77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_5249 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_5249  Roadblock/LC7 family protein  100 
 
 
119 aa  233  5.0000000000000005e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.955788  normal  0.810313 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2399  Roadblock/LC7 family protein  92.44 
 
 
122 aa  219  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.315858  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1029  roadblock/LC7 family protein  62.5 
 
 
114 aa  147  6e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2813  roadblock/LC7 family protein  53.91 
 
 
120 aa  130  6.999999999999999e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.581423  hitchhiker  0.00000177948 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0746  roadblock/LC7 family protein  56.19 
 
 
122 aa  122  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000852745 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0335  roadblock/LC7 family protein  55.24 
 
 
122 aa  118  3e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3625  Roadblock/LC7 family protein  51.35 
 
 
122 aa  117  7e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.3607  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4464  roadblock/LC7 family protein  52.38 
 
 
122 aa  114  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000238567  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0658  roadblock/LC7 family protein  46.09 
 
 
120 aa  110  8.000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2578  roadblock/LC7 domain protein  46.09 
 
 
120 aa  108  2.0000000000000002e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2208  Roadblock/LC7 family protein  46.09 
 
 
120 aa  108  2.0000000000000002e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.518676  normal  0.172353 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2108  roadblock/LC7 family protein  46.09 
 
 
120 aa  108  2.0000000000000002e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.854145 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1488  roadblock/LC7 domain-contain protein  44.64 
 
 
120 aa  107  6e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000487371  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1325  roadblock/LC7 family protein  45.3 
 
 
230 aa  100  5e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.251377  normal  0.0893662 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1333  Roadblock/LC7 family protein  44.83 
 
 
119 aa  97.8  4e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0078  Roadblock/LC7 family protein  45.05 
 
 
119 aa  97.8  4e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.160642  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6136  hypothetical protein  41.96 
 
 
277 aa  87  8e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0160377 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0367  roadblock/LC7 family protein  36.75 
 
 
134 aa  70.1  0.000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.629911 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0695  roadblock/LC7 family protein  32.74 
 
 
114 aa  67.4  0.00000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1016  roadblock/LC7 family protein  33.98 
 
 
114 aa  66.2  0.0000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0565  Roadblock/LC7 family protein  32.22 
 
 
141 aa  61.2  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0401  roadblock/LC7 domain protein  32.22 
 
 
136 aa  61.2  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1692  roadblock/LC7 family protein  32.04 
 
 
114 aa  60.8  0.000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0989  roadblock/LC7 family protein  32.04 
 
 
114 aa  60.8  0.000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0957  roadblock/LC7 family protein  32.04 
 
 
114 aa  60.1  0.000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3912  roadblock/LC7 family protein  31.53 
 
 
130 aa  55.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3233  roadblock/LC7 family protein  33.03 
 
 
123 aa  55.5  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.589466 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4311  Roadblock/LC7 family protein  29.46 
 
 
426 aa  51.2  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0380  roadblock/LC7 family protein  24.32 
 
 
125 aa  51.2  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7712  hypothetical protein  35.85 
 
 
126 aa  50.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.891873 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1515  Roadblock/LC7 family protein  34.48 
 
 
139 aa  49.7  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.767548  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0459  Roadblock/LC7 family protein  32.79 
 
 
139 aa  50.1  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0273  Roadblock/LC7 family protein  28.93 
 
 
149 aa  48.1  0.00004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.400039 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37480  hypothetical protein  27.83 
 
 
138 aa  48.1  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.234785  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5417  Roadblock/LC7 family protein  32.77 
 
 
140 aa  47.8  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3668  Roadblock/LC7 family protein  33.33 
 
 
139 aa  47.8  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0812413  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34250  hypothetical protein  31.97 
 
 
139 aa  47  0.00008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.669608  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1789  hypothetical protein  33.06 
 
 
140 aa  47  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0814  Roadblock/LC7 family protein  32.11 
 
 
133 aa  46.6  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0586657 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0311  Roadblock/LC7 family protein  30.25 
 
 
148 aa  46.6  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.311363  normal  0.0526059 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1432  hypothetical protein  28.95 
 
 
149 aa  46.6  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.645173  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1132  Roadblock/LC7 family protein  31.93 
 
 
118 aa  46.2  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0172  Roadblock/LC7 family protein  28.1 
 
 
149 aa  45.8  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.220534  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0357  hypothetical protein  26.32 
 
 
129 aa  45.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0225234  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01810  hypothetical protein  28.23 
 
 
149 aa  45.4  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0254  roadblock/LC7 family protein  31.73 
 
 
125 aa  45.1  0.0003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1137  roadblock/LC7 family protein  26.09 
 
 
293 aa  45.1  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.634686  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4094  Roadblock/LC7 family protein  29.35 
 
 
168 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0643  hypothetical protein  30.43 
 
 
140 aa  45.1  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.333346  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4131  Roadblock/LC7 family protein  32.17 
 
 
136 aa  43.9  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5171  Roadblock/LC7 family protein  30.51 
 
 
147 aa  43.9  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0738  Roadblock/LC7 family protein  29.57 
 
 
140 aa  43.9  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0941  hypothetical protein  30.28 
 
 
133 aa  43.1  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.247288  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3174  Roadblock/LC7 family protein  28.57 
 
 
149 aa  43.1  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0204902  normal  0.235677 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4331  hypothetical protein  28.45 
 
 
129 aa  43.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.925989 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2446  Roadblock/LC7 family protein  29.06 
 
 
165 aa  42.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06950  hypothetical protein  27.59 
 
 
138 aa  42.7  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.336684  normal  0.0389963 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0971  roadblock/LC7 family protein  30.58 
 
 
139 aa  42  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.22997 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3804  Roadblock/LC7 family protein  26.89 
 
 
141 aa  42  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1822  hypothetical protein  27.83 
 
 
140 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.990156  normal  0.144641 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5991  roadblock/LC7 family protein  29.57 
 
 
140 aa  41.6  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0173553  normal  0.0311318 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3847  Roadblock/LC7 family protein  28.93 
 
 
142 aa  41.2  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.101468 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1908  roadblock/LC7 family protein  28.85 
 
 
115 aa  41.6  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.129097  normal  0.495291 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0155  roadblock/LC7 family protein  28.95 
 
 
135 aa  41.6  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.925276 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4265  roadblock/LC7 family protein  29.06 
 
 
135 aa  41.6  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.020013 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2217  roadblock/LC7 domain-contain protein  27.03 
 
 
131 aa  41.6  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.129735  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3874  roadblock/LC7 family protein  29.06 
 
 
135 aa  41.6  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.215093  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0108  roadblock/LC7 family protein  29.91 
 
 
117 aa  41.6  0.004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0102077 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7863  Roadblock/LC7 family protein  30.51 
 
 
142 aa  41.2  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.33246 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2385  roadblock/LC7 family protein  30.7 
 
 
139 aa  41.2  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.519416  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3254  roadblock/LC7 family protein  28.07 
 
 
139 aa  41.2  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.238217  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1006  roadblock/LC7 family protein  27.17 
 
 
115 aa  40.8  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.428336  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3053  Roadblock/LC7 family protein  32.5 
 
 
144 aa  40.8  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.946669  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2445  hypothetical protein  29.2 
 
 
146 aa  40.4  0.007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.288681  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2859  hypothetical protein  29.82 
 
 
139 aa  40.4  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.816259  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3338  Roadblock/LC7 family protein  29.82 
 
 
133 aa  40.4  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.643087  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2681  Roadblock/LC7 family protein  28.44 
 
 
121 aa  40.4  0.009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000022106 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>