36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0316 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0316  hypothetical protein  100 
 
 		 231 aa  474  1e-133  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.456761  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2951  roadblock/LC7 family protein  38.52 
 
 		 243 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.430877  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2641  hypothetical protein  39.66 
 
 		 244 aa  167  9e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0829  hypothetical protein  40 
 
 		 237 aa  158  8e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0182058 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2773  roadblock/LC7 family protein  35.96 
 
 		 235 aa  144  8.000000000000001e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.993837  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0343  hypothetical protein  37.71 
 
 		 246 aa  142  4e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000523116  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1651  response regulator receiver protein  35.64 
 
 		 528 aa  70.1  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.887196  normal  0.351448 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0316  pentapeptide repeat-containing protein  33.01 
 
 		 384 aa  65.5  0.0000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0069  hypothetical protein  35.05 
 
 		 371 aa  65.5  0.0000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.568066  normal  0.0454782 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0309  hypothetical protein  25.19 
 
 		 480 aa  61.2  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6888  response regulator receiver protein  29.05 
 
 		 875 aa  59.3  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.3668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0607  response regulator receiver protein  32.35 
 
 		 488 aa  58.9  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1701  hypothetical protein  25.25 
 
 		 468 aa  57  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4648  response regulator receiver protein  29.77 
 
 		 253 aa  57.4  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.485097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0599  response regulator receiver protein  31.37 
 
 		 488 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6827  response regulator receiver protein  32.08 
 
 		 389 aa  57.4  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0572  response regulator receiver domain-containing protein  31.37 
 
 		 488 aa  56.6  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2475  hypothetical protein  23.38 
 
 		 258 aa  55.8  0.0000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0615  response regulator receiver protein  30.39 
 
 		 485 aa  55.1  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3142  roadblock/LC7 family protein  28.8 
 
 		 265 aa  53.9  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5179  TonB family protein  31.25 
 
 		 558 aa  52  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1665  hypothetical protein  22.63 
 
 		 465 aa  51.2  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.719067  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3829  response regulator receiver protein  30.07 
 
 		 713 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0106552  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3814  response regulator receiver protein  31.62 
 
 		 735 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.706947  hitchhiker  0.0056347 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3746  response regulator receiver protein  29.37 
 
 		 714 aa  48.9  0.00006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.374039  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3688  response regulator receiver domain-containing protein  29.37 
 
 		 718 aa  48.9  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4227  FHA domain containing protein  26.92 
 
 		 308 aa  47  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.208424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0906  response regulator receiver protein  28.46 
 
 		 244 aa  47.8  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000149961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1938  response regulator receiver protein  21.24 
 
 		 244 aa  47.4  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2199  cyclic nucleotide-binding protein  25.66 
 
 		 357 aa  46.2  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3343  roadblock/LC7 family protein  28.57 
 
 		 263 aa  46.2  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2371  cyclic nucleotide-binding protein  25.47 
 
 		 387 aa  46.2  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0525  hypothetical protein  29.79 
 
 		 113 aa  45.4  0.0007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1070  hypothetical protein  21.57 
 
 		 274 aa  42.7  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000000185263  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1048  response regulator receiver protein  26 
 
 		 814 aa  42.7  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0148  hypothetical protein  31.58 
 
 		 248 aa  42  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>