56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_7537 on replicon NC_010627
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010627  Bphy_7537  lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 		 217 aa  444  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.75484  normal  0.0515023 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0069  type IV secretion system protein VirB1  52.05 
 
 		 238 aa  184  8e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.165878  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0063  type IV secretion system protein VirB1  52.05 
 
 		 238 aa  184  8e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6321  lytic transglycosylase catalytic  50.28 
 
 		 262 aa  172  5e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3753  lytic transglycosylase catalytic  50.8 
 
 		 267 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.468615  hitchhiker  0.00223581 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3525  lytic transglycosylase, catalytic  49.47 
 
 		 262 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.69394  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4841  lytic transglycosylase, catalytic  49.47 
 
 		 262 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00117575  hitchhiker  0.00476271 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5443  lytic transglycosylase catalytic  49.47 
 
 		 262 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.297116  normal  0.0393072 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4216  lytic transglycosylase, catalytic  48.66 
 
 		 267 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6507  Lytic transglycosylase catalytic  47.14 
 
 		 215 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4738  lytic transglycosylase catalytic  48.9 
 
 		 267 aa  160  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.282263  normal  0.965292 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0160  Lytic transglycosylase catalytic  46.77 
 
 		 225 aa  158  6e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0447  putative type IV secretion system protein VirB1  46.73 
 
 		 215 aa  158  8e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.941196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4854  lytic transglycosylase, catalytic  47.51 
 
 		 215 aa  150  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3312  lytic transglycosylase, catalytic  47.51 
 
 		 215 aa  150  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4203  lytic transglycosylase catalytic  47.51 
 
 		 215 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2658  putative conjugal transfer protein, VirB1/TraA like  50.64 
 
 		 217 aa  145  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.775372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0873  lytic transglycosylase catalytic  46.51 
 
 		 169 aa  135  7.000000000000001e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1753  putative type IV secretion system protein VirB1  47.44 
 
 		 217 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.660532 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2444  Lytic transglycosylase catalytic  50 
 
 		 327 aa  130  1.0000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.540003 
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0033  conjugal transfer protein  34.78 
 
 		 225 aa  119  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0106  type IV secretory pathway VirB1 component  39.47 
 
 		 220 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1609  Lytic transglycosylase catalytic  41.48 
 
 		 177 aa  108  8.000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08216  conjugal transfer protein TraB  32.04 
 
 		 200 aa  106  3e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02998  hypothetical protein  32.04 
 
 		 316 aa  104  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4379  lytic transglycosylase, catalytic  37.65 
 
 		 181 aa  100  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0035  pilx1 protein  36.42 
 
 		 206 aa  98.2  9e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0104  pilx1 protein  34.18 
 
 		 215 aa  96.7  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.718662 
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0009  conjugal transfer protein  30.81 
 
 		 203 aa  96.3  3e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.461383  normal  0.692739 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1133  Lytic transglycosylase catalytic  39.86 
 
 		 216 aa  92.4  5e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1489  Lytic transglycosylase catalytic  32.91 
 
 		 215 aa  91.3  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7344  Lytic transglycosylase catalytic  37.88 
 
 		 270 aa  88.6  6e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.301149  normal  0.254623 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3520  lytic transglycosylase, catalytic  37.75 
 
 		 228 aa  85.9  5e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.940795  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5089  transport secretion system IV, VirB1 protein  32.39 
 
 		 220 aa  85.5  5e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5010  lytic transglycosylase, catalytic  38.85 
 
 		 224 aa  85.1  7e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.417776  normal  0.129751 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1397  Lytic transglycosylase catalytic  30.85 
 
 		 218 aa  82.8  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4349  lytic transglycosylase, catalytic  28.1 
 
 		 224 aa  83.2  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1698  conjugal transfer -like protein  33.97 
 
 		 223 aa  80.9  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0261  Lytic transglycosylase catalytic  33.33 
 
 		 225 aa  79.3  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.385484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6162  type IV secretion system lytic transglycosylase VirB1  36.91 
 
 		 235 aa  79.3  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151768  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6492  transport secretion system IV protein, VirB1  37.98 
 
 		 220 aa  79  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.733642  normal  0.924712 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8227  type IV secretion system lytic transglycosylase VirB1  28.85 
 
 		 238 aa  75.1  0.0000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.998898  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2355  Lytic transglycosylase catalytic  30.07 
 
 		 203 aa  73.6  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4928  transport secretion system IV protein, VirB1  39.29 
 
 		 220 aa  70.9  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0674  virB1 type IV secretion protein  31.25 
 
 		 229 aa  68.2  0.00000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2494  lytic transglycosylase, catalytic  32.67 
 
 		 194 aa  61.2  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.180368  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0562  Lytic transglycosylase catalytic  34.07 
 
 		 180 aa  57  0.0000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0253  Lytic transglycosylase catalytic  30.25 
 
 		 164 aa  54.7  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9599  conjugal transfer protein TraH  30.87 
 
 		 211 aa  53.5  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4305  conjugal transfer protein TraH  30.07 
 
 		 207 aa  50.1  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.670535  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4543  conjugal transfer protein TraH  28.17 
 
 		 207 aa  48.5  0.00008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3707  hypothetical protein  34.09 
 
 		 251 aa  47.4  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0917691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4099  lytic transglycosylase catalytic  34.29 
 
 		 230 aa  47  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4187  lytic transglycosylase, catalytic  31.88 
 
 		 166 aa  43.9  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.000629  decreased coverage  0.0000117899 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4182  lytic transglycosylase catalytic  32.38 
 
 		 230 aa  42.7  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0323  lytic transglycosylase catalytic  48.94 
 
 		 230 aa  42.4  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00170183 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>