116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1325 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_1325  roadblock/LC7 family protein  100 
 
 
230 aa  444  1.0000000000000001e-124  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.251377  normal  0.0893662 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0746  roadblock/LC7 family protein  51.72 
 
 
122 aa  112  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000852745 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3625  Roadblock/LC7 family protein  50 
 
 
122 aa  111  8.000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.3607  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0335  roadblock/LC7 family protein  51.72 
 
 
122 aa  110  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4464  roadblock/LC7 family protein  45.83 
 
 
122 aa  103  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000238567  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1488  roadblock/LC7 domain-contain protein  45.38 
 
 
120 aa  101  1e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000487371  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6136  hypothetical protein  43.31 
 
 
277 aa  100  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0160377 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0658  roadblock/LC7 family protein  45.38 
 
 
120 aa  100  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2108  roadblock/LC7 family protein  46.22 
 
 
120 aa  99.8  3e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.854145 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5249  Roadblock/LC7 family protein  46.02 
 
 
119 aa  99.8  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.955788  normal  0.810313 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2813  roadblock/LC7 family protein  45.38 
 
 
120 aa  97.4  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.581423  hitchhiker  0.00000177948 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2399  Roadblock/LC7 family protein  43.1 
 
 
122 aa  95.9  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.315858  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2208  Roadblock/LC7 family protein  44.54 
 
 
120 aa  93.6  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.518676  normal  0.172353 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2578  roadblock/LC7 domain protein  44.54 
 
 
120 aa  93.6  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0078  Roadblock/LC7 family protein  46.3 
 
 
119 aa  90.1  2e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.160642  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1333  Roadblock/LC7 family protein  45.37 
 
 
119 aa  89  5e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1029  roadblock/LC7 family protein  34.82 
 
 
114 aa  78.2  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0695  roadblock/LC7 family protein  37.39 
 
 
114 aa  76.3  0.0000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0367  roadblock/LC7 family protein  37.61 
 
 
134 aa  75.1  0.0000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.629911 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1692  roadblock/LC7 family protein  35.04 
 
 
114 aa  70.5  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0989  roadblock/LC7 family protein  35.04 
 
 
114 aa  70.5  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1016  roadblock/LC7 family protein  34.23 
 
 
114 aa  68.6  0.00000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0957  roadblock/LC7 family protein  33.33 
 
 
114 aa  65.1  0.000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2113  hypothetical protein  33.58 
 
 
143 aa  63.5  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2217  roadblock/LC7 domain-contain protein  35.83 
 
 
131 aa  63.9  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.129735  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3979  roadblock/LC7 family protein  32.33 
 
 
140 aa  63.9  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00192453 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0643  hypothetical protein  32.28 
 
 
140 aa  63.5  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.333346  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0565  Roadblock/LC7 family protein  34.04 
 
 
141 aa  63.5  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1789  hypothetical protein  35.43 
 
 
140 aa  63.5  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01810  hypothetical protein  30.99 
 
 
149 aa  61.6  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2813  Roadblock/LC7 family protein  34.23 
 
 
115 aa  60.5  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.798346  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37480  hypothetical protein  32.61 
 
 
138 aa  60.8  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.234785  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0311  Roadblock/LC7 family protein  31.65 
 
 
148 aa  59.7  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.311363  normal  0.0526059 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5991  roadblock/LC7 family protein  32.28 
 
 
140 aa  60.1  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0173553  normal  0.0311318 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0401  roadblock/LC7 domain protein  34.44 
 
 
136 aa  59.7  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34250  hypothetical protein  34.21 
 
 
139 aa  59.7  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.669608  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0773  roadblock/LC7 family protein  33.33 
 
 
119 aa  59.3  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.696919 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0033  roadblock/LC7 family protein  33.33 
 
 
119 aa  59.3  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1822  hypothetical protein  31.5 
 
 
140 aa  59.3  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.990156  normal  0.144641 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13400  hypothetical protein  32.77 
 
 
130 aa  58.9  0.00000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000448319  normal  0.0812473 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4223  roadblock/LC7 family protein  33.64 
 
 
115 aa  58.9  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0814  Roadblock/LC7 family protein  33.33 
 
 
133 aa  58.5  0.00000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0586657 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24600  hypothetical protein  30.7 
 
 
150 aa  58.2  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34280  hypothetical protein  33.64 
 
 
151 aa  57.8  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1537  roadblock/LC7 family protein  31.75 
 
 
129 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.383978 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0817  roadblock/LC7 family protein  33.61 
 
 
134 aa  57.4  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0878146 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0761  roadblock/LC7 family protein  33.61 
 
 
134 aa  57  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.635587  normal  0.018924 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0459  Roadblock/LC7 family protein  30.7 
 
 
139 aa  57.4  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3809  Roadblock/LC7 family protein  31.34 
 
 
136 aa  57  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0172  Roadblock/LC7 family protein  31.15 
 
 
149 aa  57.4  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.220534  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0941  hypothetical protein  31.75 
 
 
133 aa  57  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.247288  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3273  Roadblock/LC7 family protein  28.79 
 
 
143 aa  56.6  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5488  roadblock/LC7 family protein  29.86 
 
 
168 aa  56.6  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0729235  normal  0.262975 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06950  hypothetical protein  32.23 
 
 
138 aa  56.6  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.336684  normal  0.0389963 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0273  Roadblock/LC7 family protein  28.87 
 
 
149 aa  57  0.0000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.400039 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1290  roadblock/LC7 family protein  33.98 
 
 
139 aa  55.8  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.384978  hitchhiker  0.00358681 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7863  Roadblock/LC7 family protein  31.78 
 
 
142 aa  55.8  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.33246 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0971  roadblock/LC7 family protein  31.01 
 
 
139 aa  55.5  0.0000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.22997 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02260  hypothetical protein  30.6 
 
 
136 aa  55.5  0.0000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.591934 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1804  Roadblock/LC7 family protein  31.4 
 
 
135 aa  55.1  0.0000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00227476  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3338  Roadblock/LC7 family protein  33.91 
 
 
133 aa  55.1  0.0000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.643087  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2445  hypothetical protein  30.83 
 
 
146 aa  55.1  0.0000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.288681  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2446  Roadblock/LC7 family protein  38.68 
 
 
165 aa  55.1  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2067  Roadblock/LC7 family protein  30.25 
 
 
142 aa  54.3  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1809  hypothetical protein  30.71 
 
 
140 aa  55.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.976532 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1432  hypothetical protein  30.36 
 
 
149 aa  54.3  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.645173  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1190  roadblock/LC7 domain-contain protein  30.37 
 
 
138 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.831326  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1207  roadblock/LC7 family protein  30.37 
 
 
138 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.339186  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1217  roadblock/LC7 family protein  30.37 
 
 
138 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0700111 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3598  roadblock/LC7 family protein  30.65 
 
 
140 aa  54.3  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.741712 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5271  Roadblock/LC7 family protein  33.33 
 
 
139 aa  54.3  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5171  Roadblock/LC7 family protein  29.03 
 
 
147 aa  53.9  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3804  Roadblock/LC7 family protein  32.06 
 
 
141 aa  53.9  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2754  Roadblock/LC7 family protein  35.38 
 
 
134 aa  53.9  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.183617  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1515  Roadblock/LC7 family protein  31.67 
 
 
139 aa  54.3  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.767548  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0975  roadblock/LC7 family protein  32.28 
 
 
140 aa  53.1  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.448438  normal  0.236015 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2385  roadblock/LC7 family protein  31.09 
 
 
139 aa  52.8  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.519416  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3847  Roadblock/LC7 family protein  34.09 
 
 
142 aa  52.8  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.101468 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3174  Roadblock/LC7 family protein  30.77 
 
 
149 aa  52.8  0.000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0204902  normal  0.235677 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0155  roadblock/LC7 family protein  30.25 
 
 
135 aa  52.8  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.925276 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1006  roadblock/LC7 family protein  30.48 
 
 
115 aa  52  0.000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.428336  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2859  hypothetical protein  30.95 
 
 
139 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.816259  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1139  Roadblock/LC7 family protein  33.59 
 
 
141 aa  50.4  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0385251  normal  0.882845 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4888  roadblock/LC7 family protein  30.4 
 
 
137 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.629663  normal  0.016898 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2277  roadblock/LC7 family protein  27.78 
 
 
138 aa  49.7  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0893919  normal  0.104236 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0274  Roadblock/LC7 family protein  29.25 
 
 
148 aa  49.7  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3227  roadblock/LC7 family protein  30.83 
 
 
141 aa  49.3  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4815  Roadblock/LC7 family protein  31.25 
 
 
139 aa  49.3  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.966307  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0701  roadblock/LC7 family protein  30.3 
 
 
118 aa  48.9  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.716887  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1908  roadblock/LC7 family protein  31.37 
 
 
115 aa  49.3  0.00006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.129097  normal  0.495291 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0380  roadblock/LC7 family protein  27.64 
 
 
125 aa  48.5  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3874  roadblock/LC7 family protein  30.91 
 
 
135 aa  48.5  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.215093  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4265  roadblock/LC7 family protein  30.65 
 
 
135 aa  48.5  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.020013 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5417  Roadblock/LC7 family protein  31.68 
 
 
140 aa  48.1  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0357  hypothetical protein  27.83 
 
 
129 aa  47.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0225234  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2049  hypothetical protein  33.06 
 
 
140 aa  47  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0490  Roadblock/LC7 family protein  28.07 
 
 
141 aa  47.4  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0361  hypothetical protein  28.81 
 
 
135 aa  47.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0516364  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1146  Roadblock/LC7 family protein  32.86 
 
 
144 aa  47.4  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.410023  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5471  roadblock/LC7 family protein  32.22 
 
 
147 aa  46.2  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.886108  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>