More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3874 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_3874  inner-membrane translocator  100 
 
 		 293 aa  555  1e-157  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.160659 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3800  inner-membrane translocator  97.27 
 
 		 293 aa  546  1e-154  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.469116  normal  0.955686 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3492  inner-membrane translocator  97.27 
 
 		 293 aa  546  1e-154  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2545  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  78.84 
 
 		 293 aa  451  1.0000000000000001e-126  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.281842  normal  0.322886 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0550  inner-membrane translocator  74.4 
 
 		 293 aa  409  1e-113  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.255736  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2768  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein, putative  73.72 
 
 		 293 aa  395  1e-109  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0848238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2986  inner-membrane translocator  74.06 
 
 		 293 aa  396  1e-109  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.286251  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2989  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  72.7 
 
 		 293 aa  393  1e-108  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.115957  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43530  amino acid ABC transporter-like protein  74.4 
 
 		 293 aa  390  1e-107  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0533478  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43770  inner-membrane translocator  73.04 
 
 		 293 aa  384  1e-106  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.150883  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2749  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein, putative  69.97 
 
 		 293 aa  381  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0611972  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7157  ABC transporter membrane spanning protein (branched chain amino acid)  67.24 
 
 		 293 aa  383  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.751279  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3004  inner-membrane translocator  69.28 
 
 		 293 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.961727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4297  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  65.75 
 
 		 296 aa  358  9e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.315349  decreased coverage  0.00178163 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1437  inner-membrane translocator  65.53 
 
 		 297 aa  357  9.999999999999999e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.522267  hitchhiker  0.00000379274 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5147  ABC transporter membrane spanning protein (branched chain amino acid)  63.92 
 
 		 299 aa  343  2e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.117358  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0251  inner-membrane translocator  60.53 
 
 		 304 aa  322  4e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.477771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2723  inner-membrane translocator  59.15 
 
 		 304 aa  312  4.999999999999999e-84  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.956007  normal  0.40389 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5008  inner-membrane translocator  54.84 
 
 		 309 aa  308  6.999999999999999e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0216  inner-membrane translocator  57.57 
 
 		 304 aa  307  1.0000000000000001e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3609  inner-membrane translocator  53.55 
 
 		 309 aa  302  5.000000000000001e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.566086 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0262  inner-membrane translocator  57.24 
 
 		 304 aa  296  4e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0785  inner-membrane translocator  54.19 
 
 		 309 aa  293  2e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1157  inner-membrane translocator  54.19 
 
 		 309 aa  286  2e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0376  high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein livH  51.7 
 
 		 329 aa  285  5e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.262788  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3363  inner-membrane translocator  52.1 
 
 		 309 aa  284  1.0000000000000001e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0568  putative branched-chain amino acid transport system permease  55.02 
 
 		 310 aa  281  1e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.451582  normal  0.0433103 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0468  inner-membrane translocator  53.87 
 
 		 309 aa  280  2e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0918895  normal  0.15939 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0459  inner-membrane translocator  53.87 
 
 		 309 aa  280  3e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.575619  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0115  inner-membrane translocator  48.76 
 
 		 328 aa  277  1e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.342029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2219  inner-membrane translocator  51.55 
 
 		 329 aa  273  3e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.515204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0050  inner-membrane translocator  50 
 
 		 326 aa  273  3e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.681115 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5037  inner-membrane translocator  55.59 
 
 		 315 aa  271  8.000000000000001e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.941694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2277  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  51.86 
 
 		 329 aa  270  2e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.750282  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0952  inner-membrane translocator  51.86 
 
 		 329 aa  270  2e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.778848 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3436  inner-membrane translocator  53.82 
 
 		 309 aa  268  5.9999999999999995e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00170509 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0602  inner-membrane translocator  53.82 
 
 		 309 aa  268  1e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.650417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4006  inner-membrane translocator  48.92 
 
 		 328 aa  266  2e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3540  inner-membrane translocator  52.9 
 
 		 309 aa  263  3e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.740436  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1596  inner-membrane translocator  43.64 
 
 		 292 aa  172  5e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2283  inner-membrane translocator  35.33 
 
 		 295 aa  172  6.999999999999999e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3508  inner-membrane translocator  36.43 
 
 		 297 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.771205  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0298  inner-membrane translocator  34.36 
 
 		 297 aa  157  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0907201  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000402  High-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein LivH  33.56 
 
 		 297 aa  157  2e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.721803  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2609  inner-membrane translocator  32.99 
 
 		 297 aa  156  4e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5288  inner-membrane translocator  40.96 
 
 		 295 aa  154  1e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.653195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1423  inner-membrane translocator  35.27 
 
 		 290 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.36442  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3415  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  31.99 
 
 		 297 aa  153  2.9999999999999998e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1833  inner-membrane translocator  32.65 
 
 		 297 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.576158  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3135  inner-membrane translocator  31.96 
 
 		 297 aa  152  8e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.85693 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_816  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.35 
 
 		 294 aa  150  2e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.648564  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0945  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein, putative  34.35 
 
 		 294 aa  150  3e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.501106  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4177  inner-membrane translocator  33.68 
 
 		 297 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0829  inner-membrane translocator  33.67 
 
 		 294 aa  146  4.0000000000000006e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5716  putative high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  32.31 
 
 		 297 aa  145  5e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.010418  normal  0.660211 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4573  inner-membrane translocator  32.3 
 
 		 301 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2307  inner-membrane translocator  35.34 
 
 		 297 aa  142  6e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00760667 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3841  inner-membrane translocator  37.41 
 
 		 294 aa  140  3e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00122547  normal  0.924093 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1568  inner-membrane translocator  31.62 
 
 		 297 aa  140  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.308629  normal  0.422459 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1558  inner-membrane translocator  31.96 
 
 		 297 aa  138  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2362  inner-membrane translocator  35.37 
 
 		 291 aa  138  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.016238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1862  inner-membrane translocator  34.02 
 
 		 297 aa  136  3.0000000000000003e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.57457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0402  inner-membrane translocator  36.43 
 
 		 296 aa  136  4e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4940  inner-membrane translocator  32.53 
 
 		 291 aa  133  3.9999999999999996e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3499  inner-membrane translocator  32.53 
 
 		 291 aa  132  6e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2444  inner-membrane translocator  35 
 
 		 304 aa  132  6e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1544  inner-membrane translocator  37.04 
 
 		 297 aa  130  2.0000000000000002e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0346312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3831  inner-membrane translocator  35.94 
 
 		 296 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4095  inner-membrane translocator  36.52 
 
 		 294 aa  129  6e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0271  inner-membrane translocator  28.43 
 
 		 319 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.297409  normal  0.531451 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4711  inner-membrane translocator  31.03 
 
 		 292 aa  128  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1288  inner-membrane translocator  28.8 
 
 		 309 aa  127  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6490  inner-membrane translocator  33.22 
 
 		 291 aa  125  7e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0479005  normal  0.485877 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2105  inner-membrane translocator  28.43 
 
 		 309 aa  125  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0624  inner-membrane translocator  37.01 
 
 		 293 aa  125  1e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.568796  normal  0.149845 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0544  inner-membrane translocator  40.54 
 
 		 293 aa  125  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5101  inner-membrane translocator  34.92 
 
 		 603 aa  125  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.208256  normal  0.176436 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3208  inner-membrane translocator  29.13 
 
 		 309 aa  124  2e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.805935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2534  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  34.92 
 
 		 603 aa  124  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1892  branched-chain amino acid AbC-type transport system permease  29.24 
 
 		 308 aa  124  2e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.339228  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0137  inner-membrane translocator  36.67 
 
 		 302 aa  124  2e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0892  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 290 aa  124  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3584  inner-membrane translocator  34.58 
 
 		 603 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3936  inner-membrane translocator  34.58 
 
 		 603 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.240526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0686  inner-membrane translocator  31.4 
 
 		 294 aa  122  5e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.215766  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3836  inner-membrane translocator  32.28 
 
 		 289 aa  122  6e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2429  inner-membrane translocator  28.48 
 
 		 300 aa  122  7e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.614779  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7078  putative high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein livH  29.33 
 
 		 292 aa  122  7e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.666733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5318  inner-membrane translocator  34.58 
 
 		 603 aa  122  7e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0891799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3029  inner-membrane translocator  34.34 
 
 		 296 aa  122  9e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.120738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6586  inner-membrane translocator  32.54 
 
 		 291 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.788549  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3172  inner-membrane translocator  28.12 
 
 		 309 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.538875  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3660  inner-membrane translocator  31.97 
 
 		 287 aa  119  6e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.741665  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1838  inner-membrane translocator  33.44 
 
 		 290 aa  119  7e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3796  inner-membrane translocator  28.16 
 
 		 309 aa  118  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2164  inner-membrane translocator  32.51 
 
 		 289 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.402468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1123  putative amino-acid transmembrane ABC transporter protein  30.52 
 
 		 335 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.121709  normal  0.109582 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5994  branched chain amino acid ABC transporter permease  31.96 
 
 		 290 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0717664 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1875  inner-membrane translocator  27.18 
 
 		 309 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.152214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3535  inner-membrane translocator  27.99 
 
 		 291 aa  117  3e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.152281  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>