38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2475 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2475  hypothetical protein  100 
 
 		 258 aa  525  1e-148  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3343  roadblock/LC7 family protein  60.89 
 
 		 263 aa  293  3e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3142  roadblock/LC7 family protein  56.22 
 
 		 265 aa  285  5e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0829  hypothetical protein  25.56 
 
 		 237 aa  67  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0182058 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2773  roadblock/LC7 family protein  25.73 
 
 		 235 aa  63.5  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.993837  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1908  roadblock/LC7 family protein  34.95 
 
 		 115 aa  60.8  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.129097  normal  0.495291 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2951  roadblock/LC7 family protein  26.28 
 
 		 243 aa  59.3  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.430877  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2641  hypothetical protein  25.14 
 
 		 244 aa  57  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0599  response regulator receiver protein  31.25 
 
 		 488 aa  56.6  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0607  response regulator receiver protein  31.25 
 
 		 488 aa  56.2  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0572  response regulator receiver domain-containing protein  31.25 
 
 		 488 aa  56.2  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0316  hypothetical protein  23.38 
 
 		 231 aa  55.8  0.0000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.456761  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1006  roadblock/LC7 family protein  32.69 
 
 		 115 aa  53.5  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.428336  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0309  hypothetical protein  29.89 
 
 		 480 aa  52  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0615  response regulator receiver protein  32.29 
 
 		 485 aa  50.4  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2199  cyclic nucleotide-binding protein  33.72 
 
 		 357 aa  49.7  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2681  Roadblock/LC7 family protein  26.79 
 
 		 121 aa  48.5  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000022106 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3829  response regulator receiver protein  30.09 
 
 		 713 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0106552  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0906  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 244 aa  47.4  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000149961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1651  response regulator receiver protein  29.59 
 
 		 528 aa  47  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.887196  normal  0.351448 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2371  cyclic nucleotide-binding protein  25.81 
 
 		 387 aa  47  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3746  response regulator receiver protein  30.09 
 
 		 714 aa  47  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.374039  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1070  hypothetical protein  26.73 
 
 		 274 aa  46.6  0.0004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000000185263  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4338  hypothetical protein  29.73 
 
 		 267 aa  46.2  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.187272  normal  0.143255 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0201  hypothetical protein  29.46 
 
 		 268 aa  45.8  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.440947 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0933  roadblock/LC7 family protein  27.18 
 
 		 121 aa  46.2  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0781277  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0957  roadblock/LC7 family protein  28.95 
 
 		 114 aa  45.1  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3688  response regulator receiver domain-containing protein  29.2 
 
 		 718 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0343  hypothetical protein  24.24 
 
 		 246 aa  45.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000523116  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0695  roadblock/LC7 family protein  30.1 
 
 		 114 aa  45.4  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0989  roadblock/LC7 family protein  28.07 
 
 		 114 aa  43.9  0.003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1692  roadblock/LC7 family protein  28.07 
 
 		 114 aa  43.9  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0930  hypothetical protein  31.71 
 
 		 268 aa  43.9  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.745999  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1950  hypothetical protein  27.91 
 
 		 190 aa  42.7  0.006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3814  response regulator receiver protein  34.29 
 
 		 735 aa  42.7  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.706947  hitchhiker  0.0056347 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1151  Roadblock/LC7 family protein  27.88 
 
 		 117 aa  42.4  0.007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.210812 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1376  Roadblock/LC7 family protein  25.96 
 
 		 117 aa  42.4  0.008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0196587 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1020  hypothetical protein  24.04 
 
 		 99 aa  42  0.009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0409339  hitchhiker  0.000000330929 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>