More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1126 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_1126  DNA polymerase III gamma/tau subunits-like protein  100 
 
 
261 aa  520  1e-146  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000650925  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1692  DNA polymerase III, gamma/tau subunits  32.87 
 
 
321 aa  87.4  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000100228  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20360  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.97 
 
 
326 aa  82.4  0.000000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0056  DNA polymerase III, delta prime subunit  26.16 
 
 
324 aa  82  0.000000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.907797  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3154  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.79 
 
 
320 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000590012  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0159  DNA polymerase III, delta prime subunit  37.23 
 
 
322 aa  80.1  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1947  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.43 
 
 
331 aa  79.7  0.00000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.497646  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1058  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.67 
 
 
320 aa  79.3  0.00000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000154633 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4275  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.06 
 
 
354 aa  79  0.00000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0379488 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0515  DNA-directed DNA polymerase  34.81 
 
 
320 aa  79  0.00000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0983279  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2319  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.09 
 
 
318 aa  78.6  0.00000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.247884  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3205  DNA polymerase III, delta prime subunit  32 
 
 
320 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0191854  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0038  DNA-directed DNA polymerase  30.97 
 
 
320 aa  76.6  0.0000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2230  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.34 
 
 
323 aa  76.3  0.0000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.688016  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0789  DNA-directed DNA polymerase  34.31 
 
 
326 aa  76.3  0.0000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0791  DNA polymerase III, delta prime subunit  23.75 
 
 
340 aa  76.6  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0060  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.88 
 
 
335 aa  76.3  0.0000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0492451  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3588  DNA polymerase III, delta prime subunit  40 
 
 
351 aa  74.7  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0043  DNA-directed DNA polymerase  22.35 
 
 
284 aa  74.7  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000856784 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0511  DNA polymerase III, delta prime subunit  28.35 
 
 
343 aa  73.9  0.000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1664  DNA polymerase III, delta prime subunit  28.96 
 
 
327 aa  74.3  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.988179  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0156  DNA polymerase III, delta prime subunit  36.19 
 
 
335 aa  72.4  0.000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.986059 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2105  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.91 
 
 
329 aa  72.4  0.000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000107011  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2589  DNA polymerase III, delta prime subunit  26.45 
 
 
344 aa  72  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000288191 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1360  DNA polymerase III, delta prime subunit  41.77 
 
 
345 aa  72  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0505  DNA-directed DNA polymerase  30.3 
 
 
308 aa  70.9  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0042  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.33 
 
 
320 aa  71.2  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0152578  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0518  DNA-directed DNA polymerase  30.3 
 
 
308 aa  70.9  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0375901  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0122  DNA polymerase III, delta prime subunit, putative  27.78 
 
 
308 aa  70.5  0.00000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6483  DNA-directed DNA polymerase  31.21 
 
 
298 aa  70.5  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3913  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.97 
 
 
330 aa  70.1  0.00000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_476  DNA-directed DNA polymerase, delta prime subunit  26.94 
 
 
339 aa  70.1  0.00000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1175  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  31.47 
 
 
520 aa  68.9  0.00000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0027  DNA polymerase III subunit delta'  28.28 
 
 
337 aa  68.2  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2444  DNA polymerase III subunit delta'  28.42 
 
 
307 aa  67.8  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2290  DNA polymerase III, delta prime subunit, putative  21.69 
 
 
286 aa  67.4  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0473  DNA polymerase III subunits gamma and tau  28.31 
 
 
560 aa  66.6  0.0000000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5416  DNA polymerase III, delta prime subunit  28.68 
 
 
373 aa  67  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.141757  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1091  DNA-directed DNA polymerase  30.07 
 
 
389 aa  66.2  0.0000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1146  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.07 
 
 
383 aa  66.2  0.0000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.651472  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3206  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.86 
 
 
332 aa  66.2  0.0000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0025  DNA polymerase III subunit delta'  29.5 
 
 
330 aa  65.9  0.0000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0535  DNA polymerase III, delta prime subunit  27.32 
 
 
339 aa  65.5  0.0000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0101  DNA polymerase III, delta prime subunit  27.61 
 
 
358 aa  65.5  0.0000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.307739  unclonable  0.000000000342072 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2759  DNA polymerase III subunit delta'  27.89 
 
 
307 aa  64.7  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0459  DNA polymerase III subunit delta'  30.21 
 
 
290 aa  64.3  0.000000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1593  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.61 
 
 
336 aa  63.9  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.273592  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1924  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.07 
 
 
305 aa  63.9  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0669  DNA polymerase III subunit gamma/tau  28.29 
 
 
509 aa  63.2  0.000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0775  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  28.29 
 
 
509 aa  63.2  0.000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.275781  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3744  DNA polymerase III, gamma/tau subunit  29.27 
 
 
715 aa  62.8  0.000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0177  DNA polymerase III, delta prime subunit, putative  21.33 
 
 
296 aa  62.8  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0037  DNA polymerase III, delta prime subunit  27.4 
 
 
338 aa  62.8  0.000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.418255  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0093  DNA polymerase III subunit delta'  33.57 
 
 
326 aa  62.8  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1255  DNA polymerase III subunit gamma/tau  32.14 
 
 
526 aa  62.8  0.000000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1557  DNA polymerase III subunits gamma and tau  29.34 
 
 
543 aa  62.4  0.000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.311213  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2266  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.46 
 
 
312 aa  62.4  0.000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.727593  normal  0.54059 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2451  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.33 
 
 
318 aa  62  0.000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.135157  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0245  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  31.21 
 
 
478 aa  62  0.000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1189  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.96 
 
 
366 aa  62  0.000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1961  DNA polymerase III, delta prime subunit  26.62 
 
 
359 aa  62  0.000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.617101  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0243  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  31.21 
 
 
478 aa  62  0.000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0030  DNA-directed DNA polymerase  32.85 
 
 
499 aa  62  0.000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00564849  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1893  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.33 
 
 
318 aa  62  0.000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0485573 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1584  DNA polymerase III subunit delta'  34.09 
 
 
340 aa  61.6  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000282591  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1367  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  31.47 
 
 
501 aa  61.6  0.00000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2647  DNA-directed DNA polymerase  31.96 
 
 
304 aa  61.2  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.11798 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18481  DNA polymerase, gamma and tau subunits  28.78 
 
 
586 aa  62  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1629  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.7 
 
 
336 aa  62  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000209012  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2458  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.33 
 
 
318 aa  61.2  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.022565  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18671  DNA polymerase, gamma and tau subunits  28.78 
 
 
584 aa  61.2  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.181287  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1692  DNA polymerase III subunit delta'  34.09 
 
 
340 aa  61.6  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0197649  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3492  DNA polymerase III subunit delta'  34.09 
 
 
335 aa  61.6  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000181629  normal  0.0164304 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0411  DNA polymerase III gamma/tau subunits-like protein  36 
 
 
272 aa  60.8  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2802  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  30.88 
 
 
556 aa  60.8  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2671  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  30.88 
 
 
556 aa  60.8  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1085  DNA polymerase III subunits gamma and tau  27.72 
 
 
714 aa  61.2  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1750  DNA polymerase III, tau subunit  29.5 
 
 
579 aa  61.2  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00401811  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1418  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  31.39 
 
 
602 aa  60.5  0.00000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.733892 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1912  DNA polymerase III subunit delta'  32.95 
 
 
335 aa  60.5  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000735581  hitchhiker  0.00000697955 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2571  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.33 
 
 
318 aa  60.5  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.196352  normal  0.086607 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0374  DNA replication ATPase  36.17 
 
 
285 aa  60.5  0.00000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.885704  hitchhiker  0.00000094265 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0277  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  27.97 
 
 
517 aa  60.1  0.00000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.433516  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2612  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.68 
 
 
318 aa  59.7  0.00000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0529  DNA-directed DNA polymerase  27.14 
 
 
696 aa  59.7  0.00000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.000000000324921  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0061  DNA-directed DNA polymerase  27.59 
 
 
282 aa  60.1  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.639704  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0985  DNA polymerase III gamma/tau subunits-like protein  40.24 
 
 
382 aa  60.1  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3646  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  30.71 
 
 
743 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.923315  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1825  DNA polymerase III subunits gamma and tau  30.71 
 
 
736 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1805  DNA polymerase III subunits gamma and tau  30.71 
 
 
696 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0331  hypothetical protein  41.1 
 
 
629 aa  59.7  0.00000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.517311 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4930  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  42.47 
 
 
621 aa  59.7  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.522711  normal  0.575314 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1738  DNA polymerase III, gamma subunit / DNA polymerase III, tau subunit  29.79 
 
 
605 aa  59.7  0.00000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0751015  normal  0.0509359 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1397  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  32.21 
 
 
460 aa  59.3  0.00000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.610857  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1737  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.63 
 
 
318 aa  59.3  0.00000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.595933  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16180  DNA polymerase III, gamma/tau subunit  27.54 
 
 
373 aa  58.9  0.00000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000014932 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0603  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  28.17 
 
 
735 aa  58.9  0.00000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.705665 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1767  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.63 
 
 
318 aa  59.3  0.00000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.358719  normal  0.672365 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1662  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.63 
 
 
318 aa  58.9  0.00000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2078  DNA polymerase III subunit delta'  27.1 
 
 
358 aa  58.9  0.00000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>