102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_24600 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_24600  hypothetical protein  100 
 
 		 150 aa  297  3e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0459  Roadblock/LC7 family protein  80.3 
 
 		 139 aa  211  2.9999999999999995e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34250  hypothetical protein  77.44 
 
 		 139 aa  204  4e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.669608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5417  Roadblock/LC7 family protein  73.48 
 
 		 140 aa  193  6e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5171  Roadblock/LC7 family protein  66.91 
 
 		 147 aa  189  1e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34280  hypothetical protein  73.28 
 
 		 151 aa  187  2.9999999999999997e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5991  roadblock/LC7 family protein  70.23 
 
 		 140 aa  184  4e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0173553  normal  0.0311318 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0643  hypothetical protein  69.47 
 
 		 140 aa  183  7e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.333346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0817  roadblock/LC7 family protein  73.6 
 
 		 134 aa  180  5.0000000000000004e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0878146 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1822  hypothetical protein  70.54 
 
 		 140 aa  180  5.0000000000000004e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.990156  normal  0.144641 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5271  Roadblock/LC7 family protein  73.55 
 
 		 139 aa  179  1e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0761  roadblock/LC7 family protein  72.8 
 
 		 134 aa  178  2e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.635587  normal  0.018924 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1789  hypothetical protein  66.92 
 
 		 140 aa  177  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0971  roadblock/LC7 family protein  65.89 
 
 		 139 aa  174  3e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.22997 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7863  Roadblock/LC7 family protein  67.19 
 
 		 142 aa  172  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.33246 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1809  hypothetical protein  63.78 
 
 		 140 aa  171  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.976532 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0941  hypothetical protein  68.25 
 
 		 133 aa  170  5e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.247288  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0814  Roadblock/LC7 family protein  67.2 
 
 		 133 aa  170  5e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0586657 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1804  Roadblock/LC7 family protein  63.91 
 
 		 135 aa  168  2e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00227476  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0975  roadblock/LC7 family protein  65.97 
 
 		 140 aa  159  8.000000000000001e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.448438  normal  0.236015 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3874  roadblock/LC7 family protein  60.63 
 
 		 135 aa  154  4e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.215093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4265  roadblock/LC7 family protein  63.33 
 
 		 135 aa  154  4e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.020013 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1190  roadblock/LC7 domain-contain protein  55.12 
 
 		 138 aa  145  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.831326  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1207  roadblock/LC7 family protein  55.12 
 
 		 138 aa  145  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.339186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1217  roadblock/LC7 family protein  55.12 
 
 		 138 aa  145  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0700111 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1537  roadblock/LC7 family protein  57.98 
 
 		 129 aa  140  8e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.383978 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4888  roadblock/LC7 family protein  54.33 
 
 		 137 aa  135  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.629663  normal  0.016898 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13400  hypothetical protein  58.77 
 
 		 130 aa  135  2e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000448319  normal  0.0812473 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0172  Roadblock/LC7 family protein  48.87 
 
 		 149 aa  135  2e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.220534  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2277  roadblock/LC7 family protein  53.97 
 
 		 138 aa  134  6.0000000000000005e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0893919  normal  0.104236 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0273  Roadblock/LC7 family protein  47.37 
 
 		 149 aa  133  9e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.400039 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01810  hypothetical protein  44.9 
 
 		 149 aa  131  3e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3174  Roadblock/LC7 family protein  46.97 
 
 		 149 aa  129  1.0000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0204902  normal  0.235677 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2825  hypothetical protein  52.71 
 
 		 134 aa  129  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0311  Roadblock/LC7 family protein  45.86 
 
 		 148 aa  128  3e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.311363  normal  0.0526059 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1515  Roadblock/LC7 family protein  51.56 
 
 		 139 aa  126  9.000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.767548  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0490  Roadblock/LC7 family protein  49.21 
 
 		 141 aa  126  9.000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2385  roadblock/LC7 family protein  53.03 
 
 		 139 aa  126  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.519416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2859  hypothetical protein  51.52 
 
 		 139 aa  122  2e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.816259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5471  roadblock/LC7 family protein  44.53 
 
 		 147 aa  122  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.886108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4131  Roadblock/LC7 family protein  48.36 
 
 		 136 aa  119  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2113  hypothetical protein  44.92 
 
 		 143 aa  117  6e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2067  Roadblock/LC7 family protein  47.2 
 
 		 142 aa  117  6e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5184  Roadblock/LC7 family protein  46.97 
 
 		 145 aa  114  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3254  roadblock/LC7 family protein  49.59 
 
 		 139 aa  114  3.9999999999999997e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.238217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2049  hypothetical protein  45.45 
 
 		 140 aa  113  7.999999999999999e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3227  roadblock/LC7 family protein  45.97 
 
 		 141 aa  112  1.0000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0155  roadblock/LC7 family protein  43.31 
 
 		 135 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.925276 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37480  hypothetical protein  46.22 
 
 		 138 aa  110  5e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.234785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2845  Roadblock/LC7 family protein  48.25 
 
 		 137 aa  110  5e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.12388  normal  0.326627 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2445  hypothetical protein  43.2 
 
 		 146 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.288681  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3809  Roadblock/LC7 family protein  44.27 
 
 		 136 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0357  hypothetical protein  44.53 
 
 		 129 aa  108  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0225234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3691  Roadblock/LC7 family protein  47.06 
 
 		 131 aa  107  4.0000000000000004e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0125896  normal  0.658373 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3979  roadblock/LC7 family protein  48.76 
 
 		 140 aa  107  7.000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00192453 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1432  hypothetical protein  43.41 
 
 		 149 aa  105  1e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.645173  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0361  hypothetical protein  41.09 
 
 		 135 aa  106  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0516364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3315  Roadblock/LC7 family protein  49.61 
 
 		 145 aa  105  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5598  Roadblock/LC7 family protein  44.63 
 
 		 131 aa  105  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3598  roadblock/LC7 family protein  47.93 
 
 		 140 aa  105  3e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.741712 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3273  Roadblock/LC7 family protein  38.14 
 
 		 143 aa  104  5e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0277  Roadblock/LC7 family protein  45.61 
 
 		 151 aa  103  8e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.451236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3847  Roadblock/LC7 family protein  43.2 
 
 		 142 aa  102  3e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.101468 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1290  roadblock/LC7 family protein  43.33 
 
 		 139 aa  101  4e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.384978  hitchhiker  0.00358681 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3194  hypothetical protein  44.8 
 
 		 142 aa  101  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02260  hypothetical protein  42.28 
 
 		 136 aa  100  9e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.591934 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3804  Roadblock/LC7 family protein  42.19 
 
 		 141 aa  99.4  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0758  roadblock/LC7 family protein  41.79 
 
 		 136 aa  99.4  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3668  Roadblock/LC7 family protein  41.6 
 
 		 139 aa  96.3  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0812413  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4815  Roadblock/LC7 family protein  40.65 
 
 		 139 aa  95.5  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.966307  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0390  roadblock/LC7 family protein  43.94 
 
 		 136 aa  93.2  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0303496  normal  0.300284 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3338  Roadblock/LC7 family protein  43.09 
 
 		 133 aa  92.8  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.643087  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2446  Roadblock/LC7 family protein  36.72 
 
 		 165 aa  90.5  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2806  hypothetical protein  38.1 
 
 		 137 aa  89  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0542054  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5488  roadblock/LC7 family protein  37.6 
 
 		 168 aa  89  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0729235  normal  0.262975 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0700  roadblock/LC7 family protein  43.75 
 
 		 130 aa  88.6  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.428157  normal  0.14214 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2805  Roadblock/LC7 family protein  42.64 
 
 		 150 aa  88.6  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000122057  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06950  hypothetical protein  38.21 
 
 		 138 aa  87.4  6e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.336684  normal  0.0389963 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1139  Roadblock/LC7 family protein  38.79 
 
 		 141 aa  87  8e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0385251  normal  0.882845 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3053  Roadblock/LC7 family protein  49.55 
 
 		 144 aa  85.5  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.946669  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1146  Roadblock/LC7 family protein  38.52 
 
 		 144 aa  83.6  7e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.410023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3382  Roadblock/LC7 family protein  35.66 
 
 		 146 aa  82.8  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0893291  normal  0.993212 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2754  Roadblock/LC7 family protein  38.52 
 
 		 134 aa  80.1  0.000000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.183617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0738  Roadblock/LC7 family protein  33.85 
 
 		 140 aa  76.3  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2201  Roadblock/LC7 family protein  43.48 
 
 		 152 aa  75.5  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.590655  hitchhiker  0.000219247 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3125  hypothetical protein  32.58 
 
 		 143 aa  73.9  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.370766 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33560  hypothetical protein  38.05 
 
 		 131 aa  68.2  0.00000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0896592  normal  0.486704 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2533  Roadblock/LC7 family protein  37.1 
 
 		 133 aa  67.8  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4331  hypothetical protein  37.61 
 
 		 129 aa  67  0.00000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.925989 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1436  Roadblock/LC7 family protein  31.75 
 
 		 151 aa  64.3  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.594453  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1061  Roadblock/LC7 family protein  34.92 
 
 		 142 aa  63.5  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.678448 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0364  Roadblock/LC7 family protein  29.82 
 
 		 143 aa  62.8  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4181  Roadblock/LC7 family protein  29.6 
 
 		 136 aa  60.5  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.534028  normal  0.367859 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1325  roadblock/LC7 family protein  30.7 
 
 		 230 aa  58.5  0.00000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.251377  normal  0.0893662 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1908  roadblock/LC7 family protein  28.44 
 
 		 115 aa  47.4  0.00007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.129097  normal  0.495291 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0746  roadblock/LC7 family protein  32.63 
 
 		 122 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000852745 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2681  Roadblock/LC7 family protein  29.25 
 
 		 121 aa  42.7  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000022106 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0933  roadblock/LC7 family protein  31.43 
 
 		 121 aa  42  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0781277  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4464  roadblock/LC7 family protein  32.63 
 
 		 122 aa  42  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000238567  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4122  Roadblock/LC7 family protein  28.04 
 
 		 131 aa  41.6  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.881937  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>