49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0957 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0957  roadblock/LC7 family protein  100 
 
 		 114 aa  223  5.0000000000000005e-58  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0989  roadblock/LC7 family protein  97.37 
 
 		 114 aa  216  7e-56  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1692  roadblock/LC7 family protein  97.37 
 
 		 114 aa  216  7e-56  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1016  roadblock/LC7 family protein  94.74 
 
 		 114 aa  212  9.999999999999999e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0695  roadblock/LC7 family protein  82.46 
 
 		 114 aa  194  3e-49  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0033  roadblock/LC7 family protein  43.24 
 
 		 119 aa  95.5  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0773  roadblock/LC7 family protein  43.24 
 
 		 119 aa  95.5  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.696919 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2813  Roadblock/LC7 family protein  38.74 
 
 		 115 aa  88.2  4e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.798346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4223  roadblock/LC7 family protein  39.64 
 
 		 115 aa  87  8e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1488  roadblock/LC7 domain-contain protein  39.47 
 
 		 120 aa  83.2  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000487371  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2813  roadblock/LC7 family protein  39.29 
 
 		 120 aa  78.2  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.581423  hitchhiker  0.00000177948 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1006  roadblock/LC7 family protein  34.78 
 
 		 115 aa  78.2  0.00000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.428336  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0658  roadblock/LC7 family protein  37.5 
 
 		 120 aa  76.3  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1908  roadblock/LC7 family protein  33.91 
 
 		 115 aa  75.5  0.0000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.129097  normal  0.495291 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2108  roadblock/LC7 family protein  36.61 
 
 		 120 aa  72.8  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.854145 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2208  Roadblock/LC7 family protein  36.61 
 
 		 120 aa  70.9  0.000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.518676  normal  0.172353 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2578  roadblock/LC7 domain protein  36.61 
 
 		 120 aa  70.9  0.000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0746  roadblock/LC7 family protein  33.63 
 
 		 122 aa  67  0.00000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000852745 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1325  roadblock/LC7 family protein  33.33 
 
 		 230 aa  65.9  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.251377  normal  0.0893662 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4464  roadblock/LC7 family protein  33.66 
 
 		 122 aa  63.5  0.0000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000238567  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0335  roadblock/LC7 family protein  33.01 
 
 		 122 aa  63.2  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0078  Roadblock/LC7 family protein  31.48 
 
 		 119 aa  61.6  0.000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.160642  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1333  Roadblock/LC7 family protein  30.56 
 
 		 119 aa  60.5  0.000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5249  Roadblock/LC7 family protein  32.04 
 
 		 119 aa  60.1  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.955788  normal  0.810313 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1376  Roadblock/LC7 family protein  35.34 
 
 		 117 aa  59.3  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0196587 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2399  Roadblock/LC7 family protein  31.07 
 
 		 122 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.315858  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1029  roadblock/LC7 family protein  28.3 
 
 		 114 aa  56.2  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0367  roadblock/LC7 family protein  32.22 
 
 		 134 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.629911 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1151  Roadblock/LC7 family protein  34.45 
 
 		 117 aa  54.7  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.210812 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2155  Roadblock/LC7 family protein  32.5 
 
 		 125 aa  53.9  0.0000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0830  roadblock/LC7 domain-contain protein  30.63 
 
 		 224 aa  52.8  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0276652 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0380  roadblock/LC7 family protein  29.46 
 
 		 125 aa  51.2  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1132  Roadblock/LC7 family protein  32.08 
 
 		 118 aa  51.2  0.000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6136  hypothetical protein  25.89 
 
 		 277 aa  49.7  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160377 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3912  roadblock/LC7 family protein  29.9 
 
 		 130 aa  48.5  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0933  roadblock/LC7 family protein  30.63 
 
 		 121 aa  45.4  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0781277  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2475  hypothetical protein  28.95 
 
 		 258 aa  45.1  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2067  Roadblock/LC7 family protein  31.25 
 
 		 142 aa  44.7  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2681  Roadblock/LC7 family protein  28.85 
 
 		 121 aa  43.9  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000022106 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3598  roadblock/LC7 family protein  29.46 
 
 		 140 aa  43.5  0.0008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.741712 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2113  hypothetical protein  27.36 
 
 		 143 aa  43.5  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02260  hypothetical protein  29.82 
 
 		 136 aa  43.1  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.591934 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37480  hypothetical protein  27.68 
 
 		 138 aa  43.1  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.234785  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3273  Roadblock/LC7 family protein  29.25 
 
 		 143 aa  42.7  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3343  roadblock/LC7 family protein  29.2 
 
 		 263 aa  43.5  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0155  roadblock/LC7 family protein  31.86 
 
 		 135 aa  42.4  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.925276 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3142  roadblock/LC7 family protein  27.43 
 
 		 265 aa  41.2  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0277  Roadblock/LC7 family protein  32.14 
 
 		 151 aa  40.8  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.451236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0216  roadblock/LC7 family protein  39.13 
 
 		 90 aa  40.4  0.009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>