95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4131 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_4131  Roadblock/LC7 family protein  100 
 
 
136 aa  273  5e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3691  Roadblock/LC7 family protein  71.88 
 
 
131 aa  184  5e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0125896  normal  0.658373 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2845  Roadblock/LC7 family protein  73.45 
 
 
137 aa  175  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.12388  normal  0.326627 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5598  Roadblock/LC7 family protein  66.4 
 
 
131 aa  171  3.9999999999999995e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5184  Roadblock/LC7 family protein  52 
 
 
145 aa  134  5e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5271  Roadblock/LC7 family protein  49.19 
 
 
139 aa  130  6e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3315  Roadblock/LC7 family protein  56.8 
 
 
145 aa  129  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0817  roadblock/LC7 family protein  49.6 
 
 
134 aa  128  2.0000000000000002e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0878146 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5991  roadblock/LC7 family protein  49.21 
 
 
140 aa  128  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0173553  normal  0.0311318 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0643  hypothetical protein  49.21 
 
 
140 aa  128  3e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.333346  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0761  roadblock/LC7 family protein  49.6 
 
 
134 aa  127  3e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.635587  normal  0.018924 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7863  Roadblock/LC7 family protein  44.19 
 
 
142 aa  124  6e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.33246 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5417  Roadblock/LC7 family protein  44.96 
 
 
140 aa  122  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0459  Roadblock/LC7 family protein  46.4 
 
 
139 aa  120  8e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3874  roadblock/LC7 family protein  46.15 
 
 
135 aa  119  9e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.215093  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24600  hypothetical protein  48.36 
 
 
150 aa  119  9.999999999999999e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4265  roadblock/LC7 family protein  47.2 
 
 
135 aa  118  3e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.020013 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34250  hypothetical protein  43.51 
 
 
139 aa  115  1.9999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.669608  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34280  hypothetical protein  42.31 
 
 
151 aa  114  3.9999999999999997e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0941  hypothetical protein  44.26 
 
 
133 aa  107  4.0000000000000004e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.247288  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1804  Roadblock/LC7 family protein  41.09 
 
 
135 aa  107  6e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00227476  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0814  Roadblock/LC7 family protein  44 
 
 
133 aa  107  8.000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0586657 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1809  hypothetical protein  37.4 
 
 
140 aa  106  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.976532 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1217  roadblock/LC7 family protein  40 
 
 
138 aa  106  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0700111 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1207  roadblock/LC7 family protein  40 
 
 
138 aa  106  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.339186  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1190  roadblock/LC7 domain-contain protein  40 
 
 
138 aa  106  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.831326  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5171  Roadblock/LC7 family protein  40.77 
 
 
147 aa  105  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1515  Roadblock/LC7 family protein  43.9 
 
 
139 aa  105  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.767548  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1822  hypothetical protein  38.93 
 
 
140 aa  105  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.990156  normal  0.144641 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1537  roadblock/LC7 family protein  41.8 
 
 
129 aa  105  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.383978 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13400  hypothetical protein  44.25 
 
 
130 aa  103  8e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000448319  normal  0.0812473 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0971  roadblock/LC7 family protein  35.34 
 
 
139 aa  103  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.22997 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1789  hypothetical protein  36.36 
 
 
140 aa  102  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3174  Roadblock/LC7 family protein  39.53 
 
 
149 aa  101  4e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0204902  normal  0.235677 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01810  hypothetical protein  40 
 
 
149 aa  100  5e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0273  Roadblock/LC7 family protein  39.17 
 
 
149 aa  100  7e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.400039 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0172  Roadblock/LC7 family protein  40 
 
 
149 aa  99.8  1e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.220534  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4888  roadblock/LC7 family protein  40.16 
 
 
137 aa  95.9  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.629663  normal  0.016898 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37480  hypothetical protein  36.15 
 
 
138 aa  95.1  3e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.234785  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0311  Roadblock/LC7 family protein  39.17 
 
 
148 aa  93.2  9e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.311363  normal  0.0526059 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3847  Roadblock/LC7 family protein  36.43 
 
 
142 aa  92.8  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.101468 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2385  roadblock/LC7 family protein  36.15 
 
 
139 aa  92.4  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.519416  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2049  hypothetical protein  33.82 
 
 
140 aa  91.7  3e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2277  roadblock/LC7 family protein  37.6 
 
 
138 aa  90.9  6e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0893919  normal  0.104236 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0975  roadblock/LC7 family protein  36.15 
 
 
140 aa  90.5  6e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.448438  normal  0.236015 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2859  hypothetical protein  36.92 
 
 
139 aa  90.5  8e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.816259  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3598  roadblock/LC7 family protein  36.89 
 
 
140 aa  87.8  5e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.741712 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2825  hypothetical protein  36.8 
 
 
134 aa  86.3  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4815  Roadblock/LC7 family protein  38.46 
 
 
139 aa  85.9  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.966307  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3809  Roadblock/LC7 family protein  36.51 
 
 
136 aa  85.5  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3254  roadblock/LC7 family protein  36.92 
 
 
139 aa  85.1  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.238217  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2806  hypothetical protein  38.28 
 
 
137 aa  85.1  3e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0542054  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5471  roadblock/LC7 family protein  35.77 
 
 
147 aa  84.3  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.886108  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3979  roadblock/LC7 family protein  34.35 
 
 
140 aa  83.6  9e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00192453 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1432  hypothetical protein  34.68 
 
 
149 aa  83.2  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.645173  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0758  roadblock/LC7 family protein  41.27 
 
 
136 aa  83.2  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0155  roadblock/LC7 family protein  32.8 
 
 
135 aa  82.4  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.925276 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2113  hypothetical protein  36.07 
 
 
143 aa  82.4  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0361  hypothetical protein  33.6 
 
 
135 aa  82.4  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0516364  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0357  hypothetical protein  34.13 
 
 
129 aa  82  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0225234  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2445  hypothetical protein  30.83 
 
 
146 aa  81.6  0.000000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.288681  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0490  Roadblock/LC7 family protein  30.47 
 
 
141 aa  80.9  0.000000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2067  Roadblock/LC7 family protein  34.38 
 
 
142 aa  80.5  0.000000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5488  roadblock/LC7 family protein  37.5 
 
 
168 aa  79.7  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0729235  normal  0.262975 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06950  hypothetical protein  36.03 
 
 
138 aa  79  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.336684  normal  0.0389963 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2201  Roadblock/LC7 family protein  41.18 
 
 
152 aa  79  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.590655  hitchhiker  0.000219247 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0277  Roadblock/LC7 family protein  33.33 
 
 
151 aa  79  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.451236  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1290  roadblock/LC7 family protein  35.77 
 
 
139 aa  77.8  0.00000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.384978  hitchhiker  0.00358681 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2754  Roadblock/LC7 family protein  35.16 
 
 
134 aa  75.9  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.183617  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3668  Roadblock/LC7 family protein  31.78 
 
 
139 aa  73.2  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0812413  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1146  Roadblock/LC7 family protein  39.84 
 
 
144 aa  73.2  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.410023  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0700  roadblock/LC7 family protein  42.62 
 
 
130 aa  72  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.428157  normal  0.14214 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3227  roadblock/LC7 family protein  35.83 
 
 
141 aa  72.4  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1139  Roadblock/LC7 family protein  35.66 
 
 
141 aa  72.8  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0385251  normal  0.882845 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0390  roadblock/LC7 family protein  35.16 
 
 
136 aa  70.9  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0303496  normal  0.300284 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3194  hypothetical protein  31.97 
 
 
142 aa  71.2  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3273  Roadblock/LC7 family protein  31.15 
 
 
143 aa  69.3  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2533  Roadblock/LC7 family protein  37.1 
 
 
133 aa  68.9  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02260  hypothetical protein  30.33 
 
 
136 aa  67.4  0.00000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.591934 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3125  hypothetical protein  30.33 
 
 
143 aa  66.2  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.370766 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3338  Roadblock/LC7 family protein  29.51 
 
 
133 aa  65.1  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.643087  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3804  Roadblock/LC7 family protein  30.53 
 
 
141 aa  65.1  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2446  Roadblock/LC7 family protein  30.25 
 
 
165 aa  63.5  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4331  hypothetical protein  33.59 
 
 
129 aa  63.5  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.925989 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1061  Roadblock/LC7 family protein  34.4 
 
 
142 aa  62.4  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.678448 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3382  Roadblock/LC7 family protein  32.5 
 
 
146 aa  62  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0893291  normal  0.993212 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2805  Roadblock/LC7 family protein  31.45 
 
 
150 aa  60.5  0.000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000122057  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0364  Roadblock/LC7 family protein  29.6 
 
 
143 aa  58.9  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0738  Roadblock/LC7 family protein  27.59 
 
 
140 aa  57.8  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3053  Roadblock/LC7 family protein  31.53 
 
 
144 aa  49.7  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.946669  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1436  Roadblock/LC7 family protein  27.34 
 
 
151 aa  45.1  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.594453  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33560  hypothetical protein  30.84 
 
 
131 aa  44.3  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0896592  normal  0.486704 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5249  Roadblock/LC7 family protein  32.17 
 
 
119 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.955788  normal  0.810313 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1325  roadblock/LC7 family protein  30.84 
 
 
230 aa  42.4  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.251377  normal  0.0893662 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2399  Roadblock/LC7 family protein  31.9 
 
 
122 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.315858  normal  0.818253 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>