More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA1174 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004311  BRA1174  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  100 
 
 		 289 aa  545  1e-154  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.431313  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7507  ABC transporter, permease protein  43.4 
 
 		 290 aa  210  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2538  inner-membrane translocator  42.31 
 
 		 285 aa  190  2e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00327311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4454  inner-membrane translocator  32.34 
 
 		 288 aa  99.4  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.242993  normal  0.0168386 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1865  inner-membrane translocator  29.33 
 
 		 294 aa  90.1  3e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0056  ABC transporter, permease protein  31.14 
 
 		 292 aa  89.7  6e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0055  ABC transporter, permease protein  31.5 
 
 		 292 aa  89.4  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2666  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein, putative  31.14 
 
 		 292 aa  89  9e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.953803  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1839  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  31.14 
 
 		 292 aa  89  9e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2713  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  31.14 
 
 		 292 aa  89  9e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3288  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  31.14 
 
 		 292 aa  89  9e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6117  branched chain amino acid ABC transporter permease  28.62 
 
 		 291 aa  84.7  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.139466 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0478  inner-membrane translocator  31.21 
 
 		 290 aa  84  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.164888  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0048  branched chain amino acid ABC transporter permease  31.62 
 
 		 264 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4820  inner-membrane translocator  30.9 
 
 		 290 aa  82  0.000000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0225289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0268  branched chain amino acid ABC transporter permease  30.83 
 
 		 264 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1651  inner-membrane translocator  25.17 
 
 		 291 aa  78.2  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3415  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  24.2 
 
 		 297 aa  77.4  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3508  inner-membrane translocator  25.52 
 
 		 297 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.771205  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3135  inner-membrane translocator  25.52 
 
 		 297 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.85693 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0528  inner-membrane translocator  24.32 
 
 		 292 aa  77  0.0000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00118598  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2112  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  26.45 
 
 		 291 aa  76.3  0.0000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1258  inner-membrane translocator  25.91 
 
 		 291 aa  74.7  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.241594  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4711  inner-membrane translocator  29.12 
 
 		 292 aa  73.6  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1849  inner-membrane translocator  28.42 
 
 		 291 aa  73.6  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.425483  normal  0.118432 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3104  inner-membrane translocator  26.62 
 
 		 293 aa  72.8  0.000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1003  inner-membrane translocator  28.32 
 
 		 290 aa  72.8  0.000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2366  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  27.46 
 
 		 299 aa  72.4  0.000000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00045769  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1558  inner-membrane translocator  27.05 
 
 		 297 aa  72.4  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1833  inner-membrane translocator  24.48 
 
 		 297 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.576158  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4177  inner-membrane translocator  27.4 
 
 		 297 aa  70.5  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2753  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  26.81 
 
 		 290 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0110353  normal  0.248126 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4070  inner-membrane translocator  28.46 
 
 		 295 aa  70.5  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0271  inner-membrane translocator  25.59 
 
 		 319 aa  70.1  0.00000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.297409  normal  0.531451 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1862  inner-membrane translocator  27.43 
 
 		 294 aa  70.1  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.513545  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4017  inner-membrane translocator  29.53 
 
 		 697 aa  70.1  0.00000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5834  inner-membrane translocator  27.76 
 
 		 290 aa  69.3  0.00000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00317168 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5695  inner-membrane translocator  28.76 
 
 		 290 aa  69.3  0.00000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00418313 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3687  inner-membrane translocator  28.74 
 
 		 291 aa  68.9  0.00000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1423  inner-membrane translocator  25.61 
 
 		 290 aa  68.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.36442  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000402  High-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein LivH  24.83 
 
 		 297 aa  68.6  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.721803  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4573  inner-membrane translocator  25.78 
 
 		 301 aa  67.8  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2609  inner-membrane translocator  23.13 
 
 		 297 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1822  inner-membrane translocator  27.24 
 
 		 294 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5716  putative high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  26.87 
 
 		 297 aa  67  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.010418  normal  0.660211 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1568  inner-membrane translocator  25.78 
 
 		 297 aa  67  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.308629  normal  0.422459 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0110  inner-membrane translocator  27.84 
 
 		 295 aa  65.9  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.185553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0550  inner-membrane translocator  30.89 
 
 		 293 aa  65.9  0.0000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.255736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1838  inner-membrane translocator  28.48 
 
 		 290 aa  65.9  0.0000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3867  inner-membrane translocator  29.41 
 
 		 704 aa  65.1  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.318133 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4415  inner-membrane translocator  27.39 
 
 		 309 aa  65.1  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.550314  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43530  amino acid ABC transporter-like protein  31.94 
 
 		 293 aa  65.5  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0533478  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0367  inner-membrane translocator  25.45 
 
 		 291 aa  65.5  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000622442  unclonable  0.0000000514338 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3056  inner-membrane translocator  25.34 
 
 		 292 aa  65.5  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2239  inner-membrane translocator  26.15 
 
 		 293 aa  64.3  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0505  inner-membrane translocator  23.83 
 
 		 293 aa  64.3  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0978839  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1046  inner-membrane translocator  25.65 
 
 		 289 aa  64.3  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.316666 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1483  inner-membrane translocator  27.97 
 
 		 295 aa  63.9  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2362  inner-membrane translocator  25.52 
 
 		 291 aa  63.9  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.016238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4796  inner-membrane translocator  26.37 
 
 		 290 aa  63.9  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.212285  normal  0.40666 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2989  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  29.73 
 
 		 293 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.115957  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2113  inner-membrane translocator  29.73 
 
 		 302 aa  62.8  0.000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.216632  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2545  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  28.79 
 
 		 293 aa  62.8  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.281842  normal  0.322886 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2705  inner-membrane translocator  27.39 
 
 		 289 aa  62.4  0.000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.787107 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2006  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  25 
 
 		 288 aa  62.4  0.000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.766894  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0298  inner-membrane translocator  25.45 
 
 		 297 aa  62  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0907201  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4242  inner-membrane translocator  28.4 
 
 		 292 aa  62.4  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0892  inner-membrane translocator  26.22 
 
 		 290 aa  61.6  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7078  putative high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein livH  29.34 
 
 		 292 aa  61.6  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.666733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2952  ABC transporter related  30.5 
 
 		 930 aa  62  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1742  inner-membrane translocator  28.4 
 
 		 292 aa  60.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0350501  normal  0.0888724 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2136  ABC transporter related protein  28.18 
 
 		 908 aa  61.2  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.135271 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1733  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  25.11 
 
 		 294 aa  60.5  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.293981  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3859  ABC transporter related protein  26.14 
 
 		 924 aa  60.5  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4737  ABC transporter related  29.32 
 
 		 940 aa  60.1  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3499  inner-membrane translocator  25.52 
 
 		 291 aa  60.1  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0481  branched chain amino acid ABC transporter permease  22.92 
 
 		 292 aa  60.1  0.00000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0290  inner-membrane translocator  27.39 
 
 		 306 aa  60.5  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3492  inner-membrane translocator  28.63 
 
 		 293 aa  59.7  0.00000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2082  inner-membrane translocator  28.07 
 
 		 289 aa  59.7  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.936766  normal  0.326487 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3800  inner-membrane translocator  28.63 
 
 		 293 aa  59.7  0.00000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.469116  normal  0.955686 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2768  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein, putative  29.08 
 
 		 293 aa  59.3  0.00000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0848238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2986  inner-membrane translocator  29.08 
 
 		 293 aa  59.3  0.00000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.286251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3749  inner-membrane translocator  25.86 
 
 		 295 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1862  inner-membrane translocator  24.91 
 
 		 297 aa  58.9  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.57457  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4940  inner-membrane translocator  27.43 
 
 		 291 aa  58.2  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4564  ABC transporter related  28.38 
 
 		 989 aa  58.5  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43770  inner-membrane translocator  27.89 
 
 		 293 aa  58.5  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.150883  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0998  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  26.79 
 
 		 289 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.301783  normal  0.758902 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0686  inner-membrane translocator  27.3 
 
 		 294 aa  58.2  0.0000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.215766  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1408  inner-membrane translocator  27.64 
 
 		 317 aa  58.9  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.616079  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1721  inner-membrane translocator  24.83 
 
 		 290 aa  58.5  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.021923  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3292  hypothetical protein  27.12 
 
 		 301 aa  58.5  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00518243 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2739  inner-membrane translocator  22.18 
 
 		 290 aa  57.4  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1979  putative branched-chain amino acid transport system / permease component  31.17 
 
 		 305 aa  57.8  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.571034 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2164  inner-membrane translocator  29.09 
 
 		 289 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.402468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0350  inner-membrane translocator  29.77 
 
 		 292 aa  57.8  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.018915  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2555  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  26.85 
 
 		 293 aa  58.2  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.1036  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3874  inner-membrane translocator  27.42 
 
 		 293 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.160659 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4925  inner-membrane translocator  24.66 
 
 		 293 aa  57.8  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0402653  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>