53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1048 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1048  response regulator receiver protein  100 
 
 		 814 aa  1674    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1938  response regulator receiver protein  39.64 
 
 		 244 aa  177  5e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1977  response regulator receiver protein  42.53 
 
 		 265 aa  174  7.999999999999999e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1260  response regulator receiver protein  29.13 
 
 		 331 aa  96.7  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.208704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6827  response regulator receiver protein  28.76 
 
 		 389 aa  89  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0049  response regulator receiver protein  24 
 
 		 226 aa  72.8  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2773  roadblock/LC7 family protein  30 
 
 		 235 aa  66.2  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.993837  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0343  hypothetical protein  27.54 
 
 		 246 aa  65.5  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000523116  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0316  pentapeptide repeat-containing protein  27.92 
 
 		 384 aa  64.3  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4648  response regulator receiver protein  28.98 
 
 		 253 aa  63.2  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.485097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0829  hypothetical protein  29.6 
 
 		 237 aa  62  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0182058 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2641  hypothetical protein  29.46 
 
 		 244 aa  56.6  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2951  roadblock/LC7 family protein  26.61 
 
 		 243 aa  56.6  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.430877  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1651  response regulator receiver protein  28.21 
 
 		 528 aa  55.8  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.887196  normal  0.351448 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3814  response regulator receiver protein  23.96 
 
 		 735 aa  54.7  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.706947  hitchhiker  0.0056347 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0069  hypothetical protein  28.04 
 
 		 371 aa  51.6  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.568066  normal  0.0454782 
 
 
-
 
NC_002620  TC0753  sigma-54 dependent response regulator  33.33 
 
 		 387 aa  50.4  0.0001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6888  response regulator receiver protein  30.61 
 
 		 875 aa  50.1  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.3668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3111  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 458 aa  49.3  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5179  TonB family protein  26.04 
 
 		 558 aa  48.9  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0344  two component Fis family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 452 aa  48.9  0.0004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0882822  normal  0.355114 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3829  response regulator receiver protein  21.58 
 
 		 713 aa  48.9  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0106552  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1577  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  32.2 
 
 		 458 aa  48.5  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3688  response regulator receiver domain-containing protein  21.58 
 
 		 718 aa  48.5  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3746  response regulator receiver protein  21.58 
 
 		 714 aa  47.8  0.0007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.374039  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2658  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  33.05 
 
 		 458 aa  47.4  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1287  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  28.18 
 
 		 452 aa  47  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.541874  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2510  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  29.91 
 
 		 472 aa  47.4  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0791346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0821  response regulator receiver modulated FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.2 
 
 		 1139 aa  47.4  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.187038 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2034  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 449 aa  47.4  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0792682  normal  0.101595 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0886  response regulator receiver protein  28.57 
 
 		 207 aa  46.6  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2693  response regulator  27.93 
 
 		 128 aa  46.6  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3108  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 461 aa  45.8  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3268  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 483 aa  45.8  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.474695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0572  response regulator receiver domain-containing protein  26.67 
 
 		 488 aa  45.8  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1319  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  29.91 
 
 		 452 aa  45.8  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0607  response regulator receiver protein  26.67 
 
 		 488 aa  46.2  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0316  hypothetical protein  26.32 
 
 		 231 aa  45.4  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.456761  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1288  putative lipoprotein  27.5 
 
 		 325 aa  45.4  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.571416  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0085  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  28.7 
 
 		 738 aa  45.1  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.127866 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0168  protein of unknown function DUF1566  34.48 
 
 		 333 aa  44.7  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.409063  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0590  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  30.97 
 
 		 440 aa  45.1  0.006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1307  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  27.94 
 
 		 299 aa  45.1  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.244131  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0799  response regulator receiver protein  26.96 
 
 		 225 aa  44.7  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4227  FHA domain containing protein  31.68 
 
 		 308 aa  44.7  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.208424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2006  putative lipoprotein  26.75 
 
 		 301 aa  44.7  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.47311 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0599  response regulator receiver protein  25.93 
 
 		 488 aa  44.7  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0846  response regulator receiver protein  26.96 
 
 		 225 aa  44.3  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2539  response regulator receiver protein  29.07 
 
 		 130 aa  44.7  0.008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.745401  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1430  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.23 
 
 		 737 aa  44.3  0.009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.224344 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0238  multi-component transcriptional regulator  24.17 
 
 		 1629 aa  44.3  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2384  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.57 
 
 		 590 aa  44.3  0.01  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00194573 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1163  response regulator receiver and unknown domain protein  28.93 
 
 		 231 aa  44.3  0.01  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>