40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0829 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_0829  hypothetical protein  100 
 
 		 237 aa  474  1e-133  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0182058 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2641  hypothetical protein  64.49 
 
 		 244 aa  318  5e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2951  roadblock/LC7 family protein  51.27 
 
 		 243 aa  231  6e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.430877  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0343  hypothetical protein  48.75 
 
 		 246 aa  211  7e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000523116  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0316  hypothetical protein  40 
 
 		 231 aa  175  6e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.456761  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2773  roadblock/LC7 family protein  36.05 
 
 		 235 aa  146  3e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.993837  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1651  response regulator receiver protein  36.04 
 
 		 528 aa  71.2  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.887196  normal  0.351448 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2475  hypothetical protein  25.68 
 
 		 258 aa  67  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0069  hypothetical protein  35.85 
 
 		 371 aa  67  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.568066  normal  0.0454782 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0316  pentapeptide repeat-containing protein  33.33 
 
 		 384 aa  63.9  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1938  response regulator receiver protein  32.43 
 
 		 244 aa  63.2  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0607  response regulator receiver protein  34.82 
 
 		 488 aa  62.4  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0615  response regulator receiver protein  34.34 
 
 		 485 aa  60.8  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0599  response regulator receiver protein  33.93 
 
 		 488 aa  61.2  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0572  response regulator receiver domain-containing protein  33.04 
 
 		 488 aa  60.1  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3343  roadblock/LC7 family protein  24.59 
 
 		 263 aa  59.3  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0378  hypothetical protein  31.43 
 
 		 232 aa  58.9  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4648  response regulator receiver protein  29.81 
 
 		 253 aa  58.2  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.485097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3829  response regulator receiver protein  32.69 
 
 		 713 aa  57.4  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0106552  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3746  response regulator receiver protein  32.69 
 
 		 714 aa  57.4  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.374039  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3814  response regulator receiver protein  33.96 
 
 		 735 aa  57  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.706947  hitchhiker  0.0056347 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3688  response regulator receiver domain-containing protein  32.69 
 
 		 718 aa  57  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0309  hypothetical protein  28 
 
 		 480 aa  56.6  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1048  response regulator receiver protein  27.88 
 
 		 814 aa  56.2  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4227  FHA domain containing protein  30.69 
 
 		 308 aa  54.7  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.208424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3142  roadblock/LC7 family protein  23.16 
 
 		 265 aa  55.1  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6827  response regulator receiver protein  33.01 
 
 		 389 aa  53.1  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6888  response regulator receiver protein  31.13 
 
 		 875 aa  53.1  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.3668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2199  cyclic nucleotide-binding protein  26.67 
 
 		 357 aa  50.1  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2678  hypothetical protein  33.67 
 
 		 266 aa  48.9  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000293714 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2371  cyclic nucleotide-binding protein  25 
 
 		 387 aa  46.2  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1950  hypothetical protein  35 
 
 		 190 aa  45.4  0.0007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5179  TonB family protein  29.7 
 
 		 558 aa  44.3  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1070  hypothetical protein  26.53 
 
 		 274 aa  44.3  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000000185263  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4950  hypothetical protein  27.78 
 
 		 248 aa  43.9  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0525  hypothetical protein  27.72 
 
 		 113 aa  43.9  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6642  hypothetical protein  30.12 
 
 		 306 aa  43.1  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187032 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1701  hypothetical protein  21.88 
 
 		 468 aa  42.7  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0148  hypothetical protein  36.21 
 
 		 248 aa  42  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2413  hypothetical protein  31.03 
 
 		 209 aa  42  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.567371  normal  0.121567 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>