41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2773 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_2773  roadblock/LC7 family protein  100 
 
 		 235 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.993837  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2951  roadblock/LC7 family protein  35.96 
 
 		 243 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.430877  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2641  hypothetical protein  36.68 
 
 		 244 aa  150  2e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0316  hypothetical protein  35.96 
 
 		 231 aa  144  8.000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.456761  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0829  hypothetical protein  36.05 
 
 		 237 aa  131  9e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0182058 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0343  hypothetical protein  33.88 
 
 		 246 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000523116  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0316  pentapeptide repeat-containing protein  36.89 
 
 		 384 aa  72  0.000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0069  hypothetical protein  33.33 
 
 		 371 aa  70.1  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.568066  normal  0.0454782 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3343  roadblock/LC7 family protein  25.87 
 
 		 263 aa  67  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1651  response regulator receiver protein  32.35 
 
 		 528 aa  65.9  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.887196  normal  0.351448 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4648  response regulator receiver protein  32.74 
 
 		 253 aa  64.3  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.485097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2475  hypothetical protein  25.73 
 
 		 258 aa  63.5  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1048  response regulator receiver protein  29.81 
 
 		 814 aa  61.6  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6888  response regulator receiver protein  31.62 
 
 		 875 aa  60.1  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.3668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5179  TonB family protein  36.17 
 
 		 558 aa  59.3  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3814  response regulator receiver protein  34.33 
 
 		 735 aa  58.5  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.706947  hitchhiker  0.0056347 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3829  response regulator receiver protein  32.84 
 
 		 713 aa  57  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0106552  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3746  response regulator receiver protein  32.84 
 
 		 714 aa  57.4  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.374039  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3688  response regulator receiver domain-containing protein  32.84 
 
 		 718 aa  57.4  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4227  FHA domain containing protein  32.73 
 
 		 308 aa  55.1  0.0000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.208424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0309  hypothetical protein  28.4 
 
 		 480 aa  55.1  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0607  response regulator receiver protein  31.58 
 
 		 488 aa  54.7  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6827  response regulator receiver protein  33.98 
 
 		 389 aa  53.9  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0615  response regulator receiver protein  29.36 
 
 		 485 aa  53.1  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0599  response regulator receiver protein  30.7 
 
 		 488 aa  53.5  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0572  response regulator receiver domain-containing protein  30.7 
 
 		 488 aa  52.8  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3142  roadblock/LC7 family protein  26.85 
 
 		 265 aa  52.4  0.000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1070  hypothetical protein  29.29 
 
 		 274 aa  50.4  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000000185263  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1938  response regulator receiver protein  25 
 
 		 244 aa  50.1  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1665  hypothetical protein  26.85 
 
 		 465 aa  47.8  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.719067  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2199  cyclic nucleotide-binding protein  26.61 
 
 		 357 aa  47.4  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1701  hypothetical protein  24.47 
 
 		 468 aa  47.4  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4338  hypothetical protein  28.83 
 
 		 267 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.187272  normal  0.143255 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2678  hypothetical protein  26.56 
 
 		 266 aa  47  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000293714 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0930  hypothetical protein  25.4 
 
 		 268 aa  46.2  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.745999  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0201  hypothetical protein  28.83 
 
 		 268 aa  45.8  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.440947 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0148  hypothetical protein  34.29 
 
 		 248 aa  45.8  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0476  hypothetical protein  32.86 
 
 		 252 aa  45.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.163912  normal  0.583833 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0774  hypothetical protein  32.32 
 
 		 253 aa  43.9  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.774718 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1645  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  31.52 
 
 		 669 aa  43.5  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00749578 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0378  hypothetical protein  27.52 
 
 		 232 aa  42.7  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>