1  30.24 
 
 		 238 aa  65.5  0.0000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.998898  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3520  lytic transglycosylase, catalytic  39.05 
 
 		 228 aa  64.7  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.940795  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0258  Type IV secretory pathway AvhB1 protein  27.36 
 
 		 189 aa  62.8  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6162  type IV secretion system lytic transglycosylase VirB1  33.33 
 
 		 235 aa  62.4  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02998  hypothetical protein  27.7 
 
 		 316 aa  59.7  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08216  conjugal transfer protein TraB  28.64 
 
 		 200 aa  59.7  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1397  Lytic transglycosylase catalytic  29.66 
 
 		 218 aa  55.5  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1698  conjugal transfer -like protein  29.66 
 
 		 223 aa  55.1  0.0000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0261  Lytic transglycosylase catalytic  33.33 
 
 		 225 aa  53.1  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.385484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2494  lytic transglycosylase, catalytic  33.04 
 
 		 194 aa  50.8  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.180368  normal  1 
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0009  conjugal transfer protein  25.5 
 
 		 203 aa  48.9  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.461383  normal  0.692739 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0562  Lytic transglycosylase catalytic  29.67 
 
 		 180 aa  48.5  0.00008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1133  Lytic transglycosylase catalytic  27.97 
 
 		 216 aa  47  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2444  Lytic transglycosylase catalytic  31.07 
 
 		 327 aa  44.3  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.540003 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0106  type IV secretory pathway VirB1 component  27.43 
 
 		 220 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0033  conjugal transfer protein  23.18 
 
 		 225 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0104  pilx1 protein  27.59 
 
 		 215 aa  43.5  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.718662 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0253  Lytic transglycosylase catalytic  28.57 
 
 		 164 aa  41.6  0.009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>